Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470064
- Subject:
- XM_011241037.2
- Aligned Length:
- 1226
- Identities:
- 1018
- Gaps:
- 88
Alignment
Query 1 ATGGAGCCAGGGGCCGGCGGCCGAAATACTGCTCGTGCGCAGAGGGCCGGGTCCCCGAACACTCCGCCGCCCCG 74
||| |.|||..|||..|.|||.| ||||..||||||
Sbjct 1 ATG--GGCAGTCGCCACCCGCCTA--------------------GGCCCTGTCCCC------------------ 34
Query 75 GGAGCAGGAGCGGAAACTGGAGCAGGAGAAGCTCTCCGGTGTGGTGAAGAGCGTCCACCG----GCGGCTCCGC 144
||||| ||| || .|||| ||..||| ||||| ||.||||
Sbjct 35 --------AGCGG----TGG-GC-TGAGA------CCACTGT-------------CACCGAGCCGCCGCTC--- 72
Query 145 AAGAAGTACCGAG-------AAGTGGGAGATTTTGATAAGATCTGGCGAGAACACTGTGAGGATGAAGAAACTC 211
|||.|.|..||| .|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||.|
Sbjct 73 -AGAGGGAGGGAGGGGCTTTCAGTGGGAGACTTTGATAAGATCTGGCGAGAACACTGTGAAGATGCGGAAACAC 145
Query 212 TTTGTGAATATGCCGTTGCAATGAAAAATTTGGCAGATAATCATTGGGCAAAAACTTGTGAGGGCGAAGGTCGT 285
||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 146 TTTGCGAATATGCTGTTGCAATGAAAAATCTGGCAGATAATCACTGGGCAAAAACTTGTGAGGGTGAAGGTCGC 219
Query 286 ATTGAATGGTGTTGTAGTGTATGCAGAGAATATTTCCAAAATGGTGGGAAGAGAAAAGCACTTGAGAAAGATGA 359
|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 220 ATTGAATGGTGTTGTAGTGTATGCAGAGAGTACTTCCAAAATGGTGGGAAAAGAAAAGCACTTGAGAAAGATGA 293
Query 360 AAAAAGAGCTGTACTTGCCACTAAGACCACTCCAGCCTTAAATATGCATGAGTCTTCTCAACTTGAAGGTCATT 433
||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 294 AAAACGAGCTGTCCTCGCCACTAAGACCACTCCAGCCTTAAACGTGCACGAGTCTTCTAAACTTGAAGGTCCTT 367
Query 434 TAACCAACCTCAGCTTTACAAACCCTGAATTTATAACTGAGTTGCTACAAGCCTCAGGAAAAATCAGATTACTT 507
||||.||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 368 TAACAAACCTCAGCTTTACAAGCCCTGACTTTATAACTGAGTTGCTTCAAGCCTCAGGAAAGATCAGATTACTT 441
Query 508 GATGTTGGCAGCTGCTTTAACCCATTTCTGAAGTTTGAAGAATTTCTAACTGTTGGCATAGATATTGTACCTGC 581
||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442 GATGTTGGCAGCTGCTTTAATCCATTTTTGAAGTTTGAAGAATTTTTAACTGTTGGCATAGATATTGTACCTGC 515
Query 582 TGTAGAGAGTGTCTATAAATGTGATTTCCTGAACTTACAGCTTCAGCAACCACTCCAGCTTGCACAGGATGCTA 655
||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 516 TGTAGAGAGTGTGTATAAGTGTGACTTCCTGAACCTGCAGCTGCAGCAGCCACTCCAGCTTGCACAAGATGCTA 589
Query 656 TAGATGCTTTTTTGAAGCAGCTGAAAAACCCTATTGATTCTCTTCCTGGAGAGCTTTTCCATGTGGTTGTTTTC 729
|||||||||||.||||||||||||.|||.|||||||||.|||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct 590 TAGATGCTTTTCTGAAGCAGCTGAGAAATCCTATTGATGCTCTTCCGGGGGAACTTTTTCATGTGGTTGTCTTC 663
Query 730 TCTCTCCTTCTTTCTTATTTTCCATCTCCTTACCAGCGATGGATTTGCTGCAAGAAAGCCCATGAACTGTTAGT 803
||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 664 TCTCTCCTTCTTTCCTATTTTCCATCACCCTACCAGCGATGGATTTGCTGCAAGAAAGCCCATGAGCTGTTAGT 737
Query 804 GTTAAATGGTTTATTACTAATCATCACACCTGATTCCTCCCATCAGAACCGTCATGCTATGATGATGAAAAGCT 877
..|.||.||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct 738 CCTGAACGGCTTATTGCTCATCATCACTCCCGATTCCTCCCATCAGAACCGGCACGCTATGATGATGAAGAGCT 811
Query 878 GGAAGATTGCTATAGAGTCCCTGGGCTTTAAACGCTTCAAGTACTCAAAATTTTCACATATGCATCTGATGGCA 951
||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 812 GGAAGATTGCTATAGAATCCCTGGGTTTTAAGCGCTTCAAGTATTCAAAATTTTCTCATATGCATCTCATGGCT 885
Query 952 TTTAGGAAAATCTCTCTAAAAACCACAAGTGACTTGGTTAGTAGGAACTACCCAGGAATGTTATATATTCCTCA 1025
|||||.||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 886 TTTAGAAAAACCTCCCTTAAAACCACAAGTGACTTGGTTAGCAGGAACTATCCAGGGATGTTGTATATTCCTCA 959
Query 1026 AGATTTCAACAGTATAGAAGATGAGGAATATTCTAACCCTTCCTGCTATGTTCGATCAGATATAGAAGATGAAC 1099
|||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.|||||||||.||||||||||||
Sbjct 960 AGATTTCAACAGTGTAGAAGAGGAGGAGTATTCTAACACTTCCTGCTATGTCCGATCAGATCTAGAAGATGAAC 1033
Query 1100 AACTAGCATATGGTTTCACAGAACTCCCTGATGCGCCATATGACTCAGATTCTGGAGAAAGTCAAGCCAGCTCT 1173
||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1034 AACTCGCATACGGTTTCACGGAGCTCCCCGAAGCTCCTTATGATTCCGATTCTGGAGAAAGCCAAGCCAGCTCT 1107
Query 1174 ATTCCTTTCTATGAGCTAGAAGACCCCATATTACTTTTAAGT 1215
|||||.||.||||||.||||.||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1108 ATTCCATTTTATGAGTTAGAGGATCCCATCTTACTTTTAAGC 1149