Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000470067
Subject:
NM_001272020.2
Aligned Length:
1912
Identities:
1294
Gaps:
617

Alignment

Query    1  ATGCACCTGAGAATCCACGCGAGACGGAGCCCTCCTCGCCGGCCGGCCTGGACGCTTGGGATCTGGTTCCTGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCACCTGAGAATCCACGCGAGACGGAGCCCTCCTCGCCGGCCGGCCTGGACGCTTGGGATCTGGTTCCTGTT  74

Query   75  CTGGGGATGTATCGTCAGCTCTGTATGGAGTTCTTCTAATGTAGCTTCCTCCTCCTCCACCTCTTCCTCGCCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGGGGATGTATCGTCAGCTCTGTATGGAGTTCTTCTAATGTAGCTTCCTCCTCCTCCACCTCTTCCTCGCCGG  148

Query  149  GGTCTCACTCTCAGCACGAGCACCATTTCCATGGCAGCAAGCATCACTCAGTGCCTATTTCTATCTATCGTTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGTCTCACTCTCAGCACGAGCACCATTTCCATGGCAGCAAGCATCACTCAGTGCCTATTTCTATCTATCGTTCC  222

Query  223  CCTGTTTCCCTTCGAGGAGGACACGCTGGCGCTACGTACATCTTTGGGAAAAGTGGTGGGCTTATCCTCTACAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTGTTTCCCTTCGAGGAGGACACGCTGGCGCTACGTACATCTTTGGGAAAAGTGGTGGGCTTATCCTCTACAC  296

Query  297  CTGGCCAGCCAATGACAGGCCCAGCACGCGGTCTGACCGCCTTGCCGTGGGCTTCAGCACCACTGTGAAGGATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTGGCCAGCCAATGACAGGCCCAGCACGCGGTCTGACCGCCTTGCCGTGGGCTTCAGCACCACTGTGAAGGATG  370

Query  371  GCATCTTGGTCCGCATCGACAGTGCTCCAGGACTTGGTGACTTCCTCCAGCTTCACATAGAACAGGGGAAAATT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCATCTTGGTCCGCATCGACAGTGCTCCAGGACTTGGTGACTTCCTCCAGCTTCACATAGAACAGGGGAAAATT  444

Query  445  GGAGTTGTCTTCAACATTGGCACAGTTGACATCTCCATCAAAGAGGAGAGAACCCCTGTAAATGACGGCAAATA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGAGTTGTCTTCAACATTGGCACAGTTGACATCTCCATCAAAGAGGAGAGAACCCCTGTAAATGACGGCAAATA  518

Query  519  CCATGTGGTACGCTTCACCAGGAACGGCGGCAACGCCACCCTGCAGGTGGACAACTGGCCAGTGAATGAACATT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCATGTGGTACGCTTCACCAGGAACGGCGGCAACGCCACCCTGCAGGTGGACAACTGGCCAGTGAATGAACATT  592

Query  593  ATCCTACAGGCCGGCAGTTAACCATCTTCAACACTCAGGCGCAAATAGCCATTGGTGGAAAGGACAAAGGACGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATCCTACAGGCCGGCAGTTAACCATCTTCAACACTCAGGCGCAAATAGCCATTGGTGGAAAGGACAAAGGACGC  666

Query  667  CTCTTCCAAGGCCAACTCTCTGGGCTCTATTATGATGGTTTGAAAGTACTGAACATGGCGGCTGAGAACAACCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCTTCCAAGGCCAACTCTCTGGGCTCTATTATGATGGTTTGAAAGTACTGAACATGGCGGCTGAGAACAACCC  740

Query  741  CAATATTAAAATCAATGGAAGTGTTCGGCTGGTTGGAGAAGTCCCATCAATTTTGGGAACAACACAGACGACCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAATATTAAAATCAATGGAAGTGTTCGGCTGGTTGGAGAAGTCCCATCAATTTTGGGAACAACACAGACGACCT  814

Query  815  CCATGCCACCAGAAATGTCTACTACTGTCATGGAAACCACTACTACAATGGCGACTACCACAACCCGTAAGAAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCATGCCACCAGAAATGTCTACTACTGTCATGGAAACCACTACTACAATGGCGACTACCACAACCCGTAAGAAT  888

Query  889  CGCTCTACAGCCAGCATTCAGCCAACATCAGATGATCTTGTTTCATCTGCTGAATGTTCAAGTGATGATGAAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGCTCTACAGCCAGCATTCAGCCAACATCAGATGATCTTGTTTCATCTGCTGAATGTTCAAGTGATGATGAAGA  962

Query  963  CTTTGTTGAATGTGAGCCGAGTACAGGTAGGT------------------------------------------  994
            ||||||||||||||||||||||||||| ||||                                          
Sbjct  963  CTTTGTTGAATGTGAGCCGAGTACAGG-AGGTGAATTAGTTATCCCTCTTCTTGTAGAAGACCCTTTAGCTACC  1035

Query  995  --------------------------------------------------------------------------  994
                                                                                      
Sbjct 1036  CCTCCTATTGCTACTCGTGCACCTTCCATTACACTCCCCCCTACCTTTCGCCCCCTCCTCACCATTATTGAGAC  1109

Query  995  --------------------------------------------------------------------------  994
                                                                                      
Sbjct 1110  CACCAAAGATTCCCTGTCCATGACCTCTGAGGCGGGGTTACCTTGCTTGTCGGACCAAGGCAGCGATGGTTGTG  1183

Query  995  --------------------------------------------------------------------------  994
                                                                                      
Sbjct 1184  ATGATGATGGCTTGGTGATATCTGGGTATGGCTCAGGGGAAACCTTTGACTCTAACCTGCCCCCTACTGATGAT  1257

Query  995  --------------------------------------------------------------------------  994
                                                                                      
Sbjct 1258  GAAGATTTTTACACCACCTTCTCCTTGGTAACAGATAAGAGTCTTTCCACTTCAATCTTCGAAGGTGGCTACAA  1331

Query  995  --------------------------------------------------------------------------  994
                                                                                      
Sbjct 1332  AGCACATGCGCCCAAGTGGGAATCCAAGGACTTTAGACCTAACAAAGTCTCCGAAACTAGTAGGACTACTACCA  1405

Query  995  --------------------------------------------------------------------------  994
                                                                                      
Sbjct 1406  CATCTTTATCCCCTGAGCTGATCCGCTTCACAGCTTCCTCCTCGTCTGGGATGGTGCCCAAATTGCCAGCTGGC  1479

Query  995  --------------------------------------------------------------------------  994
                                                                                      
Sbjct 1480  AAAATGAATAACCGTGATCTCAAACCCCAGCCTGATATAGTCTTGCTTCCGTTGCCCACTGCCTATGAGCTAGA  1553

Query  995  --------------------------------------------------------CAGCAAACCCCACGGAGC  1012
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct 1554  CAGCACCAAACTGAAGAGCCCACTAATTACTTCCCCCATGTTCCGTAATGTGCCCACAGCAAACCCCACGGAGC  1627

Query 1013  CGGGAATCAGACGGGTTCCGGGGGCCTCAGAGGTGATCCGGGAGTCGAGCAGCACAACAGGGATGGTCGTCGGC  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628  CGGGAATCAGACGGGTTCCGGGGGCCTCAGAGGTGATCCGGGAGTCGAGCAGCACAACAGGGATGGTCGTCGGC  1701

Query 1087  ATTGTGGCTGCTGCCGCCCTCTGCATCTTGATCCTCCTGTACGCCATGTACAAGTACAGGAACAGGGACGAGGG  1160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702  ATTGTGGCTGCTGCCGCCCTCTGCATCTTGATCCTCCTGTACGCCATGTACAAGTACAGGAACAGGGACGAGGG  1775

Query 1161  GTCCTATCAAGTGGACGAGACGCGGAACTACATCAGCAACTCCGCCCAGAGCAACGGCACGCTCATGAAGGAGA  1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776  GTCCTATCAAGTGGACGAGACGCGGAACTACATCAGCAACTCCGCCCAGAGCAACGGCACGCTCATGAAGGAGA  1849

Query 1235  AGCAGCAGAGCTCGAAGAGCGGCCACAAGAAACAGAAAAACAAGGACAGGGAGCATTACGTG  1296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1850  AGCAGCAGAGCTCGAAGAGCGGCCACAAGAAACAGAAAAACAAGGACAGGGAGTATTACGTG  1911