Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470097
• Subject: NM_001130091.2
• Aligned Length: 1440
• Identities: 1166
• Gaps: 226

Alignment

Query    1  ATGAACCAGCCGTGCAACTCGATGGAGCCGAGGGTGATGGACGATGACATGCTCAAGCTGGCCGTCGGGGACCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCAGCCGTGCAACTCGATGGAGCCGAGGGTGATGGACGATGACATGCTCAAGCTGGCCGTCGGGGACCA  74

Query   75  GGGCCCCCAGGAGGAGGCCGGGCAGCTGGCCAAGCAGGAGGGCATCCTCTTCAAGGATGTCCTGTCCCTGCAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGCCCCCAGGAGGAGGCCGGGCAGCTGGCCAAGCAGGAGGGCATCCTCTTCAAGGATGTCCTGTCCCTGCAGC  148

Query  149  TGGACTTTCGGAACATCCTCCGCATAGACAACCTCTGGCAGTTTGAGAACTTGAGGAAGCTGCAGCTGGACAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGACTTTCGGAACATCCTCCGCATAGACAACCTCTGGCAGTTTGAGAACTTGAGGAAGCTGCAGCTGGACAAT  222

Query  223  AACATCATTGAGAAGATCGAGGGCCTGGAGAACCTCGCACACCTGGTCTGGCTGGATCTGTCTTTCAACAACAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACATCATTGAGAAGATCGAGGGCCTGGAGAACCTCGCACACCTGGTCTGGCTGGATCTGTCTTTCAACAACAT  296

Query  297  TGAGACCATCGAGGGGCTGGACACACTGGTGAACCTGGAGGACCTGAGCTTGTTCAACAACCGGATCTCCAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGACCATCGAGGGGCTGGACACACTGGTGAACCTGGAGGACCTGAGCTTGTTCAACAACCGGATCTCCAAGA  370

Query  371  TCGACTCCCTGGACGCCCTCGTCAAGCTGCAGGTGTTGTCGCTGGGCAACAACCGGATTGACAACATGATGAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCGACTCCCTGGACGCCCTCGTCAAGCTGCAGGTGTTGTCGCTGGGCAACAACCGGATTGACAACATGATGAAC  444

Query  445  ATCATCTACCTTCGGCGGTTCAAGTGCCTGCGGACGCTCAGCCTCTCTAGGAACCCTATCTCTGAGGCAGAGGA  518
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATCATCTACCTCCGGCGGTTCAAGTGCCTGCGGACGCTCAGCCTCTCTAGGAACCCTATCTCTGAGGCAGAGGA  518

Query  519  TTACAAGATGTTCATCTGTGCCTACCTTCCTGACCTCATGTACCTGGACTACTGGCGCATTGATGACCACACAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTACAAGATGTTCATCTGTGCCTACCTTCCTGACCTCATGTACCTGGACTACCGGCGCATTGATGACCACACAA  592

Query  593  AAAAGCTTGCGGAGGCTAAGCACCAGTACAGCATCGACGAGCTGAAGCACCAGGAGAACCTGATGCAGGCCCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAAGCTTGCGGAGGCTAAGCACCAGTACAGCATCGACGAGCTGAAGCACCAGGAGAACCTGATGCAGGCCCAG  666

Query  667  CTGGAGGACGAGCAGGCGCAGCGGGAGGAGCTAGAGAAGCACAAGACTGCGTTTGTGGAACACCTGAATGGCTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGGAGGACGAGCAGGCGCAGCGGGAGGAGCTAGAGAAGCACAAGACTGCGTTTGTGGAACACCTGAATGGCTC  740

Query  741  CTTCCTGTTTGACAGCATGTACGCTGAGGACTCAGAGGGCAACAATCTGTCCTACCTGCCTGGTGTCGGTGAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTCCTGTTTGACAGCATGTACGCTGAGGACTCAGAGGGCAACAATCTGTCCTACCTGCCTGGTGTCGGTGAGC  814

Query  815  TCCTTGAGACCTACAAGGACAAGTTTGTCATCATCTGCGTGAATATTTTTGAGTATGGCCTGAAACAGCAGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCTTGAGACCTACAAGGACAAGTTTGTCATCATCTGCGTGAATATTTTTGAGTATGGCCTGAAACAGCAGGAG  888

Query  889  AAGCGGAAAACAGAGCTTGACACCTTCAGTGAATGTGTCCGTGAGGCCATCCAGGAAAACCAGGAGCAGGGCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGCGGAAAACAGAGCTTGACACCTTCAGTGAATGTGTCCGTGAGGCCATCCAGGAAAACCAGGAGCAGGGCAA  962

Query  963  ACGCAAGATTGCCAAATTCGAGGAGAAGCACTTGTCGAG-----------GGCGACCTGGACGA---GGACCTG  1022
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ..|||    ||.||   |||.|||
Sbjct  963  ACGCAAGATTGCCAAATTCGAGGAGAAGCACTTGTCGAGTTTAAGTGCCATTCGA----GAGGAGTTGGAACTG  1032

Query 1023  CCTAACGACCTGCGCGCGCTTTTTGTCGATA-AAGATACGATTGT-TAATGCTGTCGGGGCATC--------GC  1086
            ||.|||               .|||     | |||||  |||..| .|||||.||...|.||||        |.
Sbjct 1033  CCCAAC---------------ATTG-----AGAAGAT--GATCCTAGAATGCAGTGCTGACATCAGTGAGTTGT  1084

Query 1087  ACGACATCCACCTCCTGAAGATTGACAATCGAGAAGATG-AGCTGGT-GACCAGAATCAACTCTTGGTGTACAC  1158
            .||  ||.| .|||.|||.|.|          |.||||| ||||||| ||.|||         .|||.|.|.||
Sbjct 1085  TCG--ATGC-GCTCATGACGCT----------GGAGATGCAGCTGGTGGAGCAG---------CTGGAGGAGAC  1136

Query 1159  GTTTAATAGACAGGATTCACAAGGA-------TGAGATCATG--AGGA------ACCG--------CAAGCGCG  1209
                .|||.|||.|.||.| |||||       |||   ||||  ||||      |.||        ||| .||.
Sbjct 1137  ----TATAAACATGTTTGA-AAGGAACATTGTTGA---CATGGTAGGACTGTTTATCGAAAATGTCCAA-AGCC  1201

Query 1210  TGAAGGAGATCAATCAGTACATCGACCACATGCAGA-----------GCGAA----CTGGA------------C  1256
            |||.||      .|||||.|...||||   ||.|||           |.|||    |||||            |
Sbjct 1202  TGATGG------CTCAGTGCCGGGACC---TGGAGAATCACCACCACGAGAAGCTCCTGGAGATCTCTATCAGC  1266

Query 1257  AACCTG-----GAATGT----GGCGACATCCTAGAC--------------------------------------  1283
            |.||||     ||.|||    |||||   |||.|||                                      
Sbjct 1267  ACCCTGGAGAAGATTGTCGAGGGCGA---CCTGGACGAGGACCTGCCTAACGACCTGCGCGCGGGTCGTTTCCA  1337

Query 1284  ----------------------------------  1283
                                              
Sbjct 1338  AAAGTTCAATTATGTGGAGGCTTCTGGCACTTTC  1371