Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469829
• Subject: XM_011535267.3
• Aligned Length: 1812
• Identities: 1328
• Gaps: 480

Alignment

Query    1  ATGGCGGAGGCGGCGCTGTTGCTGCTGCCTGAGGCGGCGGCGGAGCGGGACGCTAGGGAAAAGCTGGCTCTCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGAGGCGGCGCTGTTGCTGCTGCCTGAGGCGGCGGCGGAGCGGGACGCTAGGGAAAAGCTGGCTCTCTG  74

Query   75  GGATCGGAGACCGGACACGACGGCGCCGCTGACCGACAGGCAGACGGACTCGGTATTGGAGCTGAAGGCGGCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGATCGGAGACCGGACACGACGGCGCCGCTGACCGACAGGCAGACGGACTCGGTATTGGAGCTGAAGGCGGCGG  148

Query  149  CAGAGAACTTGCCGGTGCCAGCTGAGCTTCCAATTGAAGACTTGTGCAGTTTAACATCCCAGTCACTGCCCATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGAGAACTTGCCGGTGCCAGCTGAGCTTCCAATTGAAGACTTGTGCAGTTTAACATCCCAGTCACTGCCCATT  222

Query  223  GAACTGACTTCAGTAGTGCCTGAATCTACAGAAGACATTCTCTTGAAGGGCTTCACTTCCTTAGGAATGGAAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAACTGACTTCAGTAGTGCCTGAATCTACAGAAGACATTCTCTTGAAGGGCTTCACTTCCTTAGGAATGGAAGA  296

Query  297  AGAAAGAATTGAAACCGCACAGCAGTTTTTCTCATGGTTTGCAAAGCTGCAAACTCAGATGGATCAAGATGAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAAAGAATTGAAACCGCACAGCAGTTTTTCTCATGGTTTGCAAAGCTGCAAACTCAGATGGATCAAGATGAAG  370

Query  371  GAACTAAATATAGACAGATGAGGGATTACTTGTCTGGGTTTCAGGAGCAGTGTGATGCTATATTGAATGATGTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAACTAAATATAGACAGATGAGGGATTACTTGTCTGGGTTTCAGGAGCAGTGTGATGCTATATTGAATGATGTA  444

Query  445  AACAGTGCTCTTCAGCATCTGGAGTCTTTGCAGAAACAGTATCTTTTTGTGTCCAATAAGACAGGAACCCTACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACAGTGCTCTTCAGCATCTGGAGTCTTTGCAGAAACAGTATCTTTTTGTGTCCAATAAGACAGGAACCCTACA  518

Query  519  TGAAGCCTGTGAACAGCTCCTAAAAGAACAGTCGGAACTTGTTGATCTGGCTGAAAACATTCAACAAAAGCTTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAAGCCTGTGAACAGCTCCTAAAAGAACAGTCGGAACTTGTTGATCTGGCTGAAAACATTCAACAAAAGCTTT  592

Query  593  CCTATTTTAACGAATTGGAAACTATTAACACAAAATTGAATTCCCCTACATTGTCGGTGAATAGTGACGGATTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTATTTTAACGAATTGGAAACTATTAACACAAAATTGAATTCCCCTACATTGTCGGTGAATAGTGACGGATTT  666

Query  667  ATACCTATGCTGGCCAAGTTAGATGATTGTATAACATATATCTCATCTCATCCTAATTTTAAAGATTATCCCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATACCTATGCTGGCCAAGTTAGATGATTGTATAACATATATCTCATCTCATCCTAATTTTAAAGATTATCCCAT  740

Query  741  ATATTTGCTGAAGTTTAAACAGTGTCTTTCTAAAGCTTTGCACCTCATGAAGACATATACTGTGAACACACTAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATATTTGCTGAAGTTTAAACAGTGTCTTTCTAAAGCTTTGCACCTCATGAAGACATATACTGTGAACACACTAC  814

Query  815  AGACCCTCACAAGTCAGTTACTGAAAAGGGATCCTTCATCTGTACCTAATGCAGACAATGCCTTCACATTATTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGACCCTCACAAGTCAGTTACTGAAAAGGGATCCTTCATCTGTACCTAATGCAGACAATGCCTTCACATTATTT  888

Query  889  TATGTGAAATTTCGAGCTGCTGCCCCCAAAGTCAGAACTCTTATTGAACAAATAGAACTGCGGTCTGAAAAAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATGTGAAATTTCGAGCTGCTGCCCCCAAAGTCAGAACTCTTATTGAACAAATAGAACTGCGGTCTGAAAAAAT  962

Query  963  ACCTGAATACCAACAACTGCTAAATGATATCCACCAGTGTTACCTTGATCAGCGGGAGCTCCTTTTGGGCCCTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACCTGAATACCAACAACTGCTAAATGATATCCACCAGTGTTACCTTGATCAGCGGGAGCTCCTTTTGGGCCCTA  1036

Query 1037  GTATTGCTTGCACTGTTGCAGAGTTAACCAGCCAAAATAATAGAGATCACTGTGCCTTGGTTCGTAGTGGCTGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTATTGCTTGCACTGTTGCAGAGTTAACCAGCCAAAATAATAGAGATCACTGTGCCTTGGTTCGTAGTGGCTGT  1110

Query 1111  GCCTTCATGGTTCATGTCTGCCAGGATGAACACCAACTTTACAATGAATTTTTCACAAAACCAACATCAAAATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCTTCATGGTTCATGTCTGCCAGGATGAACACCAACTTTACAATGAATTTTTCACAAAACCAACATCAAAATT  1184

Query 1185  AGATGAGCTTTTGGAGAAACTGTGTGTGTCATTGTATGATGTCTTCAGGCCATTGATCATTCATGTTATTCACT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGATGAGCTTTTGGAGAAACTGTGTGTGTCATTGTATGATGTCTTCAGGCCATTGATCATTCATGTTATTCACT  1258

Query 1259  TAGAGACTCTGTCGGAACTTTGTGGGATTCTTAAAAATGAAGTGCTTGAAGATCATGTGCAGAACAATGGTAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|.|.
Sbjct 1259  TAGAGACTCTGTCGGAACTTTGTGGGATTCTTAAAAATGAGGTGCTTGAAGATCATGTGCAGAACAATGCTGAG  1332

Query 1333  --------------------------------------------------------------------------  1332
                                                                                      
Sbjct 1333  CAACTGGGGGCATTTGCAGCTGGAGTCAAGCAGATGTTAGAAGATGTACAGGAGCGGCTCGTCTACCGAACCCA  1406

Query 1333  --------------------------------------------------------------------------  1332
                                                                                      
Sbjct 1407  CATCTATATTCAGACGGACATCACGGGCTATAAACCAGCTCCTGGAGATCTGGCATATCCCGATAAGTTAGTCA  1480

Query 1333  --------------------------------------------------------------------------  1332
                                                                                      
Sbjct 1481  TGATGGAGCAGATTGCACAGAGTTTGAAAGATGAACAGAAGAAGGTACCTTCAGAAGCTTCATTTTCAGATGTT  1554

Query 1333  --------------------------------------------------------------------------  1332
                                                                                      
Sbjct 1555  CACTTAGAAGAAGGAGAGTCTAACAGTCTGACAAAATCTGGTTCAACAGAATCCCTCAATCCTAGACCACAGAC  1628

Query 1333  --------------------------------------------------------------------------  1332
                                                                                      
Sbjct 1629  CACAATTTCTCCAGCAGATCTTCATGGAATGTGGTATCCTACGGTTCGAAGAACTCTTGTCTGTCTCTCCAAAT  1702

Query 1333  --------------------------------------------------------------------------  1332
                                                                                      
Sbjct 1703  TATACAGATGCATAGATAGGGCAGTGTTCCAAGGATTATCACAGGAAGCATTGTCTGCCTGCATTCAGTCCTTA  1776

Query 1333  ------------------------------------  1332
                                                
Sbjct 1777  CTTGGAGCGTCAGAGTCTATCAGCAAAAACAAGGTT  1812