Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470031
• Subject: XM_006535208.2
• Aligned Length: 783
• Identities: 627
• Gaps: 62

Alignment

Query   1  ATGTTGACCAGGAAGATCAAGCTGTGGGACATCAACGCCCACATCACCTGCCGCCTGTGCAGCGGGTACCTCAT  74
           |||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct   1  ATGTTGACCAGGAAGATTAAACTCTGGGATATAAATGCCCACATCACCTGCCGCCTGTGCAGCGGCTACCTCAT  74

Query  75  CGACGCCACCACGGTGACCGAGTGTCTGCACACCTTCTGCAGGAGCTGCCTGGTGAAGTACCTGGAGGAGAACA  148
           .|||||.|||||.|||||.||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  75  TGACGCAACCACAGTGACTGAGTGTTTGCACACATTCTGCAGGAGCTGCCTGGTGAAGTATCTGGAGGAGAATA  148

Query 149  ACACCTGCCCCACCTGCAGGATTGTGATCCACCAGAGCCACCCCCTGCAGTACATCGGTCATGACAGAACCATG  222
           |.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..|.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ATACCTGCCCCACCTGCAGGATCGTGATCCATCAGAGCCACCCATTACAGTATATCGGTCATGACAGAACCATG  222

Query 223  CAAGATATTGTTTACAAATTGGTACCAGGCCTCCAAGAAGCGGAAATGAGAAAGCAGAGGGAGTTCTATCACAA  296
           ||.||.|||||||||||..||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 223  CAGGACATTGTTTACAAGCTGGTGCCAGGCCTCCAGGAAGCGGAAATGAGGAAACAGAGGGAATTCTATCACAA  296

Query 297  ATTGGGCATGGAGGTGCCGGGAGACATCAAGGGGGAGACCTGCTCTGCAAAACAGCACTTAGATTCCCATCGGA  370
           |.|||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||.||   ||.|
Sbjct 297  ACTGGGCATGGAGGTACCAGGTGACATCAAGGGGGAGGCGTGCTCAGCAAAACAGCACTTAGATCCC---CGAA  367

Query 371  ATGGTGAAACCAAAGCAGACGACAGTTCAAACAAAGAGGCCGCGGAGGAGAAGCCGGAGGAGGACAACGACTAC  444
           ||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||.|.||.||||||||||.||||||||||||.||||||
Sbjct 368  ATGGTGAAACCAAAGCAGACGACAATTCAAATAAAGAGACAGCAGAGGAGAAGCAGGAGGAGGACAATGACTAC  441

Query 445  CACCGCAGCGACGAGCAGGTGAGCATCTGCCTGGAGTGTAACAGCAGCAAACTGCGCGGGCTGAAGCGGAAGTG  518
           |||.|.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct 442  CACAGGAGTGACGAGCAGGTAAGCATCTGTCTGGAATGCAACAGCAGCAAACTACGTGGCCTCAAGCGGAAGTG  515

Query 519  GATCCGCTGCTCAGCCCAGGCGACCGTCTTGCATCTGAAGAAGTTCATCGCCAAAAAAACTCAACCTTTCATCC  592
           ||||.|.|||||||||||.||.||.||..||||.|||||.||.||.|||||| ||.||.||.|||||.||.|||
Sbjct 516  GATCAGATGCTCAGCCCAAGCAACTGTGCTGCACCTGAAAAAATTTATCGCC-AAGAAGCTTAACCTCTCCTCC  588

Query 593  TTTAACGAGCTGGACATTTTATGCAACGAGGAGATCCTGGGCAAGGACCACACACTCAAGTTCGTGGTTGTCAC  666
           |||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 589  TTTAATGAGCTGGACATTTTATGCAATGAGGAGATCCTGGGCAAGGACCACACTCTCAAGTTCGTGGTTGTTAC  662

Query 667  TAGGTGGAGATTCAAGA--------AGGCGCCGC--TCCTGCTGCA-CTACAGACCCA---AGATGGACTTGCT  726
           .||.|||||||||||||        .||..|.||  ||.|.|||.| |.||..|||||   ||  ||.|||..|
Sbjct 663  AAGATGGAGATTCAAGACATTGCTGTGGAACAGCTGTCTTTCTGGATCCACCCACCCAGCCAG--GGTCTTTAT  734

Query 727  G------------------------------------------  727
           .                                          
Sbjct 735  CACCACTCCACTCGATCCCCTGAATCCAGGGGATCAGATGTGG  777