Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470097
• Subject: XM_024450961.1
• Aligned Length: 1686
• Identities: 1281
• Gaps: 403

Alignment

Query    1  ATGAACCAGCCGTGCAACTCGATGGAGCCGAGGGTGATGGACGATGACATGCTCAAGCTGGCCGTCGGGGACCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCAGCCGTGCAACTCGATGGAGCCGAGGGTGATGGACGATGACATGCTCAAGCTGGCCGTCGGGGACCA  74

Query   75  GGGCCCCCAGGAGGAGGCCGGGCAGCTGGCCAAGCAGGAGGGCATCCTCTTCAAGGATGTCCTGTCCCTGCAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGCCCCCAGGAGGAGGCCGGGCAGCTGGCCAAGCAGGAGGGCATCCTCTTCAAGGATGTCCTGTCCCTGCAGC  148

Query  149  TGGACTTTCGGA------------------------------------------------------------AC  162
            ||||||||||||                                                            ||
Sbjct  149  TGGACTTTCGGAGAAAAACAGCAGATGAACCCAAAGGGGAACAGGATGATGGCCAGGAGGATTCCCAGGAAGAC  222

Query  163  ATCCTCCGCATAGACAACCTCTGGCAGTTTGAGAACTTGAGGAAGCTGCAGCTGGACAATAACATCATTGAGAA  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCCTCCGCATAGACAACCTCTGGCAGTTTGAGAACTTGAGGAAGCTGCAGCTGGACAATAACATCATTGAGAA  296

Query  237  GATCGAGGGCCTGGAGAACCTCGCACACCTGGTCTGGCTGGATCTGTCTTTCAACAACATTGAGACCATCGAGG  310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCGAGGGCCTGGAGAACCTCGCACACCTGGTCTGGCTGGATCTGTCTTTCAACAACATTGAGACCATCGAGG  370

Query  311  GGCTGGACACACTGGTGAACCTGGAGGACCTGAGCTTGTTCAACAACCGGATCTCCAAGATCGACTCCCTGGAC  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCTGGACACACTGGTGAACCTGGAGGACCTGAGCTTGTTCAACAACCGGATCTCCAAGATCGACTCCCTGGAC  444

Query  385  GCCCTCGTCAAGCTGCAGGTGTTGTCGCTGGGCAACAACCGGATTGACAACATGATGAACATCATCTACCTTCG  458
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  GCCCTCGTCAAGCTGCAGGTGTTGTCGCTGGGCAACAACCGGATTGACAACATGATGAACATCATCTACCTCCG  518

Query  459  GCGGTTCAAGTGCCTGCGGACGCTCAGCCTCTCTAGGAACCCTATCTCTGAGGCAGAGGATTACAAGATGTTCA  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCGGTTCAAGTGCCTGCGGACGCTCAGCCTCTCTAGGAACCCTATCTCTGAGGCAGAGGATTACAAGATGTTCA  592

Query  533  TCTGTGCCTACCTTCCTGACCTCATGTACCTGGACTACTGGCGCATTGATGACCACACA---------------  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||               
Sbjct  593  TCTGTGCCTACCTTCCTGACCTCATGTACCTGGACTACCGGCGCATTGATGACCACACAGCAAGTGTCTCCCTC  666

Query  592  ------------------------------------------AAAAAGCTTGCGGAGGCTAAGCACCAGTACAG  623
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCAGTCTCCCAGCCCTGTGAGACAGATTCCTCAAGCCCCCAGAAAAAGCTTGCGGAGGCTAAGCACCAGTACAG  740

Query  624  CATCGACGAGCTGAAGCACCAGGAGAACCTGATGCAGGCCCAGCTGGAGGACGAGCAGGCGCAGCGGGAGGAGC  697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATCGACGAGCTGAAGCACCAGGAGAACCTGATGCAGGCCCAGCTGGAGGACGAGCAGGCGCAGCGGGAGGAGC  814

Query  698  TAGAGAAGCACAAGACTGCGTTTGTGGAACACCTGAATGGCTCCTTCCTGTTTGACAGCATGTACGCTGAGGAC  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAGAGAAGCACAAGACTGCGTTTGTGGAACACCTGAATGGCTCCTTCCTGTTTGACAGCATGTACGCTGAGGAC  888

Query  772  TCAGAGGGCAACAATCTGTCCTACCTGCCTGGTGTCGGTGAGCTCCTTGAGACCTACAAGGACAAGTTTGTCAT  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCAGAGGGCAACAATCTGTCCTACCTGCCTGGTGTCGGTGAGCTCCTTGAGACCTACAAGGACAAGTTTGTCAT  962

Query  846  CATCTGCGTGAATATTTTTGAGTATGGCCTGAAACAGCAGGAGAAGCGGAAAACAGAGCTTGACACCTTCAGTG  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATCTGCGTGAATATTTTTGAGTATGGCCTGAAACAGCAGGAGAAGCGGAAAACAGAGCTTGACACCTTCAGTG  1036

Query  920  AATGTGTCCGTGAGGCCATCCAGGAAAACCAGGAGCAGGGCAAACGCAAGATTGCCAAATTCGAGGAGAAGCAC  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AATGTGTCCGTGAGGCCATCCAGGAAAACCAGGAGCAGGGCAAACGCAAGATTGCCAAATTCGAGGAGAAGCAC  1110

Query  994  --------------------------------------------------------------------------  993
                                                                                      
Sbjct 1111  TTGTCGAGTTTAAGTGCCATTCGAGAGGAGTTGGAACTGCCCAACATTGAGAAGATGATCCTAGAATGCAGTGC  1184

Query  994  --------------------------------------------------------------------------  993
                                                                                      
Sbjct 1185  TGACATCAGTGAGTTGTTCGATGCGCTCATGACGCTGGAGATGCAGCTGGTGGAGCAGCTGGAGGAGACTATAA  1258

Query  994  --------------------------------------------------------------------------  993
                                                                                      
Sbjct 1259  ACATGTTTGAAAGGAACATTGTTGACATGGTAGGACTGTTTATCGAAAATGTCCAAAGCCTGATGGCTCAGTGC  1332

Query  994  ----------------------------------------------------------------TTGTCGAGGG  1003
                                                                            ||||||||||
Sbjct 1333  CGGGACCTGGAGAATCACCACCACGAGAAGCTCCTGGAGATCTCTATCAGCACCCTGGAGAAGATTGTCGAGGG  1406

Query 1004  CGACCTGGACGAGGACCTGCCTAACGACCTGCGCGCGCTTTTTGTCGATAAAGATACGATTGTTAATGCTGTCG  1077
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGACCTGGACGAGGACCTGCCTAACGACCTGCGCGCGCTTTTTGTCGATAAAGATACGATTGTTAATGCTGTCG  1480

Query 1078  GGGCATCGCACGACATCCACCTCCTGAAGATTGACAATCGAGAAGATGAGCTGGTGACCAGAATCAACTCTTGG  1151
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGGCATCGCACGACATCCACCTCCTGAAGATTGACAATCGAGAAGATGAGCTGGTGACCAGAATCAACTCTTGG  1554

Query 1152  TGTACACGTTTAATAGACAGGATTCACAAGGATGAGATCATGAGGAACCGCAAGCGCGTGAAGGAGATCAATCA  1225
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGTACACGTTTAATAGACAGGATTCACAAGGATGAGATCATGAGGAACCGCAAGCGCGTGAAGGAGATCAATCA  1628

Query 1226  GTACATCGACCACATGCAGAGCGAACTGGACAACCTGGAATGTGGCGACATCCTAGAC  1283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GTACATCGACCACATGCAGAGCGAACTGGACAACCTGGAATGTGGCGACATCCTAGAC  1686