Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470036
- Subject:
- NM_001077407.1
- Aligned Length:
- 2861
- Identities:
- 2324
- Gaps:
- 241
Alignment
Query 1 ATGGATATGTTTCCTCTCACCTGGGTTTTCTTAGCCCTCTACTTTTCAAGACACCAAGTGAGAGGCCAACCAGA 74
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||.||||||||.||||.|.|||
Sbjct 1 ATGGATATGTTTCCTCTTACCTGGGTTTTCTTAGCTCTGTACTTTTCAGGACACGAAGTGAGAAGCCAGCAAGA 74
Query 75 CCCACCGTGCGGAGGTCGTTTGAATTCCAAAGATGCTGGCTATATCACCTCTCCCGGTTACCCCCAGGACTACC 148
.|||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 75 TCCACCCTGCGGAGGTCGGCTGAATTCCAAAGATGCTGGCTACATCACTTCCCCAGGCTACCCCCAGGACTATC 148
Query 149 CCTCCCACCAGAACTGCGAGTGGATTGTTTACGCCCCCGAACCCAACCAGAAGATTGTCCTCAACTTCAACCCT 222
||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 149 CCTCCCACCAGAACTGTGAGTGGATTGTCTACGCCCCCGAACCCAACCAGAAGATTGTTCTCAACTTCAACCCT 222
Query 223 CACTTTGAAATCGAGAAGCACGACTGCAAGTATGACTTTATCGAGATTCGGGATGGGGACAGTGAATCCGCAGA 296
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 223 CACTTTGAAATCGAGAAACACGACTGCAAGTATGACTTCATTGAGATTCGGGATGGGGACAGTGAGTCAGCTGA 296
Query 297 CCTCCTGGGCAAACACTGTGGGAACATCGCCCCGCCCACCATCATCTCCTCGGGCTCCATGCTCTACATCAAGT 370
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||.|.||||||||||
Sbjct 297 CCTCCTGGGCAAGCACTGTGGGAACATCGCCCCGCCCACCATCATCTCCTCAGGCTCCGTGTTATACATCAAGT 370
Query 371 TCACCTCCGACTACGCCCGGCAGGGGGCAGGCTTCTCTCTGCGCTACGAGATCTTCAAGACAGGCTCTGAAGAT 444
|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 TCACCTCAGACTACGCCCGGCAGGGGGCAGGTTTCTCTCTACGCTATGAGATCTTCAAAACAGGCTCTGAAGAT 444
Query 445 TGCTCAAAAAACTTCACAAGCCCCAACGGGACCATCGAATCTCCTGGGTTTCCTGAGAAGTATCCACACAACTT 518
||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||..|
Sbjct 445 TGTTCCAAGAACTTTACAAGCCCCAATGGGACCATTGAATCTCCAGGGTTTCCAGAGAAGTATCCACACAATCT 518
Query 519 GGACTGCACCTTTACCATCCTGGCCAAACCCAAGATGGAGATCATCCTGCAGTTCCTGATCTTTGACCTGGAGC 592
||||||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 519 GGACTGTACCTTCACCATCCTGGCCAAACCCAGGATGGAGATCATCCTACAGTTCCTGACCTTTGACCTGGAGC 592
Query 593 ATGACCCTTTGCAGGTGGGAGAGGGGGACTGCAAGTACGATTGGCTGGACATCTGGGATGGCATTCCACATGTT 666
||||||||.|.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGACCCTCTACAAGTGGGGGAAGGAGACTGTAAATATGACTGGCTGGACATCTGGGATGGCATTCCACATGTT 666
Query 667 GGCCCCCTGATTGGCAAGTACTGTGGGACCAAAACACCCTCTGAACTTCGTTCATCGACGGGGATCCTCTCCCT 740
||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||.||.||.||.|||||||||||||||.|
Sbjct 667 GGACCTCTGATTGGCAAGTACTGTGGGACGAAAACACCCTCCAAACTCCGCTCGTCCACGGGGATCCTCTCCTT 740
Query 741 GACCTTTCACACGGACATGGCGGTGGCCAAGGATGGCTTCTCTGCGCGTTACTACCTGGTCCACCAAGAGCCAC 814
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||..||.|||||||.|||||||
Sbjct 741 GACCTTTCACACGGACATGGCAGTGGCCAAGGATGGCTTCTCCGCACGTTACTATTTGATCCACCAGGAGCCAC 814
Query 815 TAGAGAACTTTCAGTGCAATGTTCCTCTGGGCATGGAGTCTGGCCGGATTGCTAATGAACAGATCAGTGCCTCA 888
..|||||.||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 815 CTGAGAATTTTCAGTGCAATGTCCCTTTGGGAATGGAGTCTGGCCGGATTGCTAATGAACAGATCAGTGCCTCC 888
Query 889 TCTACCTACTCTGATGGGAGGTGGACCCCTCAACAAAGCCGGCTCCATGGTGATGACAATGGCTGGACCCCCAA 962
||.||||.||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 889 TCCACCTTCTCTGATGGGAGGTGGACTCCTCAACAGAGCCGGCTCCATGGTGATGACAATGGCTGGACACCCAA 962
Query 963 CTTGGATTCCAACAAGGAGTATCTCCAGGTGGACCTGCGCTTTTTAACCATGCTCACGGCCATCGCAACACAGG 1036
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 963 TTTGGATTCCAACAAGGAGTATCTCCAGGTGGACCTGCGCTTCCTAACCATGCTCACAGCCATTGCAACACAGG 1036
Query 1037 GAGCGATTTCCAGGGAAACACAGAATGGCTACTATGTCAAATCCTACAAGCTGGAAGTCAGCACTAATGGAGAG 1110
||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1037 GAGCCATTTCCAGGGAAACCCAGAAAGGCTACTACGTCAAATCGTACAAGCTGGAAGTCAGCACAAATGGTGAA 1110
Query 1111 GACTGGATGGTGTACCGGCATGGCAAAAACCACAAGGTATTTCAAGCCAACAACGATGCAACTGAGGTGGTTCT 1184
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 1111 GATTGGATGGTCTACCGGCATGGCAAAAACCACAAGATATTCCAAGCGAACAATGATGCGACCGAGGTGGTGCT 1184
Query 1185 GAACAAGCTCCACGCTCCACTGCTGACAAGGTTTGTTAGAATCCGCCCTCAGACCTGGCACTCAGGTATCGCCC 1258
.||||||||||||...|||||||||||..||||..|.||.||||||||.|||||.|||||.|..||.||.||||
Sbjct 1185 AAACAAGCTCCACATGCCACTGCTGACTCGGTTCATCAGGATCCGCCCGCAGACGTGGCATTTGGGCATTGCCC 1258
Query 1259 TCCGGCTGGAGCTCTTCGGCTGCCGGGTCACAGATGCTCCCTGCTCCAACATGCTGGGGATGCTCTCAGGCCTC 1332
|.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259 TTCGCCTGGAGCTCTTTGGCTGCCGGGTCACAGATGCACCCTGCTCCAACATGCTGGGGATGCTCTCGGGCCTC 1332
Query 1333 ATTGCAGACTCCCAGATCTCCGCCTCTTCCACCCAGGAATACCTCTGGAGCCCCAGTGCAGCCCGCCTGGTCAG 1406
|||||.||..||||||||||.|||||.|||||||..||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1333 ATTGCTGATACCCAGATCTCTGCCTCCTCCACCCGAGAGTACCTCTGGAGCCCCAGTGCTGCCCGCCTGGTTAG 1406
Query 1407 CAGCCGCTCGGGCTGGTTCCCTCGAATCCCTCAGGCCCAGCCCGGTGAGGAGTGGCTTCAGGTAGATCTGGGAA 1480
.||||||||.||||||||.|||||.|.||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1407 TAGCCGCTCTGGCTGGTTTCCTCGGAACCCTCAAGCCCAGCCAGGTGAAGAATGGCTTCAGGTAGACCTGGGGA 1480
Query 1481 CACCCAAGACAGTGAAAGGTGTCATCATCCAGGGAGCCCGCGGAGGAGACAGTATCACTGCTGTGGAAGCCAGA 1554
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1481 CACCCAAGACAGTGAAAGGGGTCATCATCCAGGGAGCCCGAGGAGGAGACAGCATCACTGCCGTGGAAGCCAGG 1554
Query 1555 GCATTTGTGCGCAAGTTCAAAGTCTCCTACAGCCTAAACGGCAAGGACTGGGAATACATTCAGGACCCCAGGAC 1628
||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1555 GCGTTTGTACGCAAGTTCAAAGTCTCCTACAGCCTAAATGGCAAGGACTGGGAATATATCCAGGACCCCAGGAC 1628
Query 1629 CCAGCAGCCAAAGCTGTTCGAAGGGAACATGCACTATGACACCCCTGACATCCGAAGGTTTGACCCCATTCCGG 1702
.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||..||||.|
Sbjct 1629 TCAGCAGACAAAGCTGTTTGAAGGGAACATGCACTATGACACCCCTGACATCCGAAGGTTCGATCCTGTTCCAG 1702
Query 1703 CACAGTATGTGCGGGTATACCCGGAGAGGTGGTCGCCGGCGGGGATTGGGATGCGGCTGGAGGTGCTGGGCTGT 1776
|.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CGCAGTATGTGCGGGTGTACCCAGAGAGGTGGTCGCCAGCAGGCATCGGGATGAGGCTGGAGGTGCTGGGCTGT 1776
Query 1777 GACTGGACAGACTCCAAGCCCACGGTAGAGACGCTGGGACCCACTGTGAAGAGCGAAGAGACAACCACCCCCTA 1850
||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1777 GACTGGACAGACTCAAAGCCCACAGTGGAGACGCTGGGACCCACCGTGAAGAGTGAAGAGACTACCACCCCATA 1850
Query 1851 CCCCACCGAAGAGGAGGCCACAGAGTGTGGGGAGAACTGCAGCTTTGAGGATGACAAAGATTTGCAGCTCCCTT 1924
.||||..||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1851 TCCCATGGATGAGGATGCCACCGAGTGTGGGGAAAACTGCAGCTTTGAGGATGACAAAGATTTGCAACTTCCTT 1924
Query 1925 CGGGATTCAATTGCAACTTCGATTTCCTCGAGGAGCCCTGTGGTTGGATGTATGACCATGCCAAGTGGCTCCGG 1998
|.||||||||.||||||||.|||||.|..||.|||.|||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CAGGATTCAACTGCAACTTTGATTTTCCGGAAGAGACCTGTGGTTGGGTGTACGACCATGCCAAGTGGCTCCGG 1998
Query 1999 ACCACCTGGGCCAGCAGCTCCAGCCCAAACGACCGGACGTTTCCAGATGACAGGAATTTCTTGCGGCTGCAGAG 2072
|.|||.|||..|||||||.|.|.|||.||.|||.|.||.|||||||||||||.|||.||||||...||||||||
Sbjct 1999 AGCACGTGGATCAGCAGCGCTAACCCCAATGACAGAACATTTCCAGATGACAAGAACTTCTTGAAACTGCAGAG 2072
Query 2073 TGACAGCCAGA-GAGAGGGCCAGTATGCCCGGCTCATCAGCCCCCCTGTCCACCTGCCCCGAAGCCCGGTGTGC 2145
|||..||| || |||||||||||||.|..||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2073 TGATGGCC-GACGAGAGGGCCAGTACGGGCGGCTCATCAGCCCACCGGTGCACCTGCCCCGAAGCCCTGTGTGC 2145
Query 2146 ATGGAGTTCCAGTACCAGGCCACGGGCGGCCGCGGGGTGGCGCTGCAGGTGGTGCGGGAAGCCAGCCAGGAGAG 2219
|||||||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2146 ATGGAGTTCCAGTACCAAGCCATGGGCGGCCACGGGGTGGCACTGCAGGTGGTTCGGGAAGCCAGCCAGGAAAG 2219
Query 2220 CAAGTTGCTGTGGGTCATCCGTGAGGACCAGGGCGGCGAGTGGAAGCACGGGCGGATCATCCTGCCCAGCTACG 2293
|||..|.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 2220 CAAACTCCTTTGGGTCATCCGTGAGGACCAGGGCAGCGAGTGGAAGCACGGGCGCATTATCCTGCCCAGCTATG 2293
Query 2294 ACATGGAGTACCAGATTGTGTTCGAGGGAGTGATAGGGAAAGGACGTTCCGGAGAGATTGCCATTGATGACATT 2367
||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||.||||.|||||||||
Sbjct 2294 ACATGGAGTATCAGATCGTGTTCGAGGGAGTGATAGGGAAGGGACGATCGGGAGAGATTTCCATCGATGACATT 2367
Query 2368 CGGATAAGCACTGATGTCCCACTGGAGAACTGCATGGAACCCATCTCGGCTTTTGCAGTGGACATC------CC 2435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||.||.||.| ||
Sbjct 2368 CGGATAAGCACTGATGTCCCACTGGAGAACTGCATGGAACCCATATCAGCTTTTGCAGGGGGCACCCTCCCGCC 2441
Query 2436 AGAAATACATGAGAGAGAAGGATATGAAGATGAAATTGATGATGAATACGAGGTGGACTGGAGCAATTCTTCTT 2509
|| |||| .||||
Sbjct 2442 AG----------------------------------------------------GGAC-CGAGC---------- 2452
Query 2510 CTGCAACCTCAGGGTCTGGCGCCCCCTCGACCGACAAAGAAAAGAGCTGGCTGTACA-CCCTGGATCCCATCCT 2582
||.|||.| |||| .|.||.|.||.|| ||| ||||||.|||
Sbjct 2453 ------CCACAGTG------------------GACA--------CGGTGCCCGTGCAGCCC---ATCCCAGCCT 2491
Query 2583 CATCACCATCATCGCCATGAGCTCACTG------------GGCGTCCTCCTGGGGGCCACCT----GTGCAGGC 2640
|||| ||||.|| ||||||..|.| ||||.|||
Sbjct 2492 ------------------------ACTGGTATTACGTTATGGCGGCC----GGGGGCGCCGTGCTGGTGCTGGC 2537
Query 2641 CTCC----------------TGCTCTACT-GCACCTGTTC--CTACTCGGGCCTGAGCTCCC--GAAG------ 2687
|||| |||||.||| .||||.|||| |||..||| || ||||
Sbjct 2538 CTCCGTCGTCCTGGCCCTGGTGCTCCACTACCACCGGTTCCGCTATGCGG----------CCAAGAAGACCGAT 2601
Query 2688 --CTGCACCACACTGGAGA-------ACTACAACTTCGAG----CTCTACGATGGCCTTAAGCACAAGGTCAAG 2748
||.||.||| ||..|.| ||||||.|..||.| ||| |||| ||||.||
Sbjct 2602 CACTCCATCAC-CTACAAAACCTCCCACTACACCAACGGGGCCCCTC-----TGGC-----------GGTCGAG 2658
Query 2749 ------------ATGAACC---ACCAAAAGTGCTGCTCCGAGGCA---- 2778
||.||.| |.|||.||.|..|||| |||
Sbjct 2659 CCCACCCTAACCATTAAGCTAGAGCAAGAGCGGGGCTC----GCACTGC 2703