Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470067
- Subject:
- XM_006515569.3
- Aligned Length:
- 1298
- Identities:
- 1190
- Gaps:
- 10
Alignment
Query 1 ATGCACCTGAGAATCCACGCGAGACGGAGCCCTCCTCGCCGGCCGGCCTGGACGCTTGGGATCTGGTTCCTGTT 74
||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 1 ATGCACCTGAGAATCCACCCAAGACGGAGCCCTCCTCGCCGGCCGGCCTGGACGCTTGGGATCTGGTCCCTCTT 74
Query 75 CTGGGGATGTATCGTCAGCTCTGTATGGAGTTCTTCTAATGTAGCTTCCTCCTCCTCCACCTCTTCCTCGCCGG 148
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||| ||||||||.||||||||||.||||
Sbjct 75 CTGGGGATGTATCGTCAGCTCTGTGTGGAGTTCTTCTAATGTAG------CCTCCTCCTCCTCTTCCTCTCCGG 142
Query 149 GGTCTCACTCTCAGCACGAGCACCATTTCCATGGCAGCAAGCATCACTCAGTGCCTATTTCTATCTATCGTTCC 222
|.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 143 GATCTCACTCTCAGCAGGAACACCATTTCCACGGCAGCAAGCACCACTCTGTGCCTATTTCTATCTATCGCTCC 216
Query 223 CCTGTTTCCCTTCGAGGAGGACACGCTGGCGCTACGTACATCTTTGGGAAAAGTGGTGGGCTTATCCTCTACAC 296
||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 217 CCTGTTTCCCTTCGAGGAGGGCACGCTGGTGCAACATACATCTTTGGGAAAAGCGGTGGCCTCATCCTCTATAC 290
Query 297 CTGGCCAGCCAATGACAGGCCCAGCACGCGGTCTGACCGCCTTGCCGTGGGCTTCAGCACCACTGTGAAGGATG 370
|||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 291 CTGGCCAGCAAATGACAGACCCAGCACACGCTCTGACCGTCTCGCCGTGGGCTTCAGCACTACTGTGAAGGATG 364
Query 371 GCATCTTGGTCCGCATCGACAGTGCTCCAGGACTTGGTGACTTCCTCCAGCTTCACATAGAACAGGGGAAAATT 444
|.|||||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 365 GTATCTTAGTACGCATTGACAGCGCCCCTGGACTTGGCGACTTCCTCCAGCTTCACATAGAACAAGGGAAAATT 438
Query 445 GGAGTTGTCTTCAACATTGGCACAGTTGACATCTCCATCAAAGAGGAGAGAACCCCTGTAAATGACGGCAAATA 518
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 439 GGAGTTGTCTTCAATATTGGCACAGTTGACATCTCCATCAAAGAAGAGAGAACTCCTGTCAATGATGGCAAATA 512
Query 519 CCATGTGGTACGCTTCACCAGGAACGGCGGCAACGCCACCCTGCAGGTGGACAACTGGCCAGTGAATGAACATT 592
|||.||.||.||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 513 CCACGTTGTGCGCTTCACCAGGAATGGGGGAAATGCTACACTTCAGGTGGACAACTGGCCAGTGAATGAGCACT 586
Query 593 ATCCTACAGGCCGGCAGTTAACCATCTTCAACACTCAGGCGCAAATAGCCATTGGTGGAAAGGACAAAGGACGC 666
|||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 587 ATCCTACAGGCCGGCAGCTAACCATCTTCAACACCCAGGCGCAAATAGCCATCGGAGGAAAGGACAAAGGACGT 660
Query 667 CTCTTCCAAGGCCAACTCTCTGGGCTCTATTATGATGGTTTGAAAGTACTGAACATGGCGGCTGAGAACAACCC 740
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 661 CTCTTCCAAGGTCAACTCTCTGGGCTCTATTATGATGGTTTGAAAGTACTGAACATGGCAGCTGAGAACAACCC 734
Query 741 CAATATTAAAATCAATGGAAGTGTTCGGCTGGTTGGAGAAGTCCCATCAATTTTGGGAACAACACAGACGACCT 814
.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|.|..||||||||||||||.||.|
Sbjct 735 TAATATTAAAATCAATGGAAGTGTCCGGCTAGTGGGAGAAGTCCCATCAGTCTCAGGAACAACACAGACAACGT 808
Query 815 CCATGCCACCAGAAATGTCTACTACTGTCATGGAAACCACTACTACAATGGCGACTACCACAACCCGTAAGAAT 888
||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 809 CCATGCCACCTGAAATGTCTACCACCGTCATGGAAACCACCACCACCATGGCTACGACCACCACCCGAAAGAAC 882
Query 889 CGCTCTACAGCCAGCATTCAGCCAACATCAGATGATCTTGTTTCATCTGCTGAATGTTCAAGTGATGATGAAGA 962
|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 883 CGCTCTACAGCCAGCATTCAGCCCACGTCAGATGATCTTGTTTCATCTGCTGAATGTTCAAGTGATGATGAAGA 956
Query 963 CTTTGTTGAATGTGAGCCGAGTACAGGTAGGTCAGCAAACCCCACGGAGCCGGGAATCAGACGGGTTCCGGGGG 1036
||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 CTTTGTCGAATGTGAACCAAGTACAGGTAGGTCAGCAAACCCCACGGAGCCAGGAATCAGACGGGTTCCGGGGG 1030
Query 1037 CCTCAGAGGTGATCCGGGAGTCGAGCAGCACAACAGGGATGGTCGTCGGCATTGTGGCTGCTGCCGCCCTCTGC 1110
||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031 CCTCAGAGGTGATCCGGGAGTCCAGCAGTACAACAGGGATGGTCGTCGGCATTGTGGCTGCTGCCGCCCTCTGC 1104
Query 1111 ATCTTGATCCTCCTGTACGCCATGTACAAGTACAGGAACAGGGACGAGGGGTCCTATCAAGTGGACGAGACGCG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1105 ATCTTGATCCTCCTGTACGCCATGTACAAGTACAGGAACAGGGACGAGGGGTCCTATCAAGTGGACGAGACGAG 1178
Query 1185 GAACTACATCAGCAACTCCGCCCAGAGCAACGGCACGCTCATGAAGGAGAAGCAGCAG--AGCTCGAAGAGCGG 1256
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||.||||||||
Sbjct 1179 GAACTACATCAGCAACTCGGCCCAGAGCAACGGCACGCTCATGAAGGAGAAGCA--AGCCAGCTCCAAGAGCGG 1250
Query 1257 CCACAAGAAACAGAAAAACAAGGACAGGGAGCATTACGTG 1296
|||.||||||||||||||||||||||.||||.||||.|||
Sbjct 1251 CCATAAGAAACAGAAAAACAAGGACAAGGAGTATTATGTG 1290