Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000470064
Subject:
NM_175312.4
Aligned Length:
1221
Identities:
1085
Gaps:
18

Alignment

Query    1  ATGGAGCCAGGGGCC-GGCGGCCGAAATACTGCTCGTGCGCAGAGGGCCG-----GGTCCCCGAACACTCCGCC  68
            |||||||| |||||| ||.||||||           .||||||.|.||.|     ||.||||||||.|..|||.
Sbjct    1  ATGGAGCC-GGGGCCGGGTGGCCGA-----------GGCGCAGCGCGCGGACAGCGGCCCCCGAACGCCGCGCA  62

Query   69  GCCCCGGGAGCAGGAGCGGAAACTGGAGCAGGAGAAGCTCTCCGGTGTGGTGAAGAGCGTCCACCGGCGGCTCC  142
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct   63  GCCCCGGGAGCAGGAGCGGAAGCTGGAGCAGGAGAAGCTGTCCGGGGTGGTGAAGAGCGTTCATCGGCGGCTCC  136

Query  143  GCAAGAAGTACCGAGAAGTGGGAGATTTTGATAAGATCTGGCGAGAACACTGTGAGGATGAAGAAACTCTTTGT  216
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||.|||||.
Sbjct  137  GCAAGAAGTACCGCGAAGTGGGAGACTTTGATAAGATCTGGCGAGAACACTGTGAAGATGCGGAAACACTTTGC  210

Query  217  GAATATGCCGTTGCAATGAAAAATTTGGCAGATAATCATTGGGCAAAAACTTGTGAGGGCGAAGGTCGTATTGA  290
            ||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  211  GAATATGCTGTTGCAATGAAAAATCTGGCAGATAATCACTGGGCAAAAACTTGTGAGGGTGAAGGTCGCATTGA  284

Query  291  ATGGTGTTGTAGTGTATGCAGAGAATATTTCCAAAATGGTGGGAAGAGAAAAGCACTTGAGAAAGATGAAAAAA  364
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  285  ATGGTGTTGTAGTGTATGCAGAGAGTACTTCCAAAATGGTGGGAAAAGAAAAGCACTTGAGAAAGATGAAAAAC  358

Query  365  GAGCTGTACTTGCCACTAAGACCACTCCAGCCTTAAATATGCATGAGTCTTCTCAACTTGAAGGTCATTTAACC  438
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||.||||||||||||.||||||.
Sbjct  359  GAGCTGTCCTCGCCACTAAGACCACTCCAGCCTTAAACGTGCACGAGTCTTCTAAACTTGAAGGTCCTTTAACA  432

Query  439  AACCTCAGCTTTACAAACCCTGAATTTATAACTGAGTTGCTACAAGCCTCAGGAAAAATCAGATTACTTGATGT  512
            ||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  433  AACCTCAGCTTTACAAGCCCTGACTTTATAACTGAGTTGCTTCAAGCCTCAGGAAAGATCAGATTACTTGATGT  506

Query  513  TGGCAGCTGCTTTAACCCATTTCTGAAGTTTGAAGAATTTCTAACTGTTGGCATAGATATTGTACCTGCTGTAG  586
            |||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  507  TGGCAGCTGCTTTAATCCATTTTTGAAGTTTGAAGAATTTTTAACTGTTGGCATAGATATTGTACCTGCTGTAG  580

Query  587  AGAGTGTCTATAAATGTGATTTCCTGAACTTACAGCTTCAGCAACCACTCCAGCTTGCACAGGATGCTATAGAT  660
            |||||||.|||||.|||||.|||||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  581  AGAGTGTGTATAAGTGTGACTTCCTGAACCTGCAGCTGCAGCAGCCACTCCAGCTTGCACAAGATGCTATAGAT  654

Query  661  GCTTTTTTGAAGCAGCTGAAAAACCCTATTGATTCTCTTCCTGGAGAGCTTTTCCATGTGGTTGTTTTCTCTCT  734
            ||||||.||||||||||||.|||.|||||||||.|||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  655  GCTTTTCTGAAGCAGCTGAGAAATCCTATTGATGCTCTTCCGGGGGAACTTTTTCATGTGGTTGTCTTCTCTCT  728

Query  735  CCTTCTTTCTTATTTTCCATCTCCTTACCAGCGATGGATTTGCTGCAAGAAAGCCCATGAACTGTTAGTGTTAA  808
            |||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|.|
Sbjct  729  CCTTCTTTCCTATTTTCCATCACCCTACCAGCGATGGATTTGCTGCAAGAAAGCCCATGAGCTGTTAGTCCTGA  802

Query  809  ATGGTTTATTACTAATCATCACACCTGATTCCTCCCATCAGAACCGTCATGCTATGATGATGAAAAGCTGGAAG  882
            |.||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  803  ACGGCTTATTGCTCATCATCACTCCCGATTCCTCCCATCAGAACCGGCACGCTATGATGATGAAGAGCTGGAAG  876

Query  883  ATTGCTATAGAGTCCCTGGGCTTTAAACGCTTCAAGTACTCAAAATTTTCACATATGCATCTGATGGCATTTAG  956
            |||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  877  ATTGCTATAGAATCCCTGGGTTTTAAGCGCTTCAAGTATTCAAAATTTTCTCATATGCATCTCATGGCTTTTAG  950

Query  957  GAAAATCTCTCTAAAAACCACAAGTGACTTGGTTAGTAGGAACTACCCAGGAATGTTATATATTCCTCAAGATT  1030
            .||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  951  AAAAACCTCCCTTAAAACCACAAGTGACTTGGTTAGCAGGAACTATCCAGGGATGTTGTATATTCCTCAAGATT  1024

Query 1031  TCAACAGTATAGAAGATGAGGAATATTCTAACCCTTCCTGCTATGTTCGATCAGATATAGAAGATGAACAACTA  1104
            ||||||||.|||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.
Sbjct 1025  TCAACAGTGTAGAAGAGGAGGAGTATTCTAACACTTCCTGCTATGTCCGATCAGATCTAGAAGATGAACAACTC  1098

Query 1105  GCATATGGTTTCACAGAACTCCCTGATGCGCCATATGACTCAGATTCTGGAGAAAGTCAAGCCAGCTCTATTCC  1178
            |||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1099  GCATACGGTTTCACGGAGCTCCCCGAAGCTCCTTATGATTCCGATTCTGGAGAAAGCCAAGCCAGCTCTATTCC  1172

Query 1179  TTTCTATGAGCTAGAAGACCCCATATTACTTTTAAGT  1215
            .||.||||||.||||.||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1173  ATTTTATGAGTTAGAGGATCCCATCTTACTTTTAAGC  1209