Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469887
- Subject:
- NM_001135957.3
- Aligned Length:
- 2931
- Identities:
- 2508
- Gaps:
- 423
Alignment
Query 1 ATGGCTCAGTTCTATTACAAAAGAAATGTTAATGCTCCCTATAGAGACCGCATCCCTCTAAGGATAGTAAGAGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTCAGTTCTATTACAAAAGAAATGTTAATGCTCCCTATAGAGACCGCATCCCTCTAAGGATAGTAAGAGC 74
Query 75 AGAATCAGAACTCTCGCCATCAGAAAAAGCCTACTTGAATGCTGTGGAAAAGGGAGATTATGCCAGTGTCAAGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGAATCAGAACTCTCGCCATCAGAAAAAGCCTACTTGAATGCTGTGGAAAAGGGAGATTATGCCAGTGTCAAGA 148
Query 149 AATCCCTAGAGGAAGCTGAAATTTATTTTAAAATCAATATTAATTGCATTGATCCTCTCGGAAGAACTGCTCTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AATCCCTAGAGGAAGCTGAAATTTATTTTAAAATCAATATTAATTGCATTGATCCTCTCGGAAGAACTGCTCTC 222
Query 223 CTCATTGCAATTGAAAATGAGAACTTGGAGCTCATCGAACTACTCTTAAGCTTTAATGTCTATGTTGGAGATGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTCATTGCAATTGAAAATGAGAACTTGGAGCTCATCGAACTACTCTTAAGCTTTAATGTCTATGTTGGAGATGC 296
Query 297 TCTATTACATGCTATCAGAAAAGAAGTCGTCGGAGCTGTTGAGCTGTTATTGAACCACAAAAAACCTAGTGGAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCTATTACATGCTATCAGAAAAGAAGTCGTCGGAGCTGTTGAGCTGTTATTGAACCACAAAAAACCTAGTGGAG 370
Query 371 AAAAACAGGTGCCTCCTATACTCCTTGATAAGCAGTTCTCTGAATTCACTCCAGACATTACACCAATCATTTTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAAAACAGGTGCCTCCTATACTCCTTGATAAGCAGTTCTCTGAATTCACTCCAGACATTACACCAATCATTTTG 444
Query 445 GCAGCCCATACAAATAATTATGAGATAATAAAACTCTTGGTTCAGAAAGGAGTCTCAGTGCCTCGACCCCACGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCAGCCCATACAAATAATTATGAGATAATAAAACTCTTGGTTCAGAAAGGAGTCTCAGTGCCTCGACCCCACGA 518
Query 519 GGTCCGCTGTAACTGTGTGGAATGCGTGTCCAGTTCAGATGTGGACAGCCTCCGTCACTCACGCTCCAGACTCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGTCCGCTGTAACTGTGTGGAATGCGTGTCCAGTTCAGATGTGGACAGCCTCCGTCACTCACGCTCCAGACTCA 592
Query 593 ACATCTACAAGGCCTTGGCCAGTCCCTCTCTCATTGCACTGTCAAGCGAAGATCCTTTTCTCACAGCCTTTCAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACATCTACAAGGCCTTGGCCAGTCCCTCTCTCATTGCACTGTCAAGCGAAGATCCTTTTCTCACAGCCTTTCAG 666
Query 667 TTAAGTTGGGAACTTCAGGAACTGAGCAAGGTGGAAAATGAATTCAAGTCGGAGTATGAAGAGCTGTCACGGCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTAAGTTGGGAACTTCAGGAACTGAGCAAGGTGGAAAATGAATTCAAGTCGGAGTATGAAGAGCTGTCACGGCA 740
Query 741 GTGCAAACAATTTGCTAAGGACCTACTGGATCAGACGAGAAGTTCCAGAGAACTGGAAATCATTCTTAATTACC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTGCAAACAATTTGCTAAGGACCTACTGGATCAGACGAGAAGTTCCAGAGAACTGGAAATCATTCTTAATTACC 814
Query 815 GAGATGACAATAGTCTCATAGAAGAACAAAGTGGAAATGATCTTGCAAGACTAAAATTGGCCATTAAGTACCGT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GAGATGACAATAGTCTCATAGAAGAACAAAGTGGAAATGATCTTGCAAGACTAAAATTGGCCATTAAGTACCGT 888
Query 889 CAAAAAGAGTTTGTTGCCCAGCCCAATTGTCAACAGCTGCTGGCATCTCGCTGGTACGATGAGTTTCCAGGCTG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CAAAAAGAGTTTGTTGCCCAGCCCAATTGTCAACAGCTGCTGGCATCTCGCTGGTACGATGAGTTTCCAGGCTG 962
Query 963 GAGGAGAAGACACTGGGCAGTGAAGATGGTGACATGTTTCATAATAGGACTTCTTTTTCCTGTCTTCTCTGTGT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAGGAGAAGACACTGGGCAGTGAAGATGGTGACATGTTTCATAATAGGACTTCTTTTTCCTGTCTTCTCTGTGT 1036
Query 1037 GCTACCTGATAGCTCCCAAAAGCCCACTTGGACTGTTCATCAGGAAGCCATTTATCAAGTTTATCTGCCACACA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCTACCTGATAGCTCCCAAAAGCCCACTTGGACTGTTCATCAGGAAGCCATTTATCAAGTTTATCTGCCACACA 1110
Query 1111 GCCTCCTATTTGACTTTTTTGTTCCTGCTGCTGCTTGCCTCTCAGCACATCGACAGGTCAGACTTGAACAGGCA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCCTCCTATTTGACTTTTTTGTTCCTGCTGCTGCTTGCCTCTCAGCACATCGACAGGTCAGACTTGAACAGGCA 1184
Query 1185 AGGTCCACCACCAACCATCGTCGAGTGGATGATATTACCGTGGGTCCTGGGCTTCATATGGGGAGAAATTAAAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGGTCCACCACCAACCATCGTCGAGTGGATGATATTACCGTGGGTCCTGGGCTTCATATGGGGAGAAATTAAAC 1258
Query 1259 AGATGTGGGATGGCGGACTTCAGGACTACATCCATGATTGGTGGAATCTAATGGACTTTGTAATGAACTCCTTA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGATGTGGGATGGCGGACTTCAGGACTACATCCATGATTGGTGGAATCTAATGGACTTTGTAATGAACTCCTTA 1332
Query 1333 TATTTAGCAACAATCTCCTTGAAAATTGTTGCATTTGTAAAGTACAGTGCCCTTAATCCACGAGAATCATGGGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TATTTAGCAACAATCTCCTTGAAAATTGTTGCATTTGTAAAGTACAGTGCCCTTAATCCACGAGAATCATGGGA 1406
Query 1407 CATGTGGCATCCCACTCTGGTGGCAGAGGCTTTATTTGCTATTGCAAACATCTTCAGTTCTCTGCGTCTGATCT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CATGTGGCATCCCACTCTGGTGGCAGAGGCTTTATTTGCTATTGCAAACATCTTCAGTTCTCTGCGTCTGATCT 1480
Query 1481 CACTGTTTACTGCAAATTCTCACCTGGGACCTCTGCAAATATCTCTGGGAAGAATGCTCCTGGACATTTTGAAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CACTGTTTACTGCAAATTCTCACCTGGGACCTCTGCAAATATCTCTGGGAAGAATGCTCCTGGACATTTTGAAG 1554
Query 1555 TTTCTATTCATATACTGCCTTGTGTTGCTAGCATTTGCAAATGGCCTAAATCAATTGTACTTCTATTATGAAGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TTTCTATTCATATACTGCCTTGTGTTGCTAGCATTTGCAAATGGCCTAAATCAATTGTACTTCTATTATGAAGA 1628
Query 1629 AACGAAAGGGTTAACCTGCAAAGGCATAAGATGTGAAAAGCAGAATAATGCATTTTCAACGTTATTTGAGACAC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AACGAAAGGGTTAACCTGCAAAGGCATAAGATGTGAAAAGCAGAATAATGCATTTTCAACGTTATTTGAGACAC 1702
Query 1703 TGCAGTCCCTGTTTTGGTCAATATTTGGGCTCATCAATTTATATGTGACCAATGTCAAAGCACAGCATGAATTT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGCAGTCCCTGTTTTGGTCAATATTTGGGCTCATCAATTTATATGTGACCAATGTCAAAGCACAGCATGAATTT 1776
Query 1777 ACTGAGTTTGTTGGTGCCACCATGTTTGGGACATACAATGTCATCTCTCTGGTTGTTCTACTCAACATGTTAAT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ACTGAGTTTGTTGGTGCCACCATGTTTGGGACATACAATGTCATCTCTCTGGTTGTTCTACTCAACATGTTAAT 1850
Query 1851 AGCTATGATGAATAATTCTTACCAACTGATTGCTGACCATGCAGATATAGAATGGAAATTTGCACGAACAAAGC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AGCTATGATGAATAATTCTTACCAACTGATTGCTGACCATGCAGATATAGAATGGAAATTTGCACGAACAAAGC 1924
Query 1925 TTTGGATGAGTTATTTTGAAGAAGGAGGTACTCTGCCTACTCCCTTCAATGTCATCCCGAGCCCCAAGTCTCTC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TTTGGATGAGTTATTTTGAAGAAGGAGGTACTCTGCCTACTCCCTTCAATGTCATCCCGAGCCCCAAGTCTCTC 1998
Query 1999 TGGTACCTGATCAAATGGATCTGGACACACTTGTGCAAGAAAAAGATGAGAAGAAAGCCAGAAAGTTTTGGAAC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGGTACCTGATCAAATGGATCTGGACACACTTGTGCAAGAAAAAGATGAGAAGAAAGCCAGAAAGTTTTGGAAC 2072
Query 2073 AATAGGGAGGCGAGCTGCTGATAACTTGAGAAGACATCACCAATACCAAGAAGTTATGAGGAACCTGGTGAAGC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AATAGGGAGGCGAGCTGCTGATAACTTGAGAAGACATCACCAATACCAAGAAGTTATGAGGAACCTGGTGAAGC 2146
Query 2147 GATACGTTGCTGCAATGATTAGAGATGCTAAAACTGAAGAAGGCCTGACCGAAGAGAACTTTAAGGAACTAAAG 2220
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GATACGTTGCTGCAATGATTAGAGATGCTAAAACT--------------------------------------- 2181
Query 2221 CAAGACATTTCTAGTTTCCGCTTTGAAGTCCTGGGATTACTAAGAGGAAGCAAACTTTCCACAATACAATCTGC 2294
Sbjct 2182 -------------------------------------------------------------------------- 2181
Query 2295 GAATGCCTCGAAGGAGTCTTCAAATTCGGCAGACTCAGATGAAAAGAGTGATAGCGAAGGTAATAGCAAGGACA 2368
Sbjct 2182 -------------------------------------------------------------------------- 2181
Query 2369 AGAAAAAGAATTTCAGCCTTTTTGATTTAACCACCCTGATTCATCCGAGATCAGCAGCAATTGCCTCTGAAAGA 2442
Sbjct 2182 -------------------------------------------------------------------------- 2181
Query 2443 CATAACATAAGCAATGGCTCTGCCCTGGTGGTTCAGGAGCCGCCCAGGGAGAAGCAGAGAAAAGTGAATTTTGT 2516
Sbjct 2182 -------------------------------------------------------------------------- 2181
Query 2517 GACCGATATCAAAAACTTTGGGTTATTTCATAGACGATCAAAACAAAATGCTGCTGAGCAAAATGCAAACCAAA 2590
Sbjct 2182 -------------------------------------------------------------------------- 2181
Query 2591 TCTTCTCTGTTTCAGAAGAAGTTGCTCGTCAACAGGCTGCAGGACCACTTGAGAGAAATATTCAACTGGAATCT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2182 --------------GAAGAAGTTGCTCGTCAACAGGCTGCAGGACCACTTGAGAGAAATATTCAACTGGAATCT 2241
Query 2665 CGAGGATTAGCTTCACGGGGTGACCTGAGCATTCCCGGTCTCAGTGAACAATGTGTGTTAGTAGACCATAGAGA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2242 CGAGGATTAGCTTCACGGGGTGACCTGAGCATTCCCGGTCTCAGTGAACAATGTGTGTTAGTAGACCATAGAGA 2315
Query 2739 AAGGAATACGGACACACTGGGGTTACAGGTAGGAAAGAGAGTGTGTCCATTCAAGTCAGAGAAGGTGGTGGTGG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2316 AAGGAATACGGACACACTGGGGTTACAGGTAGGAAAGAGAGTGTGTCCATTCAAGTCAGAGAAGGTGGTGGTGG 2389
Query 2813 AGGACACGGTTCCTATAATACCAAAGGAGAAACATGCAAAAGAAGAGGACTCTAGTATAGACTATGATCTAAAC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2390 AGGACACGGTTCCTATAATACCAAAGGAGAAACATGCAAAAGAAGAGGACTCTAGTATAGACTATGATCTAAAC 2463
Query 2887 CTCCCAGACACAGTCACCCACGAAGATTACGTGACCACAAGATTG 2931
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2464 CTCCCAGACACAGTCACCCACGAAGATTACGTGACCACAAGATTG 2508