Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469808
- Subject:
- XM_006531736.1
- Aligned Length:
- 1928
- Identities:
- 1370
- Gaps:
- 433
Alignment
Query 1 ATGGCGACCGGAGCGAACGCCACGCCGTTGGACTTCCCAAGTAAGAAGCGGAAGAGGAGCCGCTGGAACCAAGA 74
.|||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------------------------------------ATGGAACCAAGA 12
Query 75 CACAATGGAACAGAAGACAGTGATTCCAGGAATGCCTACAGTTATTCCCCCTGGACTTACTCGAGAACAAGAAA 148
|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 13 CACAATGGAGCAGAAGACAGTGATTCCAGGCATGCCTACAGTTATACCCCCTGGACTGACTCGGGAACAGGAAA 86
Query 149 GAGCTTATATAGTGCAACTGCAGATAGAAGACCTGACTCGTAAACTGCGCACAGGAGACCTGGGCATCCCCCCT 222
|||||||.||
Sbjct 87 GAGCTTACAT---------------------------------------------------------------- 96
Query 223 AACCCTGAGGACAGGTCCCCTTCCCCTGAGCCCATCTACAATAGCGAGGGGAAGCGGCTTAACACCCGAGAGTT 296
|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 97 ------------AGGTCCCCTTCCCCTGAACCAATCTACAACAGCGAGGGGAAGCGGCTTAACACTCGAGAGTT 158
Query 297 CCGCACCCGCAAAAAGCTGGAAGAGGAGCGGCACAACCTCATCACAGAGATGGTTGCACTCAATCCGGATTTCA 370
|||.||||||||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 159 CCGTACCCGCAAAAAGCTTGAAGAGGAGCGGCACACCCTTATTACAGAGATGGTTGCTCTCAACCCAGACTTTA 232
Query 371 AGCCACCTGCAGATTACAAACCTCCAGCAACACGTGTGAGTGATAAAGTCATGATTCCACAAGATGAGTACCCA 444
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||
Sbjct 233 AACCACCTGCAGATTACAAGCCTCCAGCAACACGTGTGAGCGATAAAGTAATGATCCCCCAAGACGAATATCCA 306
Query 445 GAAATCAACTTTGTGGGGCTGCTCATCGGGCCCAGAGGGAACACCCTGAAGAACATAGAGAAGGAGTGCAATGC 518
||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 307 GAAATCAATTTTGTGGGGCTCCTAATTGGACCCAGAGGGAACACCCTGAAGAACATTGAGAAGGAATGCAACGC 380
Query 519 CAAGATTATGATCCGGGGGAAAGGGTCTGTGAAAGAAGGGAAGGTTGGGCGCAAAGATGGCCAGATGTTGCCAG 592
||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 381 CAAGATCATGATTCGGGGGAAAGGATCAGTGAAAGAAGGGAAAGTTGGGCGTAAAGATGGTCAGATGTTGCCAG 454
Query 593 GAGAAGATGAGCCACTTCATGCCCTGGTTACTGCCAATACAATGGAGAACGTCAAAAAGGCAGTGGAACAGATA 666
|.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 455 GCGAAGATGAGCCTCTTCATGCTCTAGTCACTGCCAATACGATGGAGAATGTCAAAAAGGCAGTAGAACAGATC 528
Query 667 AGAAACATCCTGAAGCAGGGTATCGAGACTCCAGAGGACCAGAATGATCTACGGAAGATGCAGCTTCGGGAGTT 740
|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 529 AGAAACATCCTGAAGCAGGGTATTGAGACCCCAGAGGACCAGAACGATCTACGGAAAATGCAGCTTCGAGAGTT 602
Query 741 GGCTCGCTTAAATGGGACCCTTCGGGAAGACGATAACAGGATCTTAAGACCCTGGCAGAGCTCAGAGACCCGCA 814
|||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 603 GGCTCGCTTGAATGGCACTCTACGGGAAGATGATAATAGGATCTTAAGGCCCTGGCAGAGCTCAGAGACGCGCA 676
Query 815 GCATTACCAACACCACAGTGTGTACCAAGTGTGGAGGGGCTGGCCACATTGCTTCAGACTGTAAATTCCAAAGG 888
||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||
Sbjct 677 GCATTACCAATACTACTGTGTGTACCAAGTGTGGAGGGGCTGGTCACATTGCTTCTGATTGCAAATTTCAGAGG 750
Query 889 CCTGGTGATCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGGATAAAGAATATTTGTCCCTCATGGCTGAACTGGG 962
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 751 CCTGGCGACCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGGATAAAGAATATTTGTCCCTTATGGCTGAGCTAGG 824
Query 963 TGAAGCACCTGTCCCAGCATCTGTGGGCTCCACCTCTGGGCCTGCCACCACACCCCTGGCCAGCGCACCTCGTC 1036
.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||..|.|
Sbjct 825 GGAAGCTCCTGTCCCTGCATCTGTGGGCTCTACCTCTGGGCCTGCCACCACGCCCCTGGCTAGTGCACCAAGAC 898
Query 1037 CTGCTGCTCCCGCCAACAACCCACCTCCACCGTCTCTCATGTCTACCACCCAGAGCCGCCCACCCTGGATGAAT 1110
||||||||||.||||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 CTGCTGCTCCTGCCAGCAACCCACCACCACCGTCTCTCATGTCTACAACTCAGAGCCGCCCACCCTGGATGAAT 972
Query 1111 TCTGGCCCTTCAGAGAGTCGGCCCTACCACGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTGGGCCCGGAGGTGGCCCCCA 1184
|||||.||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 973 TCTGGTCCTTCAGAGAATCGGCCCTACCATGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTGGTCCTGGAGGTGGCCCCCA 1046
Query 1185 CAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTGGGCATGGTGGACATCCCATGCAGCACAACCCCAATGGAC 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1047 CAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTGGGCATGGTGGGCATCCCATGCAGCACAACCCAAATGGAC 1120
Query 1259 CCCCACCCCCTTGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCCTCCTGGGCACCATGGCCCT 1332
|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1121 CACCACCACCTTGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCCACCTGGGCACCATGGCCCT 1194
Query 1333 CCTCCAATGGATCAGTACCTGGGAAGTACGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCCTGCATCAAGGAAAAGGTAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 CCTCCAATGGATCAGTACCTGGGAAGTACGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCCTGCATCAAGGAAAAGGTAT 1268
Query 1407 GATGCCGCCACCACCTATGGGCATGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCCAGTGGGCAGCCCCCACCCCCTCCCT 1480
|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1269 GATGCCGCCGCCGCCTATGGGCATGATGCCGCCGCCTCCGCCACCTCCCAGTGGGCAGCCCCCGCCTCCTCCCT 1342
Query 1481 CTGGTCCTCTTCCCCCATGGCAACAACAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCCGCCCAGCAGCAGTATGGCT 1554
|||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1343 CTGGTCCTCTTCCTCCATGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCCGCCCAGCAGCAGTATGGCT 1416
Query 1555 TCCAGTACCCCCTTGCCATGGCAGCAAA----GA----TCCCTCCCCGCGGCGGCGATGG------------CC 1608
|||||.|||||||||||||||||||||| || |.||.||.|| .|||.||| ||
Sbjct 1417 TCCAGCACCCCCTTGCCATGGCAGCAAAATACGACGACTACCACCACG----AGCGCTGGCACAGGGTCCATCC 1486
Query 1609 CGAGCCATG-----AG----AGTGAGGACTTTCCGC-GC----CCATTGG------------------------ 1644
| |||||| || || |.|| .|.|||| || ||| ||
Sbjct 1487 C--GCCATGGCAACAGCAGCAG-GCGG--CTGCCGCAGCTTCTCCA--GGAACCCCTCAGATGCAAGGCAACCC 1553
Query 1645 -------------------------------------------------------------------------- 1644
Sbjct 1554 CACTATGGTGCCCCTGCCCCCCGGGGTCCAGCCGCCTCTGCCGCCCGGGGCCCCTCCCCCTCCGCCGCCTCCGC 1627
Query 1645 -------------------------------------------------------------------------- 1644
Sbjct 1628 CACCTGGTTCCGCCGGCATGATGTATGCCCCACCCCCTCCTCCTCCGCCTCCCATGGACCCTTCTAACTTTGTC 1701
Query 1645 -------------------------------------------------------------------------- 1644
Sbjct 1702 ACCATGATGGGCATGGGGGTGGCGGGCATGCCGCCCTTCGGGATGCCTCCAGCTCCCCCACCGCCTCCACCACA 1775
Query 1645 ---- 1644
Sbjct 1776 GAAC 1779