Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470036
• Subject: NM_001077403.1
• Aligned Length: 2794
• Identities: 2474
• Gaps: 17

Alignment

Query    1  ATGGATATGTTTCCTCTCACCTGGGTTTTCTTAGCCCTCTACTTTTCAAGACACCAAGTGAGAGGCCAACCAGA  74
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||.||||||||.||||.|.|||
Sbjct    1  ATGGATATGTTTCCTCTTACCTGGGTTTTCTTAGCTCTGTACTTTTCAGGACACGAAGTGAGAAGCCAGCAAGA  74

Query   75  CCCACCGTGCGGAGGTCGTTTGAATTCCAAAGATGCTGGCTATATCACCTCTCCCGGTTACCCCCAGGACTACC  148
            .|||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|
Sbjct   75  TCCACCCTGCGGAGGTCGGCTGAATTCCAAAGATGCTGGCTACATCACTTCCCCAGGCTACCCCCAGGACTATC  148

Query  149  CCTCCCACCAGAACTGCGAGTGGATTGTTTACGCCCCCGAACCCAACCAGAAGATTGTCCTCAACTTCAACCCT  222
            ||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  CCTCCCACCAGAACTGTGAGTGGATTGTCTACGCCCCCGAACCCAACCAGAAGATTGTTCTCAACTTCAACCCT  222

Query  223  CACTTTGAAATCGAGAAGCACGACTGCAAGTATGACTTTATCGAGATTCGGGATGGGGACAGTGAATCCGCAGA  296
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  223  CACTTTGAAATCGAGAAACACGACTGCAAGTATGACTTCATTGAGATTCGGGATGGGGACAGTGAGTCAGCTGA  296

Query  297  CCTCCTGGGCAAACACTGTGGGAACATCGCCCCGCCCACCATCATCTCCTCGGGCTCCATGCTCTACATCAAGT  370
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||.|.||||||||||
Sbjct  297  CCTCCTGGGCAAGCACTGTGGGAACATCGCCCCGCCCACCATCATCTCCTCAGGCTCCGTGTTATACATCAAGT  370

Query  371  TCACCTCCGACTACGCCCGGCAGGGGGCAGGCTTCTCTCTGCGCTACGAGATCTTCAAGACAGGCTCTGAAGAT  444
            |||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  TCACCTCAGACTACGCCCGGCAGGGGGCAGGTTTCTCTCTACGCTATGAGATCTTCAAAACAGGCTCTGAAGAT  444

Query  445  TGCTCAAAAAACTTCACAAGCCCCAACGGGACCATCGAATCTCCTGGGTTTCCTGAGAAGTATCCACACAACTT  518
            ||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||..|
Sbjct  445  TGTTCCAAGAACTTTACAAGCCCCAATGGGACCATTGAATCTCCAGGGTTTCCAGAGAAGTATCCACACAATCT  518

Query  519  GGACTGCACCTTTACCATCCTGGCCAAACCCAAGATGGAGATCATCCTGCAGTTCCTGATCTTTGACCTGGAGC  592
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  519  GGACTGTACCTTCACCATCCTGGCCAAACCCAGGATGGAGATCATCCTACAGTTCCTGACCTTTGACCTGGAGC  592

Query  593  ATGACCCTTTGCAGGTGGGAGAGGGGGACTGCAAGTACGATTGGCTGGACATCTGGGATGGCATTCCACATGTT  666
            ||||||||.|.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGACCCTCTACAAGTGGGGGAAGGAGACTGTAAATATGACTGGCTGGACATCTGGGATGGCATTCCACATGTT  666

Query  667  GGCCCCCTGATTGGCAAGTACTGTGGGACCAAAACACCCTCTGAACTTCGTTCATCGACGGGGATCCTCTCCCT  740
            ||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||.||.||.||.|||||||||||||||.|
Sbjct  667  GGACCTCTGATTGGCAAGTACTGTGGGACGAAAACACCCTCCAAACTCCGCTCGTCCACGGGGATCCTCTCCTT  740

Query  741  GACCTTTCACACGGACATGGCGGTGGCCAAGGATGGCTTCTCTGCGCGTTACTACCTGGTCCACCAAGAGCCAC  814
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||..||.|||||||.|||||||
Sbjct  741  GACCTTTCACACGGACATGGCAGTGGCCAAGGATGGCTTCTCCGCACGTTACTATTTGATCCACCAGGAGCCAC  814

Query  815  TAGAGAACTTTCAGTGCAATGTTCCTCTGGGCATGGAGTCTGGCCGGATTGCTAATGAACAGATCAGTGCCTCA  888
            ..|||||.||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  815  CTGAGAATTTTCAGTGCAATGTCCCTTTGGGAATGGAGTCTGGCCGGATTGCTAATGAACAGATCAGTGCCTCC  888

Query  889  TCTACCTACTCTGATGGGAGGTGGACCCCTCAACAAAGCCGGCTCCATGGTGATGACAATGGCTGGACCCCCAA  962
            ||.||||.||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  TCCACCTTCTCTGATGGGAGGTGGACTCCTCAACAGAGCCGGCTCCATGGTGATGACAATGGCTGGACACCCAA  962

Query  963  CTTGGATTCCAACAAGGAGTATCTCCAGGTGGACCTGCGCTTTTTAACCATGCTCACGGCCATCGCAACACAGG  1036
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  963  TTTGGATTCCAACAAGGAGTATCTCCAGGTGGACCTGCGCTTCCTAACCATGCTCACAGCCATTGCAACACAGG  1036

Query 1037  GAGCGATTTCCAGGGAAACACAGAATGGCTACTATGTCAAATCCTACAAGCTGGAAGTCAGCACTAATGGAGAG  1110
            ||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1037  GAGCCATTTCCAGGGAAACCCAGAAAGGCTACTACGTCAAATCGTACAAGCTGGAAGTCAGCACAAATGGTGAA  1110

Query 1111  GACTGGATGGTGTACCGGCATGGCAAAAACCACAAGGTATTTCAAGCCAACAACGATGCAACTGAGGTGGTTCT  1184
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 1111  GATTGGATGGTCTACCGGCATGGCAAAAACCACAAGATATTCCAAGCGAACAATGATGCGACCGAGGTGGTGCT  1184

Query 1185  GAACAAGCTCCACGCTCCACTGCTGACAAGGTTTGTTAGAATCCGCCCTCAGACCTGGCACTCAGGTATCGCCC  1258
            .||||||||||||...|||||||||||..||||..|.||.||||||||.|||||.|||||.|..||.||.||||
Sbjct 1185  AAACAAGCTCCACATGCCACTGCTGACTCGGTTCATCAGGATCCGCCCGCAGACGTGGCATTTGGGCATTGCCC  1258

Query 1259  TCCGGCTGGAGCTCTTCGGCTGCCGGGTCACAGATGCTCCCTGCTCCAACATGCTGGGGATGCTCTCAGGCCTC  1332
            |.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  TTCGCCTGGAGCTCTTTGGCTGCCGGGTCACAGATGCACCCTGCTCCAACATGCTGGGGATGCTCTCGGGCCTC  1332

Query 1333  ATTGCAGACTCCCAGATCTCCGCCTCTTCCACCCAGGAATACCTCTGGAGCCCCAGTGCAGCCCGCCTGGTCAG  1406
            |||||.||..||||||||||.|||||.|||||||..||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1333  ATTGCTGATACCCAGATCTCTGCCTCCTCCACCCGAGAGTACCTCTGGAGCCCCAGTGCTGCCCGCCTGGTTAG  1406

Query 1407  CAGCCGCTCGGGCTGGTTCCCTCGAATCCCTCAGGCCCAGCCCGGTGAGGAGTGGCTTCAGGTAGATCTGGGAA  1480
            .||||||||.||||||||.|||||.|.||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1407  TAGCCGCTCTGGCTGGTTTCCTCGGAACCCTCAAGCCCAGCCAGGTGAAGAATGGCTTCAGGTAGACCTGGGGA  1480

Query 1481  CACCCAAGACAGTGAAAGGTGTCATCATCCAGGGAGCCCGCGGAGGAGACAGTATCACTGCTGTGGAAGCCAGA  1554
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1481  CACCCAAGACAGTGAAAGGGGTCATCATCCAGGGAGCCCGAGGAGGAGACAGCATCACTGCCGTGGAAGCCAGG  1554

Query 1555  GCATTTGTGCGCAAGTTCAAAGTCTCCTACAGCCTAAACGGCAAGGACTGGGAATACATTCAGGACCCCAGGAC  1628
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1555  GCGTTTGTACGCAAGTTCAAAGTCTCCTACAGCCTAAATGGCAAGGACTGGGAATATATCCAGGACCCCAGGAC  1628

Query 1629  CCAGCAGCCAAAGCTGTTCGAAGGGAACATGCACTATGACACCCCTGACATCCGAAGGTTTGACCCCATTCCGG  1702
            .||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||..||||.|
Sbjct 1629  TCAGCAGACAAAGCTGTTTGAAGGGAACATGCACTATGACACCCCTGACATCCGAAGGTTCGATCCTGTTCCAG  1702

Query 1703  CACAGTATGTGCGGGTATACCCGGAGAGGTGGTCGCCGGCGGGGATTGGGATGCGGCTGGAGGTGCTGGGCTGT  1776
            |.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGCAGTATGTGCGGGTGTACCCAGAGAGGTGGTCGCCAGCAGGCATCGGGATGAGGCTGGAGGTGCTGGGCTGT  1776

Query 1777  GACTGGACAGACTCCAAGCCCACGGTAGAGACGCTGGGACCCACTGTGAAGAGCGAAGAGACAACCACCCCCTA  1850
            ||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1777  GACTGGACAGACTCAAAGCCCACAGTGGAGACGCTGGGACCCACCGTGAAGAGTGAAGAGACTACCACCCCATA  1850

Query 1851  CCCCACCGAAGAGGAGGCCACAGAGTGTGGGGAGAACTGCAGCTTTGAGGATGACAAAGATTTGCAGCTCCCTT  1924
            .||||..||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1851  TCCCATGGATGAGGATGCCACCGAGTGTGGGGAAAACTGCAGCTTTGAGGATGACAAAGATTTGCAACTTCCTT  1924

Query 1925  CGGGATTCAATTGCAACTTCGATTTCCTCGAGGAGCCCTGTGGTTGGATGTATGACCATGCCAAGTGGCTCCGG  1998
            |.||||||||.||||||||.|||||.|..||.|||.|||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CAGGATTCAACTGCAACTTTGATTTTCCGGAAGAGACCTGTGGTTGGGTGTACGACCATGCCAAGTGGCTCCGG  1998

Query 1999  ACCACCTGGGCCAGCAGCTCCAGCCCAAACGACCGGACGTTTCCAGATGACAGGAATTTCTTGCGGCTGCAGAG  2072
            |.|||.|||..|||||||.|.|.|||.||.|||.|.||.|||||||||||||.|||.||||||...||||||||
Sbjct 1999  AGCACGTGGATCAGCAGCGCTAACCCCAATGACAGAACATTTCCAGATGACAAGAACTTCTTGAAACTGCAGAG  2072

Query 2073  TGACAGCCAGA-GAGAGGGCCAGTATGCCCGGCTCATCAGCCCCCCTGTCCACCTGCCCCGAAGCCCGGTGTGC  2145
            |||..||| || |||||||||||||.|..||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2073  TGATGGCC-GACGAGAGGGCCAGTACGGGCGGCTCATCAGCCCACCGGTGCACCTGCCCCGAAGCCCTGTGTGC  2145

Query 2146  ATGGAGTTCCAGTACCAGGCCACGGGCGGCCGCGGGGTGGCGCTGCAGGTGGTGCGGGAAGCCAGCCAGGAGAG  2219
            |||||||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2146  ATGGAGTTCCAGTACCAAGCCATGGGCGGCCACGGGGTGGCACTGCAGGTGGTTCGGGAAGCCAGCCAGGAAAG  2219

Query 2220  CAAGTTGCTGTGGGTCATCCGTGAGGACCAGGGCGGCGAGTGGAAGCACGGGCGGATCATCCTGCCCAGCTACG  2293
            |||..|.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 2220  CAAACTCCTTTGGGTCATCCGTGAGGACCAGGGCAGCGAGTGGAAGCACGGGCGCATTATCCTGCCCAGCTATG  2293

Query 2294  ACATGGAGTACCAGATTGTGTTCGAGGGAGTGATAGGGAAAGGACGTTCCGGAGAGATTGCCATTGATGACATT  2367
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||.||||.|||||||||
Sbjct 2294  ACATGGAGTATCAGATCGTGTTCGAGGGAGTGATAGGGAAGGGACGATCGGGAGAGATTTCCATCGATGACATT  2367

Query 2368  CGGATAAGCACTGATGTCCCACTGGAGAACTGCATGGAACCCATCTCGGCTTTTGC---------------AGT  2426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||               |||
Sbjct 2368  CGGATAAGCACTGATGTCCCACTGGAGAACTGCATGGAACCCATATCAGCTTTTGCAGGTGAGGATTTTAAAGT  2441

Query 2427  GGACATCCCAGAAATACATGAGAGAGAAGGATATGAAGATGAAATTGATGATGAATACGAGGTGGACTGGAGCA  2500
            ||||||||||||||..||||.|.||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|..||.|||||||
Sbjct 2442  GGACATCCCAGAAACCCATGGGGGAGAGGGCTATGAAGATGAGATTGATGATGAATATGAAGGAGATTGGAGCA  2515

Query 2501  ATTCTTCTTCTGCAACCTCAGGGTCTGGCGCCCCCTCGACCGACAAAGAAAAGAGCTGGCTGTACACCCTGGAT  2574
            |.||||||||..|.|||||||||.||||.|.||||||..|.|.|||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2516  ACTCTTCTTCCTCTACCTCAGGGGCTGGTGACCCCTCATCTGGCAAAGAAAAGAGCTGGCTGTACACCCTAGAT  2589

Query 2575  CCCATCCTCATCACCATCATCGCCATGAGCTCACTGGGCGTCCTCCTGGGGGCCACCTGTGCAGGCCTCCTGCT  2648
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 2590  CCCATTCTGATCACCATCATCGCCATGAGCTCGCTGGGGGTCCTGCTGGGGGCCACCTGTGCGGGCCTCCTCCT  2663

Query 2649  CTACTGCACCTGTTCCTACTCGGGCCTGAGCTCCCGAAGCTGCACCACACTGGAGAACTACAACTTCGAGCTCT  2722
            .|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||..|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2664  TTACTGCACCTGCTCCTATTCGGGTCTGAGTTCGAGGAGCTGCACCACACTGGAGAACTACAACTTTGAGCTCT  2737

Query 2723  ACGATGGCCTTAAGCACAAGGTCAAGATGAACCACCAAAAGTGCTGCTCCGAGGCA  2778
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 2738  ACGATGGCCTCAAGCACAAGGTCAAGATCAATCATCAGAAGTGCTGCTCGGAGGCA  2793