Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470064
- Subject:
- NM_175312.4
- Aligned Length:
- 1221
- Identities:
- 1085
- Gaps:
- 18
Alignment
Query 1 ATGGAGCCAGGGGCC-GGCGGCCGAAATACTGCTCGTGCGCAGAGGGCCG-----GGTCCCCGAACACTCCGCC 68
|||||||| |||||| ||.|||||| .||||||.|.||.| ||.||||||||.|..|||.
Sbjct 1 ATGGAGCC-GGGGCCGGGTGGCCGA-----------GGCGCAGCGCGCGGACAGCGGCCCCCGAACGCCGCGCA 62
Query 69 GCCCCGGGAGCAGGAGCGGAAACTGGAGCAGGAGAAGCTCTCCGGTGTGGTGAAGAGCGTCCACCGGCGGCTCC 142
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 63 GCCCCGGGAGCAGGAGCGGAAGCTGGAGCAGGAGAAGCTGTCCGGGGTGGTGAAGAGCGTTCATCGGCGGCTCC 136
Query 143 GCAAGAAGTACCGAGAAGTGGGAGATTTTGATAAGATCTGGCGAGAACACTGTGAGGATGAAGAAACTCTTTGT 216
|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||.|||||.
Sbjct 137 GCAAGAAGTACCGCGAAGTGGGAGACTTTGATAAGATCTGGCGAGAACACTGTGAAGATGCGGAAACACTTTGC 210
Query 217 GAATATGCCGTTGCAATGAAAAATTTGGCAGATAATCATTGGGCAAAAACTTGTGAGGGCGAAGGTCGTATTGA 290
||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 211 GAATATGCTGTTGCAATGAAAAATCTGGCAGATAATCACTGGGCAAAAACTTGTGAGGGTGAAGGTCGCATTGA 284
Query 291 ATGGTGTTGTAGTGTATGCAGAGAATATTTCCAAAATGGTGGGAAGAGAAAAGCACTTGAGAAAGATGAAAAAA 364
||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 285 ATGGTGTTGTAGTGTATGCAGAGAGTACTTCCAAAATGGTGGGAAAAGAAAAGCACTTGAGAAAGATGAAAAAC 358
Query 365 GAGCTGTACTTGCCACTAAGACCACTCCAGCCTTAAATATGCATGAGTCTTCTCAACTTGAAGGTCATTTAACC 438
|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||.||||||||||||.||||||.
Sbjct 359 GAGCTGTCCTCGCCACTAAGACCACTCCAGCCTTAAACGTGCACGAGTCTTCTAAACTTGAAGGTCCTTTAACA 432
Query 439 AACCTCAGCTTTACAAACCCTGAATTTATAACTGAGTTGCTACAAGCCTCAGGAAAAATCAGATTACTTGATGT 512
||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 433 AACCTCAGCTTTACAAGCCCTGACTTTATAACTGAGTTGCTTCAAGCCTCAGGAAAGATCAGATTACTTGATGT 506
Query 513 TGGCAGCTGCTTTAACCCATTTCTGAAGTTTGAAGAATTTCTAACTGTTGGCATAGATATTGTACCTGCTGTAG 586
|||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507 TGGCAGCTGCTTTAATCCATTTTTGAAGTTTGAAGAATTTTTAACTGTTGGCATAGATATTGTACCTGCTGTAG 580
Query 587 AGAGTGTCTATAAATGTGATTTCCTGAACTTACAGCTTCAGCAACCACTCCAGCTTGCACAGGATGCTATAGAT 660
|||||||.|||||.|||||.|||||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 581 AGAGTGTGTATAAGTGTGACTTCCTGAACCTGCAGCTGCAGCAGCCACTCCAGCTTGCACAAGATGCTATAGAT 654
Query 661 GCTTTTTTGAAGCAGCTGAAAAACCCTATTGATTCTCTTCCTGGAGAGCTTTTCCATGTGGTTGTTTTCTCTCT 734
||||||.||||||||||||.|||.|||||||||.|||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 655 GCTTTTCTGAAGCAGCTGAGAAATCCTATTGATGCTCTTCCGGGGGAACTTTTTCATGTGGTTGTCTTCTCTCT 728
Query 735 CCTTCTTTCTTATTTTCCATCTCCTTACCAGCGATGGATTTGCTGCAAGAAAGCCCATGAACTGTTAGTGTTAA 808
|||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|.|
Sbjct 729 CCTTCTTTCCTATTTTCCATCACCCTACCAGCGATGGATTTGCTGCAAGAAAGCCCATGAGCTGTTAGTCCTGA 802
Query 809 ATGGTTTATTACTAATCATCACACCTGATTCCTCCCATCAGAACCGTCATGCTATGATGATGAAAAGCTGGAAG 882
|.||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 803 ACGGCTTATTGCTCATCATCACTCCCGATTCCTCCCATCAGAACCGGCACGCTATGATGATGAAGAGCTGGAAG 876
Query 883 ATTGCTATAGAGTCCCTGGGCTTTAAACGCTTCAAGTACTCAAAATTTTCACATATGCATCTGATGGCATTTAG 956
|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 877 ATTGCTATAGAATCCCTGGGTTTTAAGCGCTTCAAGTATTCAAAATTTTCTCATATGCATCTCATGGCTTTTAG 950
Query 957 GAAAATCTCTCTAAAAACCACAAGTGACTTGGTTAGTAGGAACTACCCAGGAATGTTATATATTCCTCAAGATT 1030
.||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 951 AAAAACCTCCCTTAAAACCACAAGTGACTTGGTTAGCAGGAACTATCCAGGGATGTTGTATATTCCTCAAGATT 1024
Query 1031 TCAACAGTATAGAAGATGAGGAATATTCTAACCCTTCCTGCTATGTTCGATCAGATATAGAAGATGAACAACTA 1104
||||||||.|||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.
Sbjct 1025 TCAACAGTGTAGAAGAGGAGGAGTATTCTAACACTTCCTGCTATGTCCGATCAGATCTAGAAGATGAACAACTC 1098
Query 1105 GCATATGGTTTCACAGAACTCCCTGATGCGCCATATGACTCAGATTCTGGAGAAAGTCAAGCCAGCTCTATTCC 1178
|||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1099 GCATACGGTTTCACGGAGCTCCCCGAAGCTCCTTATGATTCCGATTCTGGAGAAAGCCAAGCCAGCTCTATTCC 1172
Query 1179 TTTCTATGAGCTAGAAGACCCCATATTACTTTTAAGT 1215
.||.||||||.||||.||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1173 ATTTTATGAGTTAGAGGATCCCATCTTACTTTTAAGC 1209