Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470036
• Subject: NM_001077406.1
• Aligned Length: 2869
• Identities: 2331
• Gaps: 242

Alignment

Query    1  ATGGATATGTTTCCTCTCACCTGGGTTTTCTTAGCCCTCTACTTTTCAAGACACCAAGTGAGAGGCCAACCAGA  74
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||.||||||||.||||.|.|||
Sbjct    1  ATGGATATGTTTCCTCTTACCTGGGTTTTCTTAGCTCTGTACTTTTCAGGACACGAAGTGAGAAGCCAGCAAGA  74

Query   75  CCCACCGTGCGGAGGTCGTTTGAATTCCAAAGATGCTGGCTATATCACCTCTCCCGGTTACCCCCAGGACTACC  148
            .|||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|
Sbjct   75  TCCACCCTGCGGAGGTCGGCTGAATTCCAAAGATGCTGGCTACATCACTTCCCCAGGCTACCCCCAGGACTATC  148

Query  149  CCTCCCACCAGAACTGCGAGTGGATTGTTTACGCCCCCGAACCCAACCAGAAGATTGTCCTCAACTTCAACCCT  222
            ||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  CCTCCCACCAGAACTGTGAGTGGATTGTCTACGCCCCCGAACCCAACCAGAAGATTGTTCTCAACTTCAACCCT  222

Query  223  CACTTTGAAATCGAGAAGCACGACTGCAAGTATGACTTTATCGAGATTCGGGATGGGGACAGTGAATCCGCAGA  296
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  223  CACTTTGAAATCGAGAAACACGACTGCAAGTATGACTTCATTGAGATTCGGGATGGGGACAGTGAGTCAGCTGA  296

Query  297  CCTCCTGGGCAAACACTGTGGGAACATCGCCCCGCCCACCATCATCTCCTCGGGCTCCATGCTCTACATCAAGT  370
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||.|.||||||||||
Sbjct  297  CCTCCTGGGCAAGCACTGTGGGAACATCGCCCCGCCCACCATCATCTCCTCAGGCTCCGTGTTATACATCAAGT  370

Query  371  TCACCTCCGACTACGCCCGGCAGGGGGCAGGCTTCTCTCTGCGCTACGAGATCTTCAAGACAGGCTCTGAAGAT  444
            |||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  TCACCTCAGACTACGCCCGGCAGGGGGCAGGTTTCTCTCTACGCTATGAGATCTTCAAAACAGGCTCTGAAGAT  444

Query  445  TGCTCAAAAAACTTCACAAGCCCCAACGGGACCATCGAATCTCCTGGGTTTCCTGAGAAGTATCCACACAACTT  518
            ||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||..|
Sbjct  445  TGTTCCAAGAACTTTACAAGCCCCAATGGGACCATTGAATCTCCAGGGTTTCCAGAGAAGTATCCACACAATCT  518

Query  519  GGACTGCACCTTTACCATCCTGGCCAAACCCAAGATGGAGATCATCCTGCAGTTCCTGATCTTTGACCTGGAGC  592
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  519  GGACTGTACCTTCACCATCCTGGCCAAACCCAGGATGGAGATCATCCTACAGTTCCTGACCTTTGACCTGGAGC  592

Query  593  ATGACCCTTTGCAGGTGGGAGAGGGGGACTGCAAGTACGATTGGCTGGACATCTGGGATGGCATTCCACATGTT  666
            ||||||||.|.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGACCCTCTACAAGTGGGGGAAGGAGACTGTAAATATGACTGGCTGGACATCTGGGATGGCATTCCACATGTT  666

Query  667  GGCCCCCTGATTGGCAAGTACTGTGGGACCAAAACACCCTCTGAACTTCGTTCATCGACGGGGATCCTCTCCCT  740
            ||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||.||.||.||.|||||||||||||||.|
Sbjct  667  GGACCTCTGATTGGCAAGTACTGTGGGACGAAAACACCCTCCAAACTCCGCTCGTCCACGGGGATCCTCTCCTT  740

Query  741  GACCTTTCACACGGACATGGCGGTGGCCAAGGATGGCTTCTCTGCGCGTTACTACCTGGTCCACCAAGAGCCAC  814
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||..||.|||||||.|||||||
Sbjct  741  GACCTTTCACACGGACATGGCAGTGGCCAAGGATGGCTTCTCCGCACGTTACTATTTGATCCACCAGGAGCCAC  814

Query  815  TAGAGAACTTTCAGTGCAATGTTCCTCTGGGCATGGAGTCTGGCCGGATTGCTAATGAACAGATCAGTGCCTCA  888
            ..|||||.||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  815  CTGAGAATTTTCAGTGCAATGTCCCTTTGGGAATGGAGTCTGGCCGGATTGCTAATGAACAGATCAGTGCCTCC  888

Query  889  TCTACCTACTCTGATGGGAGGTGGACCCCTCAACAAAGCCGGCTCCATGGTGATGACAATGGCTGGACCCCCAA  962
            ||.||||.||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  TCCACCTTCTCTGATGGGAGGTGGACTCCTCAACAGAGCCGGCTCCATGGTGATGACAATGGCTGGACACCCAA  962

Query  963  CTTGGATTCCAACAAGGAGTATCTCCAGGTGGACCTGCGCTTTTTAACCATGCTCACGGCCATCGCAACACAGG  1036
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  963  TTTGGATTCCAACAAGGAGTATCTCCAGGTGGACCTGCGCTTCCTAACCATGCTCACAGCCATTGCAACACAGG  1036

Query 1037  GAGCGATTTCCAGGGAAACACAGAATGGCTACTATGTCAAATCCTACAAGCTGGAAGTCAGCACTAATGGAGAG  1110
            ||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1037  GAGCCATTTCCAGGGAAACCCAGAAAGGCTACTACGTCAAATCGTACAAGCTGGAAGTCAGCACAAATGGTGAA  1110

Query 1111  GACTGGATGGTGTACCGGCATGGCAAAAACCACAAGGTATTTCAAGCCAACAACGATGCAACTGAGGTGGTTCT  1184
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 1111  GATTGGATGGTCTACCGGCATGGCAAAAACCACAAGATATTCCAAGCGAACAATGATGCGACCGAGGTGGTGCT  1184

Query 1185  GAACAAGCTCCACGCTCCACTGCTGACAAGGTTTGTTAGAATCCGCCCTCAGACCTGGCACTCAGGTATCGCCC  1258
            .||||||||||||...|||||||||||..||||..|.||.||||||||.|||||.|||||.|..||.||.||||
Sbjct 1185  AAACAAGCTCCACATGCCACTGCTGACTCGGTTCATCAGGATCCGCCCGCAGACGTGGCATTTGGGCATTGCCC  1258

Query 1259  TCCGGCTGGAGCTCTTCGGCTGCCGGGTCACAGATGCTCCCTGCTCCAACATGCTGGGGATGCTCTCAGGCCTC  1332
            |.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  TTCGCCTGGAGCTCTTTGGCTGCCGGGTCACAGATGCACCCTGCTCCAACATGCTGGGGATGCTCTCGGGCCTC  1332

Query 1333  ATTGCAGACTCCCAGATCTCCGCCTCTTCCACCCAGGAATACCTCTGGAGCCCCAGTGCAGCCCGCCTGGTCAG  1406
            |||||.||..||||||||||.|||||.|||||||..||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1333  ATTGCTGATACCCAGATCTCTGCCTCCTCCACCCGAGAGTACCTCTGGAGCCCCAGTGCTGCCCGCCTGGTTAG  1406

Query 1407  CAGCCGCTCGGGCTGGTTCCCTCGAATCCCTCAGGCCCAGCCCGGTGAGGAGTGGCTTCAGGTAGATCTGGGAA  1480
            .||||||||.||||||||.|||||.|.||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1407  TAGCCGCTCTGGCTGGTTTCCTCGGAACCCTCAAGCCCAGCCAGGTGAAGAATGGCTTCAGGTAGACCTGGGGA  1480

Query 1481  CACCCAAGACAGTGAAAGGTGTCATCATCCAGGGAGCCCGCGGAGGAGACAGTATCACTGCTGTGGAAGCCAGA  1554
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1481  CACCCAAGACAGTGAAAGGGGTCATCATCCAGGGAGCCCGAGGAGGAGACAGCATCACTGCCGTGGAAGCCAGG  1554

Query 1555  GCATTTGTGCGCAAGTTCAAAGTCTCCTACAGCCTAAACGGCAAGGACTGGGAATACATTCAGGACCCCAGGAC  1628
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1555  GCGTTTGTACGCAAGTTCAAAGTCTCCTACAGCCTAAATGGCAAGGACTGGGAATATATCCAGGACCCCAGGAC  1628

Query 1629  CCAGCAGCCAAAGCTGTTCGAAGGGAACATGCACTATGACACCCCTGACATCCGAAGGTTTGACCCCATTCCGG  1702
            .||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||..||||.|
Sbjct 1629  TCAGCAGACAAAGCTGTTTGAAGGGAACATGCACTATGACACCCCTGACATCCGAAGGTTCGATCCTGTTCCAG  1702

Query 1703  CACAGTATGTGCGGGTATACCCGGAGAGGTGGTCGCCGGCGGGGATTGGGATGCGGCTGGAGGTGCTGGGCTGT  1776
            |.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGCAGTATGTGCGGGTGTACCCAGAGAGGTGGTCGCCAGCAGGCATCGGGATGAGGCTGGAGGTGCTGGGCTGT  1776

Query 1777  GACTGGACAGACTCCAAGCCCACGGTAGAGACGCTGGGACCCACTGTGAAGAGCGAAGAGACAACCACCCCCTA  1850
            ||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1777  GACTGGACAGACTCAAAGCCCACAGTGGAGACGCTGGGACCCACCGTGAAGAGTGAAGAGACTACCACCCCATA  1850

Query 1851  CCCCACCGAAGAGGAGGCCACAGAGTGTGGGGAGAACTGCAGCTTTGAGGATGACAAAGATTTGCAGCTCCCTT  1924
            .||||..||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1851  TCCCATGGATGAGGATGCCACCGAGTGTGGGGAAAACTGCAGCTTTGAGGATGACAAAGATTTGCAACTTCCTT  1924

Query 1925  CGGGATTCAATTGCAACTTCGATTTCCTCGAGGAGCCCTGTGGTTGGATGTATGACCATGCCAAGTGGCTCCGG  1998
            |.||||||||.||||||||.|||||.|..||.|||.|||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CAGGATTCAACTGCAACTTTGATTTTCCGGAAGAGACCTGTGGTTGGGTGTACGACCATGCCAAGTGGCTCCGG  1998

Query 1999  ACCACCTGGGCCAGCAGCTCCAGCCCAAACGACCGGACGTTTCCAGATGACAGGAATTTCTTGCGGCTGCAGAG  2072
            |.|||.|||..|||||||.|.|.|||.||.|||.|.||.|||||||||||||.|||.||||||...||||||||
Sbjct 1999  AGCACGTGGATCAGCAGCGCTAACCCCAATGACAGAACATTTCCAGATGACAAGAACTTCTTGAAACTGCAGAG  2072

Query 2073  TGACAGCCAGA-GAGAGGGCCAGTATGCCCGGCTCATCAGCCCCCCTGTCCACCTGCCCCGAAGCCCGGTGTGC  2145
            |||..||| || |||||||||||||.|..||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2073  TGATGGCC-GACGAGAGGGCCAGTACGGGCGGCTCATCAGCCCACCGGTGCACCTGCCCCGAAGCCCTGTGTGC  2145

Query 2146  ATGGAGTTCCAGTACCAGGCCACGGGCGGCCGCGGGGTGGCGCTGCAGGTGGTGCGGGAAGCCAGCCAGGAGAG  2219
            |||||||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2146  ATGGAGTTCCAGTACCAAGCCATGGGCGGCCACGGGGTGGCACTGCAGGTGGTTCGGGAAGCCAGCCAGGAAAG  2219

Query 2220  CAAGTTGCTGTGGGTCATCCGTGAGGACCAGGGCGGCGAGTGGAAGCACGGGCGGATCATCCTGCCCAGCTACG  2293
            |||..|.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 2220  CAAACTCCTTTGGGTCATCCGTGAGGACCAGGGCAGCGAGTGGAAGCACGGGCGCATTATCCTGCCCAGCTATG  2293

Query 2294  ACATGGAGTACCAGATTGTGTTCGAGGGAGTGATAGGGAAAGGACGTTCCGGAGAGATTGCCATTGATGACATT  2367
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||.||||.|||||||||
Sbjct 2294  ACATGGAGTATCAGATCGTGTTCGAGGGAGTGATAGGGAAGGGACGATCGGGAGAGATTTCCATCGATGACATT  2367

Query 2368  CGGATAAGCACTGATGTCCCACTGGAGAACTGCATGGAACCCATCTCGGCTTTTGCA-GTGGACATCCCAGAAA  2440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||| |||             
Sbjct 2368  CGGATAAGCACTGATGTCCCACTGGAGAACTGCATGGAACCCATATCAGCTTTTGCAGGTG-------------  2428

Query 2441  TACATGAGAGAGAAGGATATGAAGATGAAATTGATGATGAATACGAGGTGGACTGGAGCAATTCTTCTTCTGCA  2514
                         |||||.|.||                      |||.|                     |||
Sbjct 2429  -------------AGGATTTTAA----------------------AGGGG---------------------GCA  2446

Query 2515  ACCT-----CAGGGTCTGGCGCCCCCTCGACCGA---CAAAGAAAAGAGCTGGCTGTACA------CCCTGGAT  2574
            .|||     ||||               ||||||   ||.||            ||.|||      ||.||.|.
Sbjct 2447  CCCTCCCGCCAGG---------------GACCGAGCCCACAG------------TGGACACGGTGCCCGTGCAG  2493

Query 2575  CCCATCCTCATCACCATCATCGCCATGAGCTCACTG------------GGCGTCCTCCTGGGGGCCACCT----  2632
            |||||||                   .|||..||||            ||||.||    ||||||..|.|    
Sbjct 2494  CCCATCC-------------------CAGCCTACTGGTATTACGTTATGGCGGCC----GGGGGCGCCGTGCTG  2544

Query 2633  GTGCAGGCCTCC----------------TGCTCTACT-GCACCTGTTC--CTACTCGGGCCTGAGCTCCC--GA  2685
            ||||.|||||||                |||||.||| .||||.||||  |||..|||          ||  ||
Sbjct 2545  GTGCTGGCCTCCGTCGTCCTGGCCCTGGTGCTCCACTACCACCGGTTCCGCTATGCGG----------CCAAGA  2608

Query 2686  AG--------CTGCACCACACTGGAGA-------ACTACAACTTCGAG----CTCTACGATGGCCTTAAGCACA  2740
            ||        ||.||.||| ||..|.|       ||||||.|..||.|    |||     ||||          
Sbjct 2609  AGACCGATCACTCCATCAC-CTACAAAACCTCCCACTACACCAACGGGGCCCCTC-----TGGC----------  2666

Query 2741  AGGTCAAG------------ATGAACC---ACCAAAAGTGCTGCTCCGAGGCA----  2778
             ||||.||            ||.||.|   |.|||.||.|..||||    |||    
Sbjct 2667  -GGTCGAGCCCACCCTAACCATTAAGCTAGAGCAAGAGCGGGGCTC----GCACTGC  2718