Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469992
• Subject: XM_006526326.3
• Aligned Length: 1729
• Identities: 1518
• Gaps: 1

Alignment

Query    1  ATGCCAGCTTTGTCAACGGGATCTGGGAGTGACACTGGTCTGTATGAGCTGTTGGCTGCTCTGCCAGCCCAGCT  74
            ||||||||..||.|.||.|||||.|...|.||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCCAGCGCTGGCCACAGGATCGGCTTGCGACATGGGTCTGTATGAGCTGTTGGCTGCTCTGCCTGCCCAGCT  74

Query   75  GCAGCCACATGTGGATAGCCAGGAAGACCTGACCTTCCTCTGGGATATGTTTGGTGAAAAAAGCCTGCATTCAT  148
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct   75  GCAGCCACATGTGGATAGCCAGGAGGACCTGACCTTCCTCTGGGACGTGTTTGGTGAAAAGAGCCTGCATTCAC  148

Query  149  TGGTAAAGATTCATGAAAAACTACACTACTATGAGAAGCAGAGTCCGGTGCCCATTCTCCATGGTGCGGCGGCC  222
            ||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  149  TGGTCAAGATTCATGAAAAACTTCACTGCTATGAGAAGCAGAATCCGTTGCCCATTCTCCATGGTGCAGCAGCG  222

Query  223  TTGGCCGATGATCTGGCCGAAGAGCTTCAGAACAAGCCATTAAACAGTGAGATCAGAGAGCTGTTGAAACTACT  296
            |||||.|||||||||.|.||||||||.||||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  TTGGCTGATGATCTGACTGAAGAGCTACAGAACAAGCTACCAAACAGTGAGATCAGAGAGCTGTTGAAACTGCT  296

Query  297  GTCAAAACCCAATGTGAAGGCTTTGCTCTCTGTACATGATACTGTGGCTCAGAAGAATTACGACCCAGTGTTGC  370
            |||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||.|||.||.||.||.||||
Sbjct  297  GTCAAAACCCAATGTCAAGGCTTTGCTGTCAGTACATGATACTGTGGCTCAAAAGAGTTATGATCCTGTATTGC  370

Query  371  CTCCTATGCCTGAAGATATTGACGATGAGGAAGACTCAGTAAAAATAATCCGTCTGGTCAAAAATAGAGAACCA  444
            ||||..|||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.
Sbjct  371  CTCCCGTGCCTGACGATATTGATGATGAGGAAGACTCTGTGAAAATAATCCGCCTGGTCAAAAATAGCGAGCCC  444

Query  445  CTGGGAGCTACCATTAAGAAGGATGAACAGACCGGGGCGATCATTGTGGCCAGAATCATGAGAGGAGGAGCTGC  518
            |||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||.|||||||.||||||||.|.|||||||||||
Sbjct  445  CTGGGTGCTACCATTAAAAAAGATGAGCAGACCGGAGCAATCACTGTGGCCCGAATCATGCGGGGAGGAGCTGC  518

Query  519  AGATAGAAGTGGTCTTATTCATGTTGGTGATGAACTTAGGGAAGTCAACGGGATACCAGTGGAGGATAAAAGGC  592
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  519  AGATAGAAGTGGTCTTATTCACGTGGGTGATGAGCTGAGGGAAGTGAATGGAATCCCAGTGGAAGATAAGAGGC  592

Query  593  CTGAGGAAATAATACAGATTTTGGCTCAGTCTCAGGGAGCAATTACATTTAAGATTATACCCGGCAGCAAAGAG  666
            ||||||||||||||.||||||||..||||||..||||||||||||||||||||||.||||||.|||.|||||||
Sbjct  593  CTGAGGAAATAATAAAGATTTTGAGTCAGTCCAAGGGAGCAATTACATTTAAGATAATACCCAGCACCAAAGAG  666

Query  667  GAGACACCATCAAAAGAAGGCAAGATGTTTATCAAAGCCCTCTTTGACTATAATCCTAATGAGGATAAAGGCAA  740
            ||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|||||||.||.|| .|||||||
Sbjct  667  GAGACACCTTCGAAAGAAGGCAAGATATTTATCAAAGCCCTCTTTGACTACGATCCTAAGGAAGA-CAAGGCAA  739

Query  741  TTCCATGTAAGGAAGCTGGGCTTTCTTTCAAAAAGGGAGATATTCTTCAGATTATGAGCCAAGATGATGCAACT  814
            |.||.|||||.||.||.|||||.|||||||..|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||..||.
Sbjct  740  TCCCGTGTAAAGAGGCAGGGCTGTCTTTCAGGAAGGGGGACATTCTTCAGATTATGAGCCAAGATGATGTGACA  813

Query  815  TGGTGGCAAGCGAAACACGAAGCTGATGCCAACCCCAGGGCAGGCTTGATCCCCTCAAAGCATTTCCAGGAAAG  888
            ||||||||.||.||.||.||||..||||||||||||||.||.|||.||||.|||||.|||||.|||||||||.|
Sbjct  814  TGGTGGCAGGCTAAGCATGAAGGAGATGCCAACCCCAGAGCGGGCCTGATTCCCTCCAAGCACTTCCAGGAACG  887

Query  889  GAGATTGGCTTTGAGACGACCAGAAATATTGGTTCAGCCCCTGAAAGTTTCCAACAGGAAATCATCTGGTTTTA  962
            ||||.|||||.|||||||||||||||||.|.||||||||.||||||.|||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  888  GAGACTGGCTCTGAGACGACCAGAAATAGTAGTTCAGCCTCTGAAACTTTCCAACACGAAATCATCTGGTTTTA  961

Query  963  GAAGAAGATGTCGTCTTAGTAGAAAAGATAAGAAAACAAATAAATCCATGTATGAATGCAAGAAGAGTGATCAG  1036
            |||||||.|..||||||||.||||||.|||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  962  GAAGAAGTTTCCGTCTTAGCAGAAAAAATAAGAAAATAAATAAGTCCATGTATGAATGCAAAAAGAGTGAGCAG  1035

Query 1037  TACGACACAGCTGACGTACCCACATACGAAGAAGTGACACCGTATCGGCGACAAACTAATGAAAAATACAGACT  1110
            ||.|||||.||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.||.|...||||.|||||||||||
Sbjct 1036  TATGACACGGCAGATGTGCCCACATATGAGGAGGTGACACCCTACCGGCGGCAGATCCATGACAAATACAGACT  1109

Query 1111  CGTTGTCTTGGTTGGTCCCGTGGGAGTAGGGCTGAATGAACTGAAACGAAAGCTGCTGATCAGTGACACCCAGC  1184
            |.|||||.||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||..||||.|||||..|.||||
Sbjct 1110  CATTGTCCTGGTTGGTCCTGTCGGAGTCGGGCTAAATGAGCTGAAGCGAAAGCTATTGATGAGTGATGCACAGC  1183

Query 1185  ACTATGGCGTGACAGTGCCCCATACCACCAGAGCAAGAAGAAGCCAGGAGAGTGATGGTGTTGAATACATTTTC  1258
            |||||||.||||.|||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 1184  ACTATGGTGTGATAGTGCCCCACACCACTAGAGCAAGAAGAAGCCAAGAGAGTGATGGTGTGGAATATATTTTT  1257

Query 1259  ATTTCCAAGCATTTGTTTGAGACAGATGTACAAAATAACAAGTTTATTGAATATGGAGAATATAAAAACAACTA  1332
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1258  ATTTCCAAACATTTGTTTGAGACAGATGTACAAAATAACAAGTTCATTGAGTATGGTGAATATAAAAACAACTA  1331

Query 1333  CTACGGCACAAGTATAGACTCAGTTCGGTCTGTCCTTGCTAAAAACAAAGTTTGTTTGTTGGATGTTCAGCCTC  1406
            .||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||.||||||||||.|||||||
Sbjct 1332  TTATGGTACAAGTATAGACTCGGTTCGCTCTGTCCTAGCTAAGAACAAGGTTTGTCTGTTGGATGTCCAGCCTC  1405

Query 1407  ATACAGTGAAGCATTTAAGGACACTAGAATTTAAGCCCTATGTGATATTTATAAAGCCTCCATCAATAGAGCGT  1480
            |||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1406  ATACAGTGAAGCATTTAAGGACACTGGAGTTCAAACCCTATGTGATATTTATAAAACCTCCATCCATAGAGCGT  1479

Query 1481  TTGAGAGAAACAAGAAAAAATGCAAAGATTATTTCAAGCAGAGATGACCAAGGTGCTGCAAAACCCTTCACAGA  1554
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||.||
Sbjct 1480  TTGAGAGAGACAAGAAAAAATGCAAAGATTATTTCAAGCAGAGATGACCAAGGGACTGCAAAGCCCTTCACGGA  1553

Query 1555  AGAAGATTTTCAAGAAATGATTAAATCTGCACAGATAATGGAAAGTCAATATGGTCATCTTTTTGACAAAATTA  1628
            ||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1554  AGAAGACTTTCAGGAAATGATTAAATCAGCACAGATAATGGAAAGTCAATATGGCCATCTTTTTGACAAAATCA  1627

Query 1629  TAATAAATGATGACCTCACTGTGGCATTCAATGAGCTCAAAACAACTTTTGACAAATTAGAGACAGAGACCCAT  1702
            ||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||.||.||||||
Sbjct 1628  TAATCAATGATGATCTTACTGTGGCATTTAATGAGCTAAAAACAACATTTGACAAACTAGAGACTGATACCCAT  1701

Query 1703  TGGGTGCCAGTGAGCTGGTTACATTCA  1729
            |||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1702  TGGGTCCCAGTGAGTTGGTTACATTCA  1728