Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470067
- Subject:
- XM_017314989.1
- Aligned Length:
- 1388
- Identities:
- 1190
- Gaps:
- 100
Alignment
Query 1 ATGCACCTGAGAATCCACGCGAGACGGAGCCCTCCTCGCCGGCCGGCCTGGACGCTTGGGATCTGGTTCCTGTT 74
||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 1 ATGCACCTGAGAATCCACCCAAGACGGAGCCCTCCTCGCCGGCCGGCCTGGACGCTTGGGATCTGGTCCCTCTT 74
Query 75 CTGGGGATGTATCGTCAGCTCTGTATGGAGTTCTTCTAATGTAGCTTCCTCCTCCTCCACCTCTTCCTCGCCGG 148
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||| ||||||||.||||||||||.||||
Sbjct 75 CTGGGGATGTATCGTCAGCTCTGTGTGGAGTTCTTCTAATGTAG------CCTCCTCCTCCTCTTCCTCTCCGG 142
Query 149 GGTCTCACTCTCAGCACGAGCACCATTTCCATGGCAGCAAGCATCACTCAGTGCCTATTTCTATCTATCGTTCC 222
|.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 143 GATCTCACTCTCAGCAGGAACACCATTTCCACGGCAGCAAGCACCACTCTGTGCCTATTTCTATCTATCGCTCC 216
Query 223 CCTGTTTCCCTTCGAGGAGGACACGCTGGCGCTACGTACATCTTTGGGAAAAGTGGTGGGCTTATCCTCTACAC 296
||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 217 CCTGTTTCCCTTCGAGGAGGGCACGCTGGTGCAACATACATCTTTGGGAAAAGCGGTGGCCTCATCCTCTATAC 290
Query 297 CTGGCCAGCCAATGACAGGCCCAGCACGCGGTCTGACCGCCTTGCCGTGGGCTTCAGCACCACTGTGAAGGATG 370
|||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 291 CTGGCCAGCAAATGACAGACCCAGCACACGCTCTGACCGTCTCGCCGTGGGCTTCAGCACTACTGTGAAGGATG 364
Query 371 GCATCTTGGTCCGCATCGACAGTGCTCCAGGACTTGGTGACTTCCTCCAGCTTCACATAGAACAGGGGAAAATT 444
|.|||||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 365 GTATCTTAGTACGCATTGACAGCGCCCCTGGACTTGGCGACTTCCTCCAGCTTCACATAGAACAAGGGAAAATT 438
Query 445 GGAGTTGTCTTCAACATTGGCACAGTTGACATCTCCATCAAAGAGGAGAGAACCCCTGTAAATGACGGCAAATA 518
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 439 GGAGTTGTCTTCAATATTGGCACAGTTGACATCTCCATCAAAGAAGAGAGAACTCCTGTCAATGATGGCAAATA 512
Query 519 CCATGTGGTACGCTTCACCAGGAACGGCGGCAACGCCACCCTGCAGGTGGACAACTGGCCAGTGAATGAACATT 592
|||.||.||.||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 513 CCACGTTGTGCGCTTCACCAGGAATGGGGGAAATGCTACACTTCAGGTGGACAACTGGCCAGTGAATGAGCACT 586
Query 593 ATCCTAC------------------------------------------------------------------- 599
|||||||
Sbjct 587 ATCCTACAGGCAACACTGATAATGAACGCCTCCAAATGGTAAAACAGAAAATCCCCTTCAAATATAACCGGCCC 660
Query 600 -----------------------AGGCCGGCAGTTAACCATCTTCAACACTCAGGCGCAAATAGCCATTGGTGG 650
||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 661 GTAGAGGAGTGGCTGCAGGAAAAAGGCCGGCAGCTAACCATCTTCAACACCCAGGCGCAAATAGCCATCGGAGG 734
Query 651 AAAGGACAAAGGACGCCTCTTCCAAGGCCAACTCTCTGGGCTCTATTATGATGGTTTGAAAGTACTGAACATGG 724
|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735 AAAGGACAAAGGACGTCTCTTCCAAGGTCAACTCTCTGGGCTCTATTATGATGGTTTGAAAGTACTGAACATGG 808
Query 725 CGGCTGAGAACAACCCCAATATTAAAATCAATGGAAGTGTTCGGCTGGTTGGAGAAGTCCCATCAATTTTGGGA 798
|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|.|..|||
Sbjct 809 CAGCTGAGAACAACCCTAATATTAAAATCAATGGAAGTGTCCGGCTAGTGGGAGAAGTCCCATCAGTCTCAGGA 882
Query 799 ACAACACAGACGACCTCCATGCCACCAGAAATGTCTACTACTGTCATGGAAACCACTACTACAATGGCGACTAC 872
|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||
Sbjct 883 ACAACACAGACAACGTCCATGCCACCTGAAATGTCTACCACCGTCATGGAAACCACCACCACCATGGCTACGAC 956
Query 873 CACAACCCGTAAGAATCGCTCTACAGCCAGCATTCAGCCAACATCAGATGATCTTGTTTCATCTGCTGAATGTT 946
|||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 CACCACCCGAAAGAACCGCTCTACAGCCAGCATTCAGCCCACGTCAGATGATCTTGTTTCATCTGCTGAATGTT 1030
Query 947 CAAGTGATGATGAAGACTTTGTTGAATGTGAGCCGAGTACAGGTAGGTCAGCAAACCCCACGGAGCCGGGAATC 1020
||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1031 CAAGTGATGATGAAGACTTTGTCGAATGTGAACCAAGTACAGGTAGGTCAGCAAACCCCACGGAGCCAGGAATC 1104
Query 1021 AGACGGGTTCCGGGGGCCTCAGAGGTGATCCGGGAGTCGAGCAGCACAACAGGGATGGTCGTCGGCATTGTGGC 1094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105 AGACGGGTTCCGGGGGCCTCAGAGGTGATCCGGGAGTCCAGCAGTACAACAGGGATGGTCGTCGGCATTGTGGC 1178
Query 1095 TGCTGCCGCCCTCTGCATCTTGATCCTCCTGTACGCCATGTACAAGTACAGGAACAGGGACGAGGGGTCCTATC 1168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179 TGCTGCCGCCCTCTGCATCTTGATCCTCCTGTACGCCATGTACAAGTACAGGAACAGGGACGAGGGGTCCTATC 1252
Query 1169 AAGTGGACGAGACGCGGAACTACATCAGCAACTCCGCCCAGAGCAACGGCACGCTCATGAAGGAGAAGCAGCAG 1242
||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1253 AAGTGGACGAGACGAGGAACTACATCAGCAACTCGGCCCAGAGCAACGGCACGCTCATGAAGGAGAAGCA--AG 1324
Query 1243 --AGCTCGAAGAGCGGCCACAAGAAACAGAAAAACAAGGACAGGGAGCATTACGTG 1296
|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||.||||.|||
Sbjct 1325 CCAGCTCCAAGAGCGGCCATAAGAAACAGAAAAACAAGGACAAGGAGTATTATGTG 1380