Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470096
• Subject: XM_006715951.2
• Aligned Length: 1869
• Identities: 1701
• Gaps: 168

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGGATAGGGGTGTCTTTATTACTGCAGTTTTCTCTAACACCTGGGGGCTACCGGAGTGTGGGCCGAAGCAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCGCTGCAGCCGCGGAAGTATCCCCAGGAACATCCCCAAGAGGAGCTGGAAAAAGCCTCATCCCCAGCTCTGCA  148

Query    1  --------------------ATGCTGGAACGTCGTTGCAGGGGCCCCCTGGCCATGGGCCTGGCCCAGCCCCGA  54
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTCTCCAGGAGGAAGAACCGATGCTGGAACGTCGTTGCAGGGGCCCCCTGGCCATGGGCCTGGCCCAGCCCCGA  222

Query   55  CTCCTTTCTGGGCCCTCCCAGGAGTCACCCCAGACCCTGGGGAAGGAGTCCCGCGGGCTGAGGCAACAAGGCAC  128
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCCTTTCTGGGCCCTCCCAGGAGTCACCCCAGACCCTGGGGAAGGAGTCCCGCGGGCTGAGGCAACAAGGCAC  296

Query  129  GTCAGTGGCCCAGTCTGGTGCCCAAGCCCCAGGCAGGGCCCATCGCTGTGCCCACTGTCGAAGGCACTTCCCTG  202
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTCAGTGGCCCAGTCTGGTGCCCAAGCCCCAGGCAGGGCCCATCGCTGTGCCCACTGTCGAAGGCACTTCCCTG  370

Query  203  GCTGGGTGGCTCTGTGGCTTCACACCCGCCGGTGCCAGGCCCGGCTGCCCTTGCCCTGCCCTGAGTGTGGCCGT  276
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCTGGGTGGCTCTGTGGCTTCACACCCGCCGGTGCCAGGCCCGGCTGCCCTTGCCCTGCCCTGAGTGTGGCCGT  444

Query  277  CGCTTTCGCCATGCCCCCTTCTTAGCACTGCACCGCCAGGTCCATGCTGCTGCCACCCCAGACCTGGGCTTTGC  350
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGCTTTCGCCATGCCCCCTTCTTAGCACTGCACCGCCAGGTCCATGCTGCTGCCACCCCAGACCTGGGCTTTGC  518

Query  351  CTGCCACCTCTGTGGGCAGAGCTTCCGAGGCTGGGTGGCCCTGGTTCTGCATCTGCGGGCCCATTCAGCTGCAA  424
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGCCACCTCTGTGGGCAGAGCTTCCGAGGCTGGGTGGCCCTGGTTCTGCATCTGCGGGCCCATTCAGCTGCAA  592

Query  425  AGCGGCCCATCGCTTGTCCCAAATGCGAGAGACGCTTCTGGCGACGAAAGCAGCTTCGAGCTCATCTGCGGCGG  498
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCGGCCCATCGCTTGTCCCAAATGCGAGAGACGCTTCTGGCGACGAAAGCAGCTTCGAGCTCATCTGCGGCGG  666

Query  499  TGCCACCCTCCCGCCCCGGAGGCCCGGCCCTTCATATGCGGCAACTGTGGCCGGAGCTTTGCCCAGTGGGACCA  572
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGCCACCCTCCCGCCCCGGAGGCCCGGCCCTTCATATGCGGCAACTGTGGCCGGAGCTTTGCCCAGTGGGACCA  740

Query  573  GCTAGTTGCCCACAAGCGGGTGCACGTAGCTGAGGCCCTGGAGGAGGCCGCAGCCAAGGCTCTGGGGCCCCGGC  646
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTAGTTGCCCACAAGCGGGTGCACGTAGCTGAGGCCCTGGAGGAGGCCGCAGCCAAGGCTCTGGGGCCCCGGC  814

Query  647  CCAGGGGCCGCCCCGCGGTGACCGCCCCCCGGCCCGGTGGAGATGCCGTCGACCGCCCCTTCCAGTGTGCCTGT  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAGGGGCCGCCCCGCGGTGACCGCCCCCCGGCCCGGTGGAGATGCCGTCGACCGCCCCTTCCAGTGTGCCTGT  888

Query  721  TGTGGCAAGCGCTTCCGGCACAAGCCCAACTTGATCGCTCACCGCCGCGTGCACACGGGCGAGCGGCCCCACCA  794
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTGGCAAGCGCTTCCGGCACAAGCCCAACTTGATCGCTCACCGCCGCGTGCACACGGGCGAGCGGCCCCACCA  962

Query  795  GTGCCCCGAGTGCGGGAAGCGCTTTACCAATAAGCCCTATCTGACTTCGCACCGGCGCATCCACACCGGCGAGA  868
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTGCCCCGAGTGCGGGAAGCGCTTTACCAATAAGCCCTATCTGACTTCGCACCGGCGCATCCACACCGGCGAGA  1036

Query  869  AGCCCTACCCGTGCAAAGAGTGCGGCCGCCGCTTCCGGCACAAACCCAACCTGCTGTCTCACAGCAAGATTCAC  942
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCCCTACCCGTGCAAAGAGTGCGGCCGCCGCTTCCGGCACAAACCCAACCTGCTGTCTCACAGCAAGATTCAC  1110

Query  943  AAGCGATCCGAGGGGTCGGCCCAGGCCGCCCCCGGCCCGGGGAGCCCCCAGCTGCCAGCCGGCCCCCAGGAGTC  1016
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGCGATCCGAGGGGTCGGCCCAGGCCGCCCCCGGCCCGGGGAGCCCCCAGCTGCCAGCCGGCCCCCAGGAGTC  1184

Query 1017  CGCGGCCGAGCCCACCCCGGCGGTACCTCTGAAACCGGCCCAGGAGCCGCCGCCAGGGGCCCCGCCAGAGCACC  1090
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGCGGCCGAGCCCACCCCGGCGGTACCTCTGAAACCGGCCCAGGAGCCGCCGCCAGGGGCCCCGCCAGAGCACC  1258

Query 1091  CGCAGGACCCGATCGAAGCCCCCCCCTCCCTCTACAGCTGCGACGACTGCGGCAGGAGCTTCCGGCTGGAGCGC  1164
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGCAGGACCCGATCGAAGCCCCCCCCTCCCTCTACAGCTGCGACGACTGCGGCAGGAGCTTCCGGCTGGAGCGC  1332

Query 1165  TTCCTGCGGGCCCACCAGCGGCAGCACACCGGGGAGCGGCCCTTCACCTGCGCCGAGTGCGGGAAGAACTTCGG  1238
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTCCTGCGGGCCCACCAGCGGCAGCACACCGGGGAGCGGCCCTTCACCTGCGCCGAGTGCGGGAAGAACTTCGG  1406

Query 1239  CAAGAAGACGCACCTGGTGGCGCACTCGCGCGTGCACTCCGGCGAGCGGCCCTTCGCCTGCGAGGAGTGCGGCC  1312
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAGAAGACGCACCTGGTGGCGCACTCGCGCGTGCACTCCGGCGAGCGGCCCTTCGCCTGCGAGGAGTGCGGCC  1480

Query 1313  GCCGCTTCTCCCAGGGCAGCCATCTGGCGGCGCATCGGCGCGACCACGCCCCCGATCGGCCCTTCGTGTGTCCC  1386
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCCGCTTCTCCCAGGGCAGCCATCTGGCGGCGCATCGGCGCGACCACGCCCCCGATCGGCCCTTCGTGTGTCCC  1554

Query 1387  GACTGCGGCAAGGCCTTCCGCCACAAACCCTACCTGGCGGCGCACCGGCGCATCCACACCGGCGAGAAGCCCTA  1460
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GACTGCGGCAAGGCCTTCCGCCACAAACCCTACCTGGCGGCGCACCGGCGCATCCACACCGGCGAGAAGCCCTA  1628

Query 1461  CGTCTGCCCCGACTGCGGCAAAGCCTTCAGCCAGAAGTCCAACCTGGTGTCGCACCGGCGCATCCACACGGGCG  1534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CGTCTGCCCCGACTGCGGCAAAGCCTTCAGCCAGAAGTCCAACCTGGTGTCGCACCGGCGCATCCACACGGGCG  1702

Query 1535  AGCGGCCCTACGCCTGTCCCGACTGCGACCGCAGCTTCAGCCAGAAGTCCAACCTCATCACCCACCGCAAGAGC  1608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGCGGCCCTACGCCTGTCCCGACTGCGACCGCAGCTTCAGCCAGAAGTCCAACCTCATCACCCACCGCAAGAGC  1776

Query 1609  CACATCCGGGACGGCGCCTTCTGCTGTGCCATCTGTGGCCAGACCTTCGACGACGAGGAGAGACTCCTGGCCCA  1682
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CACATCCGGGACGGCGCCTTCTGCTGTGCCATCTGTGGCCAGACCTTCGACGACGAGGAGAGACTCCTGGCCCA  1850

Query 1683  CCAGAAGAAGCACGATGTC  1701
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCAGAAGAAGCACGATGTC  1869