Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000470064
Subject:
XM_011241037.2
Aligned Length:
1226
Identities:
1018
Gaps:
88

Alignment

Query    1  ATGGAGCCAGGGGCCGGCGGCCGAAATACTGCTCGTGCGCAGAGGGCCGGGTCCCCGAACACTCCGCCGCCCCG  74
            |||  |.|||..|||..|.|||.|                    ||||..||||||                  
Sbjct    1  ATG--GGCAGTCGCCACCCGCCTA--------------------GGCCCTGTCCCC------------------  34

Query   75  GGAGCAGGAGCGGAAACTGGAGCAGGAGAAGCTCTCCGGTGTGGTGAAGAGCGTCCACCG----GCGGCTCCGC  144
                    |||||    ||| || .||||      ||..|||             |||||    ||.||||   
Sbjct   35  --------AGCGG----TGG-GC-TGAGA------CCACTGT-------------CACCGAGCCGCCGCTC---  72

Query  145  AAGAAGTACCGAG-------AAGTGGGAGATTTTGATAAGATCTGGCGAGAACACTGTGAGGATGAAGAAACTC  211
             |||.|.|..|||       .|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||.|
Sbjct   73  -AGAGGGAGGGAGGGGCTTTCAGTGGGAGACTTTGATAAGATCTGGCGAGAACACTGTGAAGATGCGGAAACAC  145

Query  212  TTTGTGAATATGCCGTTGCAATGAAAAATTTGGCAGATAATCATTGGGCAAAAACTTGTGAGGGCGAAGGTCGT  285
            ||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  146  TTTGCGAATATGCTGTTGCAATGAAAAATCTGGCAGATAATCACTGGGCAAAAACTTGTGAGGGTGAAGGTCGC  219

Query  286  ATTGAATGGTGTTGTAGTGTATGCAGAGAATATTTCCAAAATGGTGGGAAGAGAAAAGCACTTGAGAAAGATGA  359
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  ATTGAATGGTGTTGTAGTGTATGCAGAGAGTACTTCCAAAATGGTGGGAAAAGAAAAGCACTTGAGAAAGATGA  293

Query  360  AAAAAGAGCTGTACTTGCCACTAAGACCACTCCAGCCTTAAATATGCATGAGTCTTCTCAACTTGAAGGTCATT  433
            ||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||.||||||||||||.||
Sbjct  294  AAAACGAGCTGTCCTCGCCACTAAGACCACTCCAGCCTTAAACGTGCACGAGTCTTCTAAACTTGAAGGTCCTT  367

Query  434  TAACCAACCTCAGCTTTACAAACCCTGAATTTATAACTGAGTTGCTACAAGCCTCAGGAAAAATCAGATTACTT  507
            ||||.||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  368  TAACAAACCTCAGCTTTACAAGCCCTGACTTTATAACTGAGTTGCTTCAAGCCTCAGGAAAGATCAGATTACTT  441

Query  508  GATGTTGGCAGCTGCTTTAACCCATTTCTGAAGTTTGAAGAATTTCTAACTGTTGGCATAGATATTGTACCTGC  581
            ||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  GATGTTGGCAGCTGCTTTAATCCATTTTTGAAGTTTGAAGAATTTTTAACTGTTGGCATAGATATTGTACCTGC  515

Query  582  TGTAGAGAGTGTCTATAAATGTGATTTCCTGAACTTACAGCTTCAGCAACCACTCCAGCTTGCACAGGATGCTA  655
            ||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  516  TGTAGAGAGTGTGTATAAGTGTGACTTCCTGAACCTGCAGCTGCAGCAGCCACTCCAGCTTGCACAAGATGCTA  589

Query  656  TAGATGCTTTTTTGAAGCAGCTGAAAAACCCTATTGATTCTCTTCCTGGAGAGCTTTTCCATGTGGTTGTTTTC  729
            |||||||||||.||||||||||||.|||.|||||||||.|||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct  590  TAGATGCTTTTCTGAAGCAGCTGAGAAATCCTATTGATGCTCTTCCGGGGGAACTTTTTCATGTGGTTGTCTTC  663

Query  730  TCTCTCCTTCTTTCTTATTTTCCATCTCCTTACCAGCGATGGATTTGCTGCAAGAAAGCCCATGAACTGTTAGT  803
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  664  TCTCTCCTTCTTTCCTATTTTCCATCACCCTACCAGCGATGGATTTGCTGCAAGAAAGCCCATGAGCTGTTAGT  737

Query  804  GTTAAATGGTTTATTACTAATCATCACACCTGATTCCTCCCATCAGAACCGTCATGCTATGATGATGAAAAGCT  877
            ..|.||.||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct  738  CCTGAACGGCTTATTGCTCATCATCACTCCCGATTCCTCCCATCAGAACCGGCACGCTATGATGATGAAGAGCT  811

Query  878  GGAAGATTGCTATAGAGTCCCTGGGCTTTAAACGCTTCAAGTACTCAAAATTTTCACATATGCATCTGATGGCA  951
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct  812  GGAAGATTGCTATAGAATCCCTGGGTTTTAAGCGCTTCAAGTATTCAAAATTTTCTCATATGCATCTCATGGCT  885

Query  952  TTTAGGAAAATCTCTCTAAAAACCACAAGTGACTTGGTTAGTAGGAACTACCCAGGAATGTTATATATTCCTCA  1025
            |||||.||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  886  TTTAGAAAAACCTCCCTTAAAACCACAAGTGACTTGGTTAGCAGGAACTATCCAGGGATGTTGTATATTCCTCA  959

Query 1026  AGATTTCAACAGTATAGAAGATGAGGAATATTCTAACCCTTCCTGCTATGTTCGATCAGATATAGAAGATGAAC  1099
            |||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.|||||||||.||||||||||||
Sbjct  960  AGATTTCAACAGTGTAGAAGAGGAGGAGTATTCTAACACTTCCTGCTATGTCCGATCAGATCTAGAAGATGAAC  1033

Query 1100  AACTAGCATATGGTTTCACAGAACTCCCTGATGCGCCATATGACTCAGATTCTGGAGAAAGTCAAGCCAGCTCT  1173
            ||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1034  AACTCGCATACGGTTTCACGGAGCTCCCCGAAGCTCCTTATGATTCCGATTCTGGAGAAAGCCAAGCCAGCTCT  1107

Query 1174  ATTCCTTTCTATGAGCTAGAAGACCCCATATTACTTTTAAGT  1215
            |||||.||.||||||.||||.||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1108  ATTCCATTTTATGAGTTAGAGGATCCCATCTTACTTTTAAGC  1149