Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469818
- Subject:
- NM_001303513.2
- Aligned Length:
- 2327
- Identities:
- 2016
- Gaps:
- 310
Alignment
Query 1 ATGGGATGTAATATGTGCGTGGTCCAGAAACCGGAGGAGCAGTACAAAGTGATGCTGCAGGTGAACGGGAAGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GCTCTCCAAGCTGTCTCAGGAGCAAACTCTGCAGGCCCTGCGCTCCTCCAAGGAGCCCCTGGTGATCCAGGTGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGAGACGCAGCCCCCGCCTCCGGGGGGACAGCTCCTGTCACGACCTGCAGCTGGTGGACAGTGGCACTCAGACC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GACATCACCTTCGAGCATATCATGGCGCTGGGCAAGCTGCGTCCGCCCACCCCGCCCATGGTCATCCTGGAGCC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GTACGTCCTCTCTGA--GCTCCCCCCAATCAGCCATGAGTATTATGACCCGGCGGAGTTTATGGAGGGCGGCCC 368
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Sbjct 1 -----------ATGACCGC-CCCCCCAATCAGCCATGAGTATTATGACCCGGCGGAGTTTATGGAGGGCGGCCC 62
Query 369 GCAGGAGGCAGACCGCTTGGATGAGCTGGAGTATGAGGAGGTGGAGCTGTATAAAAGCAGCCACCGGGACAAGC 442
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Sbjct 63 GCAGGAGGCAGACCGCTTGGATGAGCTGGAGTATGAGGAGGTGGAGCTGTATAAAAGCAGCCACCGGGACAAGC 136
Query 443 TGGGCCTGATGGTTTGCTACCGCACGGACGACGAGGAGGACCTGGGCATTTATGTCGGAGAGGTAAATCCCAAC 516
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Sbjct 137 TGGGCCTGATGGTTTGCTACCGCACGGACGACGAGGAGGACCTGGGCATTTATGTCGGAGAGGTAAATCCCAAC 210
Query 517 AGCATTGCAGCCAAAGACGGCCGGATCCGTGAGGGAGACCGCATCATCCAGATTAACGGTGTAGACGTCCAGAA 590
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Sbjct 211 AGCATTGCAGCCAAAGACGGCCGGATCCGTGAGGGAGACCGCATCATCCAGATTAACGGTGTAGACGTCCAGAA 284
Query 591 CCGGGAAGAGGCGGTGGCCATCCTGAGCCAGGAAGAGAACACCAACATCTCCCTGCTGGTGGCCCGACCTGAGA 664
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Sbjct 285 CCGGGAAGAGGCGGTGGCCATCCTGAGCCAGGAAGAGAACACCAACATCTCCCTGCTGGTGGCCCGACCTGAGA 358
Query 665 GTCAGCTGGCGAAAAGGTGGAAGGACAGCGACCGGGATGACTTCCTGGATGACTTTGGCTCTGAGAATGAGGGG 738
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Sbjct 359 GTCAGCTGGCGAAAAGGTGGAAGGACAGCGACCGGGATGACTTCCTGGATGACTTTGGCTCTGAGAATGAGGGG 432
Query 739 GAGCTGCGTGCTCGTAAACTGAAATCACCCCCTGCCCAGCAGCCCGGAAACGAAGAGGAGAAGGGGGCTCCCGA 812
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Sbjct 433 GAGCTGCGTGCTCGTAAACTGAAATCACCCCCTGCCCAGCAGCCCGGAAACGAAGAGGAGAAGGGGGCTCCCGA 506
Query 813 TGCCGGCCCAGGCCTGAGCAACAGCCAGGAGCTGGACAGCGGGGTGGGCCGGACTGACGAGAGCACCCGGAACG 886
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Sbjct 507 TGCCGGCCCAGGCCTGAGCAACAGCCAGGAGCTGGACAGCGGGGTGGGCCGGACTGACGAGAGCACCCGGAACG 580
Query 887 AAGAGAGCTCTGAGCACGACCTGCTGGGGGACGAACCCCCGAGCTCCACCAACACCCCGGGAAGCCTGCGCAAG 960
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Sbjct 581 AAGAGAGCTCTGAGCACGACCTGCTGGGGGACGAACCCCCGAGCTCCACCAACACCCCGGGAAGCCTGCGCAAG 654
Query 961 TTTGGCCTGCAAGGGGACGCCCTGCAGAGCCGGGACTTCCATTTCAGCATGGACTCTCTGCTGGCCGAGGGGGC 1034
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Sbjct 655 TTTGGCCTGCAAGGGGACGCCCTGCAGAGCCGGGACTTCCATTTCAGCATGGACTCTCTGCTGGCCGAGGGGGC 728
Query 1035 GGGGCTGGGAGGGGGCGACGTCCCGGGCCTCACGGATGAGGAGTATGAGCGCTACCGTGAGCTCCTGGAGATCA 1108
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Sbjct 729 GGGGCTGGGAGGGGGCGACGTCCCGGGCCTCACGGATGAGGAGTATGAGCGCTACCGTGAGCTCCTGGAGATCA 802
Query 1109 AGTGCCACCTGGAGAACGGCAACCAGCTGGGCCTCCTCTTTCCCCGGGCCTCCGGAGGCAACAGCGCCCTGGAC 1182
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Sbjct 803 AGTGCCACCTGGAGAACGGCAACCAGCTGGGCCTCCTCTTTCCCCGGGCCTCCGGAGGCAACAGCGCCCTGGAC 876
Query 1183 GTCAACCGCAACGAGAGCCTGGGCCACGAGATGGCCATGCTGGAGGAGGAGCTAAGGCACCTGGAATTCAAGTG 1256
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Sbjct 877 GTCAACCGCAACGAGAGCCTGGGCCACGAGATGGCCATGCTGGAGGAGGAGCTAAGGCACCTGGAATTCAAGTG 950
Query 1257 CCGCAACATACTGCGGGCGCAGAAGATGCAGCAGCTGCGTGAGCGCTGCATGAAGGCCTGGCTGCTGGAGGAGG 1330
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Sbjct 951 CCGCAACATACTGCGGGCGCAGAAGATGCAGCAGCTGCGTGAGCGCTGCATGAAGGCCTGGCTGCTGGAGGAGG 1024
Query 1331 AGAGCCTCTACGACCTGGCGGCCAGCGAGCCCAAGAAGCACGAGCTGTCCGACATCTCCGAGCTGCCCGAGAAG 1404
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Sbjct 1025 AGAGCCTCTACGACCTGGCGGCCAGCGAGCCCAAGAAGCACGAGCTGTCCGACATCTCCGAGCTGCCCGAGAAG 1098
Query 1405 TCGGACAAGGACAGCACCAGCGCCTACAACACTGGGGAGAGCTGCCGCAGCACCCCGCTGCTTGTGGAGCCCCT 1478
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Sbjct 1099 TCGGACAAGGACAGCACCAGCGCCTACAACACTGGGGAGAGCTGCCGCAGCACCCCGCTGCTTGTGGAGCCCCT 1172
Query 1479 GCCCGAGAGCCCCCTGCGGCGGGCCATGGCCGGCAACTCCAACTTGAACCGGACCCCTCCCGGCCCCGCTGTTG 1552
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Sbjct 1173 GCCCGAGAGCCCCCTGCGGCGGGCCATGGCCGGCAACTCCAACTTGAACCGGACCCCTCCCGGCCCCGCTGTTG 1246
Query 1553 CCACCCCCGCCAAGGCAGCTCCTCCACCGGGGAGCCCCGCCAAGTTCCGGTCCCTCTCCCGGGATCCTGAGGCC 1626
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Sbjct 1247 CCACCCCCGCCAAGGCAGCTCCTCCACCGGGGAGCCCCGCCAAGTTCCGGTCCCTCTCCCGGGATCCTGAGGCC 1320
Query 1627 GGCCGGAGGCAGCACGCGGAGGAGCGCGGCCGCCGCAACCCCAAGACGGGGTTGACCCTGGAGCGTGTGGGCCC 1700
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Sbjct 1321 GGCCGGAGGCAGCACGCGGAGGAGCGCGGCCGCCGCAACCCCAAGACGGGGTTGACCCTGGAGCGTGTGGGCCC 1394
Query 1701 TGAAAGCAGCCCTTACCTCTCGCGGCGCCACCGCGGCCAGGGCCAGGAGGGCGAGCACTACCACAGCTGCGTGC 1774
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Sbjct 1395 TGAAAGCAGCCCTTACCTCTCGCGGCGCCACCGCGGCCAGGGCCAGGAGGGCGAGCACTACCACAGCTGCGTGC 1468
Query 1775 AGCTGGCCCCGACGCGAGGCCTGGAGGAGCTGGGCCACGGCCCCCTGAGCTTGGCCGGTGGCCCTCGGGTGGGC 1848
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Sbjct 1469 AGCTGGCCCCGACGCGAGGCCTGGAGGAGCTGGGCCACGGCCCCCTGAGCTTGGCCGGTGGCCCTCGGGTGGGC 1542
Query 1849 GGGGTGGCGGCCGCGGCCACTGAAGCACCGCGCATGGAGTGGAAAGTGAAGGTGCGCAGCGACGGAACCCGCTA 1922
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Sbjct 1543 GGGGTGGCGGCCGCGGCCACTGAAGCACCGCGCATGGAGTGGAAAGTGAAGGTGCGCAGCGACGGAACCCGCTA 1616
Query 1923 CGTGGCCAAGCGGCCCGTGCGAGATCGGCTGCTGAAAGCCCGTGCCCTGAAGATCCGGGAGGAGCGCAGCGGTA 1996
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Sbjct 1617 CGTGGCCAAGCGGCCCGTGCGAGATCGGCTGCTGAAAGCCCGTGCCCTGAAGATCCGGGAGGAGCGCAGCGGTA 1690
Query 1997 TGACGACCGACGACGACGCGGTGAGCGAGATGAAGATGGGCCGCTACTGGAGCAAGGAGGAGCGGAAGCAGCAC 2070
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Sbjct 1691 TGACGACCGACGACGACGCGGTGAGCGAGATGAAGATGGGCCGCTACTGGAGCAAGGAGGAGCGGAAGCAGCAC 1764
Query 2071 CTGATCCGGGCCCGTGAGCAGCGGAAGCGGCGCGAGTTCATGATGCAGAGCCGGCTGGAGTGCCTGCGGGAGCA 2144
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Sbjct 1765 CTGATCCGGGCCCGTGAGCAGCGGAAGCGGCGCGAGTTCATGATGCAGAGCCGGCTGGAGTGCCTGCGGGAGCA 1838
Query 2145 GCAGAATGGCGACAGCAAGCCCGAGCTCAACATCATTGCCCTGAGCCACCGCAAAACCATGAAGAAGCGGAACA 2218
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Sbjct 1839 GCAGAATGGCGACAGCAAGCCCGAGCTCAACATCATTGCCCTGAGCCACCGCAAAACCATGAAGAAGCGGAACA 1912
Query 2219 AGAAGATCCTGGACAACTGGATCACCATCCAGGAGATGCTGGCCCACGGCGCGCGCTCCGCCGATGGCAAGCGG 2292
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Sbjct 1913 AGAAGATCCTGGACAACTGGATCACCATCCAGGAGATGCTGGCCCACGGCGCGCGCTCCGCCGATGGCAAGCGG 1986
Query 2293 GTCTACAACCCTCTTCTCTCAGTCACCACCGTG 2325
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Sbjct 1987 GTCTACAACCCTCTTCTCTCAGTCACCACCGTG 2019
