Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469808
- Subject:
- XM_006531733.3
- Aligned Length:
- 1928
- Identities:
- 1486
- Gaps:
- 316
Alignment
Query 1 ATGGCGACCGGAGCGAACGCCACGCCGTTGGACTTCCCAAGTAAGAAGCGGAAGAGGAGCCGCTGGAACCAAGA 74
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGACCGGAGCGAACGCCACGCCGCTGGACTTCCCAAGTAAGAAGAGGAAGAGGAGCCGATGGAACCAAGA 74
Query 75 CACAATGGAACAGAAGACAGTGATTCCAGGAATGCCTACAGTTATTCCCCCTGGACTTACTCGAGAACAAGAAA 148
|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 75 CACAATGGAGCAGAAGACAGTGATTCCAGGCATGCCTACAGTTATACCCCCTGGACTGACTCGGGAACAGGAAA 148
Query 149 GAGCTTATATAGTGCAACTGCAGATAGAAGACCTGACTCGTAAACTGCGCACAGGAGACCTGGGCATCCCCCCT 222
|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GAGCTTACATAGTGCAACTACAGATAGAAGACCTGACTCGTAAACTGCGCACAGGAGACCTGGGCATCCCCCCT 222
Query 223 AACCCTGAGGACAGGTCCCCTTCCCCTGAGCCCATCTACAATAGCGAGGGGAAGCGGCTTAACACCCGAGAGTT 296
|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 223 AACCCTGAGGACAGGTCCCCTTCCCCTGAACCAATCTACAACAGCGAGGGGAAGCGGCTTAACACTCGAGAGTT 296
Query 297 CCGCACCCGCAAAAAGCTGGAAGAGGAGCGGCACAACCTCATCACAGAGATGGTTGCACTCAATCCGGATTTCA 370
|||.||||||||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 297 CCGTACCCGCAAAAAGCTTGAAGAGGAGCGGCACACCCTTATTACAGAGATGGTTGCTCTCAACCCAGACTTTA 370
Query 371 AGCCACCTGCAGATTACAAACCTCCAGCAACACGTGTGAGTGATAAAGTCATGATTCCACAAGATGAGTACCCA 444
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||
Sbjct 371 AACCACCTGCAGATTACAAGCCTCCAGCAACACGTGTGAGCGATAAAGTAATGATCCCCCAAGACGAATATCCA 444
Query 445 GAAATCAACTTTGTGGGGCTGCTCATCGGGCCCAGAGGGAACACCCTGAAGAACATAGAGAAGGAGTGCAATGC 518
||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 445 GAAATCAATTTTGTGGGGCTCCTAATTGGACCCAGAGGGAACACCCTGAAGAACATTGAGAAGGAATGCAACGC 518
Query 519 CAAGATTATGATCCGGGGGAAAGGGTCTGTGAAAGAAGGGAAGGTTGGGCGCAAAGATGGCCAGATGTTGCCAG 592
||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 519 CAAGATCATGATTCGGGGGAAAGGATCAGTGAAAGAAGGGAAAGTTGGGCGTAAAGATGGTCAGATGTTGCCAG 592
Query 593 GAGAAGATGAGCCACTTCATGCCCTGGTTACTGCCAATACAATGGAGAACGTCAAAAAGGCAGTGGAACAGATA 666
|.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 593 GCGAAGATGAGCCTCTTCATGCTCTAGTCACTGCCAATACGATGGAGAATGTCAAAAAGGCAGTAGAACAGATC 666
Query 667 AGAAACATCCTGAAGCAGGGTATCGAGACTCCAGAGGACCAGAATGATCTACGGAAGATGCAGCTTCGGGAGTT 740
|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 667 AGAAACATCCTGAAGCAGGGTATTGAGACCCCAGAGGACCAGAACGATCTACGGAAAATGCAGCTTCGAGAGTT 740
Query 741 GGCTCGCTTAAATGGGACCCTTCGGGAAGACGATAACAGGATCTTAAGACCCTGGCAGAGCTCAGAGACCCGCA 814
|||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 GGCTCGCTTGAATGGCACTCTACGGGAAGATGATAATAGGATCTTAAGGCCCTGGCAGAGCTCAGAGACGCGCA 814
Query 815 GCATTACCAACACCACAGTGTGTACCAAGTGTGGAGGGGCTGGCCACATTGCTTCAGACTGTAAATTCCAAAGG 888
||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||
Sbjct 815 GCATTACCAATACTACTGTGTGTACCAAGTGTGGAGGGGCTGGTCACATTGCTTCTGATTGCAAATTTCAGAGG 888
Query 889 CCTGGTGATCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGGATAAAGAATATTTGTCCCTCATGGCTGAACTGGG 962
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 889 CCTGGCGACCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGGATAAAGAATATTTGTCCCTTATGGCTGAGCTAGG 962
Query 963 TGAAGCACCTGTCCCAGCATCTGTGGGCTCCACCTCTGGGCCTGCCACCACACCCCTGGCCAGCGCACCTCGTC 1036
.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||..|.|
Sbjct 963 GGAAGCTCCTGTCCCTGCATCTGTGGGCTCTACCTCTGGGCCTGCCACCACGCCCCTGGCTAGTGCACCAAGAC 1036
Query 1037 CTGCTGCTCCCGCCAACAACCCACCTCCACCGTCTCTCATGTCTACCACCCAGAGCCGCCCACCCTGGATGAAT 1110
||||||||||.||||.|||||||||.||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGCTGCTCCTGCCAGCAACCCACCACCACC---------------------GAGCCGCCCACCCTGGATGAAT 1089
Query 1111 TCTGGCCCTTCAGAGAGTCGGCCCTACCACGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTGGGCCCGGAGGTGGCCCCCA 1184
|||||.||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1090 TCTGGTCCTTCAGAGAATCGGCCCTACCATGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTGGTCCTGGAGGTGGCCCCCA 1163
Query 1185 CAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTGGGCATGGTGGACATCCCATGCAGCACAACCCCAATGGAC 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1164 CAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTGGGCATGGTGGGCATCCCATGCAGCACAACCCAAATGGAC 1237
Query 1259 CCCCACCCCCTTGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCCTCCTGGGCACCATGGCCCT 1332
|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1238 CACCACCACCTTGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCCACCTGGGCACCATGGCCCT 1311
Query 1333 CCTCCAATGGATCAGTACCTGGGAAGTACGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCCTGCATCAAGGAAAAGGTAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312 CCTCCAATGGATCAGTACCTGGGAAGTACGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCCTGCATCAAGGAAAAGGTAT 1385
Query 1407 GATGCCGCCACCACCTATGGGCATGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCCAGTGGGCAGCCCCCACCCCCTCCCT 1480
|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1386 GATGCCGCCGCCGCCTATGGGCATGATGCCGCCGCCTCCGCCACCTCCCAGTGGGCAGCCCCCGCCTCCTCCCT 1459
Query 1481 CTGGTCCTCTTCCCCCATGGCAACAACAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCCGCCCAGCAGCAGTATGGCT 1554
|||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1460 CTGGTCCTCTTCCTCCATGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCCGCCCAGCAGCAGTATGGCT 1533
Query 1555 TCCAGTACCCCCTTGCCATGGCAGCAAA----GA----TCCCTCCCCGCGGCGGCGATGG------------CC 1608
|||||.|||||||||||||||||||||| || |.||.||.|| .|||.||| ||
Sbjct 1534 TCCAGCACCCCCTTGCCATGGCAGCAAAATACGACGACTACCACCACG----AGCGCTGGCACAGGGTCCATCC 1603
Query 1609 CGAGCCATG-----AG----AGTGAGGACTTTCCGC-GC----CCATTGG------------------------ 1644
| |||||| || || |.|| .|.|||| || ||| ||
Sbjct 1604 C--GCCATGGCAACAGCAGCAG-GCGG--CTGCCGCAGCTTCTCCA--GGAACCCCTCAGATGCAAGGCAACCC 1670
Query 1645 -------------------------------------------------------------------------- 1644
Sbjct 1671 CACTATGGTGCCCCTGCCCCCCGGGGTCCAGCCGCCTCTGCCGCCCGGGGCCCCTCCCCCTCCGCCGCCTCCGC 1744
Query 1645 -------------------------------------------------------------------------- 1644
Sbjct 1745 CACCTGGTTCCGCCGGCATGATGTATGCCCCACCCCCTCCTCCTCCGCCTCCCATGGACCCTTCTAACTTTGTC 1818
Query 1645 -------------------------------------------------------------------------- 1644
Sbjct 1819 ACCATGATGGGCATGGGGGTGGCGGGCATGCCGCCCTTCGGGATGCCTCCAGCTCCCCCACCGCCTCCACCACA 1892
Query 1645 ---- 1644
Sbjct 1893 GAAC 1896