Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469991
• Subject: XM_006718208.3
• Aligned Length: 1646
• Identities: 1622
• Gaps: 20

Alignment

Query    1  ATGGCAACCTCATCTGAAGAAGTTTTGCTGATTGTAAAGAAAGTGCGTCAAAAGAAGCAGGATGGAGCTCTGTA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAACCTCATCTGAAGAAGTTTTGCTGATTGTAAAGAAAGTGCGTCAAAAGAAGCAGGATGGAGCTCTGTA  74

Query   75  CCTCATGGCAGAAAGAATTGCTTGGGCACCTGAAGGCAAAGATAGATTTACAATCAGCCATATGTATGCAGATA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCATGGCAGAAAGAATTGCTTGGGCACCTGAAGGCAAAGATAGATTTACAATCAGCCATATGTATGCAGATA  148

Query  149  TTAAATGCCAGAAAATTAGTCCAGAAGGAAAAGCTAAAATTCAGCTTCAGCTGGTCCTACATGCAGGGGACACA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTAAATGCCAGAAAATTAGTCCAGAAGGAAAAGCTAAAATTCAGCTTCAGCTGGTCCTACATGCAGGGGACACA  222

Query  223  ACTAACTTCCATTTTTCCAATGAAAGCACAGCAGTGAAAGAGCGAGATGCAGTAAAAGACCTTCTTCAGCAGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTAACTTCCATTTTTCCAATGAAAGCACAGCAGTGAAAGAGCGAGATGCAGTAAAAGACCTTCTTCAGCAGCT  296

Query  297  GCTGCCCAAATTCAAGAGGAAAGCAAATAAAGAACTGGAAGAGAAGAACAGAATGCTGCAAGAAGATCCTGTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTGCCCAAATTCAAGAGGAAAGCAAATAAAGAACTGGAAGAGAAGAACAGAATGCTGCAAGAAGATCCTGTTT  370

Query  371  TGTTTCAGCTTTATAAAGACCTTGTTGTGAGTCAAGTGATCAGTGCTGAGGAATTCTGGGCCAATCGTTTAAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTTTCAGCTTTATAAAGACCTTGTTGTGAGTCAAGTGATCAGTGCTGAGGAATTCTGGGCCAATCGTTTAAAT  444

Query  445  GTGAATGCAACAGATAGTTCTTCCACATCCAATCATAAGCAGGATGTTGGCATTTCTGCTGCATTTCTGGCTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGAATGCAACAGATAGTTCTTCCACATCCAATCATAAGCAGGATGTTGGCATTTCTGCTGCATTTCTGGCTGA  518

Query  519  TGTCCGGCCCCAAACTGATGGCTGTAACGGTCTAAGATATAATTTAACTTCTGATATCATTGAGTCCATATTTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTCCGGCCCCAAACTGATGGCTGTAACGGTCTAAGATATAATTTAACTTCTGATATCATTGAGTCCATATTTA  592

Query  593  GGACCTATCCAGCAGTAAAAATGAAATATGCAGAAAATGTTCCCCACAACATGACAGAGAAAGAATTCTGGACA  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  593  GGACCTATCCAGCAGTAAAAATGAAATATGCAGAAAATGTTCCCCACAACATGACAGAGAAGGAATTCTGGACA  666

Query  667  CGTTTTTTCCAGTCCCATTATTTTCACAGGGATCGGCTG-ATACA-GGTCAAAGGATCTCTTTGCAGAATGTGC  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGTTTTTTCCAGTCCCATTATTTTCACAGGGATCGGCTGAATACAGGGTCAAAGGATCTCTTTGCAGAATGTGC  740

Query  739  ----ATAGATGAAAA---GCTAAAA--CATGGTTTCATTA-GAGTGAAAA--CCACTACTAGA-TTAACAGC-T  798
                |||||||||||   .||||||  .|||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| |
Sbjct  741  CAAAATAGATGAAAAAGGCCTAAAAACAATGGTTTCATTAGGAGTGAAAAACCCACTACTAGATTTAACAGCTT  814

Query  799  TGGAAGAT-AACCATTAGATGAGGGCTATGGCATTTCCTCTGTGCCATCTGCTTCCAATTCTTAATCCCATAAA  871
            |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||| |||||||
Sbjct  815  TGGAAGATAAACCATTAGATGAGGGCTATGGCATTTCCTCTGTGCCATCTGCTTCCAATTCTAAAT-CCATAAA  887

Query  872  GAGA-AATAGTAATGCTGCCATCATCAAGAGATTTAACCATCACAGTGCCATGGTCCTGGCAGCTGGACTCAGA  944
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  -AGAGAATAGTAATGCTGCCATCATCAAGAGATTTAACCATCACAGTGCCATGGTCCTGGCAGCTGGACTCAGA  960

Query  945  AAACAAGAAGCACAAAATGAACAAACTAGTGAGCCCAGCAACATGGATGGAAATTCCGGAGATGCAGACTGCTT  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  AAACAAGAAGCACAAAATGAACAAACTAGTGAGCCCAGCAACATGGATGGAAATTCCGGAGATGCAGACTGCTT  1034

Query 1019  TCAGCCAGCAGTCAAAAGGGCGAAATTACAAGAGTCCATTGAATATGAAGACTTGGGGAAAAATAATTCTGTAA  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  TCAGCCAGCAGTCAAAAGGGCGAAATTACAAGAGTCCATTGAATATGAAGACTTGGGGAAAAATAATTCTGTAA  1108

Query 1093  AAACGATTGCACTAAACCTCAAGAAGTCAGATAGGTATTATCATGGTCCAACTCCAATCCAGTCACTACAGTAT  1166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  AAACGATTGCACTAAACCTCAAGAAGTCAGATAGGTATTATCATGGTCCAACTCCAATCCAGTCACTACAGTAT  1182

Query 1167  GCAACAAGTCAGGACATTATTAATTCTTTTCAAAGTATTAGACAAGAAATGGAAGCTTATACACCCAAGTTAAC  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  GCAACAAGTCAGGACATTATTAATTCTTTTCAAAGTATTAGACAAGAAATGGAAGCTTATACACCCAAGTTAAC  1256

Query 1241  TCAGGTTCTCTCAAGTAGTGCTGCCAGTAGTACCATCACAGCACTGTCACCTGGAGGGGCACTTATGCAGGGAG  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  TCAGGTTCTCTCAAGTAGTGCTGCCAGTAGTACCATCACAGCACTGTCACCTGGAGGGGCACTTATGCAGGGAG  1330

Query 1315  GAACACAGCAAGCCATAAACCAGATGGTGCCAAATGATATTCAATCTGAATTGAAACACTTATATGTAGCTGTT  1388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331  GAACACAGCAAGCCATAAACCAGATGGTGCCAAATGATATTCAATCTGAATTGAAACACTTATATGTAGCTGTT  1404

Query 1389  GGAGAACTTCTACGACATTTCTGGTCCTGCTTTCCTGTTAATACGCCATTCCTAGAAGAAAAGGTAGTGAAAAT  1462
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405  GGAGAACTTCTACGACATTTCTGGTCCTGCTTTCCTGTTAATACGCCATTCCTAGAAGAAAAGGTAGTGAAAAT  1478

Query 1463  GAAAAGTAATTTGGAACGATTCCAAGTTACGAAGCTCTGTCCATTCCAAGAAAAGATTCGGAGACAGTATTTAA  1536
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479  GAAAAGTAATTTGGAACGATTCCAAGTTACGAAGCTCTGTCCATTCCAAGAAAAGATTCGGAGACAGTATTTAA  1552

Query 1537  GCACAAATTTGGTAAGTCACATAGAAGAGATGCTCCAGACAGCCTACAACAAGCTCCACACATGGCAGTCACGG  1610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553  GCACAAATTTGGTAAGTCACATAGAAGAGATGCTCCAGACAGCCTACAACAAGCTCCACACATGGCAGTCACGG  1626

Query 1611  CGTCTGATGAAGAAAACG  1628
            ||||||||||||||||||
Sbjct 1627  CGTCTGATGAAGAAAACG  1644