Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470126
• Subject: XM_006520092.4
• Aligned Length: 2085
• Identities: 1520
• Gaps: 387

Alignment

Query    1  ATGAGTGGTGCAGCTTTGGGACTTGAGATTGTTTTTGTCTTTTTTCTGGCATTATTTCTGCTTCATCGATATGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGACTTTAAGAAACAGCATAGACTTGTGATTATTGGAACACTGCTTGCTTGGTATCTCTGCTTTCTTATTGTCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCATACTGCCTCTGGATGTTAGTACGACAATATACAACCGGTGCAAGCATGCTGCTGCAAATTCAAGCCCTCCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAGAATAGCAACATTACAGGATTGTACGCAACTGCTAACCCTGTTCCAAGCCAGCATCCTTGTTTCAAGCCATG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GAGTTACATTCCTGATGGAATCATGCCAATTTTCTGGAGGGTAGTGTATTGGACGTCACAATTTTTAACATGGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TTCTCTTACCTTTTATGCAGTCATATGCAAGATCAGGAGGGTTTTCCATCACTGGAAAGATCAAAACTGCACTA  444
                          ||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.
Sbjct    1  --------------ATGCAGTCATATGCAAGATCTGGAGGTTTCTCCATCACCGGCAAGATCAAAACAGCCCTG  60

Query  445  ATTGAGAATGCAATCTACTATGGCACCTATTTGCTGATTTTTGGAGCATTTTTAATTTATGTAGCTGTAAACCC  518
            |||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||
Sbjct   61  ATTGAGAATGCCATCTATTACGGCACTTACTTGCTGATATTTGGAGCATTTCTGATTTACGTAGCTGTAAACCC  134

Query  519  ACATTTACATTTAGAATGGAACCAGCTTCAGACAATTGGGATAGCTGCTGCAAATACATGGGGTCTGTTTCTTC  592
            ||.|||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  135  ACGTTTGCATTTAGAATGGAACCAACTTCAGACGATTGGGATAGCTGCTGCCAACACATGGGGTCTGTTTCTCC  208

Query  593  TTGTGTTGTTGTTGGGGTATGGCTTGGTGGAAATTCCTCGATCATACTGGAATGGAGCAAAAAGGGGTTATCTA  666
            |||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  209  TTGTGTTATTATTGGGGTATGGATTGGTGGAAATTCCTCGGTCATACTGGAATGGAGCCAAAAGGGGTTATCTT  282

Query  667  CTTATGAAAACGTATTTTAAGGCAGCCAAACTGATGACAGAGAAAGCAGATGCAGAAGAGAATTTGGAAGATGC  740
            ||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct  283  CTTATGAAGACTTACTTTAAGGCAGCCAAACTGATGACAGAGAAGGCAGATGCAGAAGAGAATTTGGAGGATGT  356

Query  741  CATGGAGGAGGTTCGTAAAGTGAATGAAAGCATCAAGTATAATCACCCATTGAGAAAATGTGTTGATACAATAC  814
            .||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||.||||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct  357  AATGGAGGAGGTTCGTAAAGTAAATGAGAGCATCAAGTACAACCACCCACTGAGGAAGTGTGTAGACACAATAC  430

Query  815  TTAAAAAGTGCCCTACAGAGTATCAGGAAAAAATGGGTAGGAACATGGATGATTATGAAGATTTTGATGAAAAG  888
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  431  TTAAAAAGTGCCCTACAGATTATCAGGAAAAGATGGGTAGGAATATGGATGACTATGAAGATTTTGACGAAAAG  504

Query  889  CATAGTATCTATCCAAGTGAAAAAAGTCTGGTAAAACTTCATAAACAGGTGATTTATTCAGTTCAGAGACACCG  962
            |..|.||.|||.|||||||||||||||.||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  505  CGCAATACCTACCCAAGTGAAAAAAGTTTGGTAAAATTGCATAAACAGGTGATTTATTCAGTTCAAAGGCACCG  578

Query  963  TCGAACTCAAGTACAATGGCAGATTCTTTTGGAACAAGCATTTTATCTAGAAGATGTAGCAAAAAATGAAACTA  1036
            |||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  579  TCGGACTCAAGTGCAATGGCAGATTCTTTTGGAACAGGCATTCTATCTAGAAGATGTAGCAAAAAATGAAACTA  652

Query 1037  GTGCTACTCATCAGTTTGTTCACACCTTTCAATCGCCAGAGCCAGAAAATCGATTTATCCAATATTTTTATAAT  1110
            |.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  653  GCGCAACTCACCAGTTTGTTCACACCTTTCAGTCACCTGAGCCAGAAAATCGATTTATCCAATATTTTTATAAT  726

Query 1111  CCTACATTTGAATGGTACTGGGAATGTCTTTTGCGACCATGGTTTTACAAGATACTTGCTGTGGTTCTGTCCAT  1184
            |||||..||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||.||..||||||||||||.||||.||
Sbjct  727  CCTACTGTTGAGTGGTACTGGGAATGCCTTTTGCGTCCATGGTTTCACAGGACCCTTGCTGTGGTTTTGTCTAT  800

Query 1185  CTTCTCTGTGATTGTTGTGTGGTCAGAGTGCACATTCTTTAGCACTACTCCTGTCTTATCCCTCTTTGCGGTCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  801  CTTCTCTGTGATTGTTGTGTGGTCAGAGTGTACCTTCTTTAGCACAACTCCTGTCTTATCCCTTTTTGCAGTAT  874

Query 1259  TCATACAGCTGGCAGAAAAAACATATAATTATATTTATATCGAGATTGCCTGCTTCCTTTCCATCTTCTTCCTA  1332
            ||||||||||||||||||.||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.||
Sbjct  875  TCATACAGCTGGCAGAAAGAACATACAATTACATTTATATTGAGATTGCTTGCTTCCTTTCCATCTTCTTCTTA  948

Query 1333  AGTATCTGTGTTTATTCTACTGTGTTCAGGATTCGTGTATTTAACTATTATTATTTGGCCTCACATCACCAGAC  1406
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||..||||||||||.||.|||||
Sbjct  949  AGCATCTGTGTTTACTCTACTGTGTTCAGGATCCGCGTGTTTAACTACTACTACCTGGCCTCACACCATCAGAC  1022

Query 1407  TGATGCTTATAGCCTTCTTTTCAGTGGCATGCTATTTTGCCGTTTGACACCTCCTTTATGTCTTAATTTCTTGG  1480
            .|||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1023  CGATGCTTATAGCCTTCTGTTCAGTGGCATGTTATTTTGCCGTTTGACTCCTCCTTTATGTCTTAACTTCTTGG  1096

Query 1481  GTTTGACCCATATGGATTCATCTATCTCTCACAAGAATACTCAACCAACTGCTTATACATCTATTATGGGTTCC  1554
            |.||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1097  GATTGACCCATATGGATTCATCCATCTCCCACCAGAATACCCAGCCAACTGCATATACATCTATCATGGGTTCC  1170

Query 1555  ATGAAAGTTTTATCCTTTATTGCAGATGGATTCTATATATATTATCCTATGTTGGTGGTAATTCTCTGCATTGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1171  ATGAAAGTTTTATCCTTTATTGCAGATGGATTCTATATATATTATCCTATGTTGGTAGTAATTCTCTGCATCGC  1244

Query 1629  TACTTATTTTAGTTTGGGAACCCGTTGTTTGAATCTGCTCGGTTTCCAGCAGTTTATGGGAGATGATGATATGA  1702
            |||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct 1245  TACGTATTTTAGTTTGGGCACCCGTTGTTTGAATCTGCTTGGTTTCCAGCAGTTCATGGGAGATAATGATATGA  1318

Query 1703  CATCAGACTTAGTTAATGAAGGAAAAGAATTAATCAGAAAAGAGAAGAGAAAAAGGCAAAGGCAAGAAGAAGGT  1776
            |||||||..|||||.|||||||||||||||||||||||..||||||.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1319  CATCAGATCTAGTTGATGAAGGAAAAGAATTAATCAGACGAGAGAAAAGAAAAAGGCAAAGACAAGAGGAAGGT  1392

Query 1777  GAAAATCGAAGAAGAGAATGGAAAGAACGTTATGGACACAATAGAGAAGATTCCACTAGGAACAGAAATATTCA  1850
            ||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||..|.||
Sbjct 1393  GAAAATAGAAGAAGAGAGTGGAAAGAACGTTATGGACACAACAGAGAGGATTCCACTCGGAACAGAAACGTCCA  1466

Query 1851  TACTGACCCCAAAGAGTCAAACTTCTCAGATGTTAATACCAACCGTTCTGCATTCAAATATACCAGGGCTAATA  1924
            |.|||||||||||||||||||.||||||||....|.|||||||.|.|   |||.||||||.|||||||||||||
Sbjct 1467  TCCTGACCCCAAAGAGTCAAATTTCTCAGACACGACTACCAACTGGT---CATCCAAATACACCAGGGCTAATA  1537

Query 1925  ACAGGACTGAAAGGGACCGGATAGAACTTCTCCAAGATGCAGAACCTTTGGATTTTAATGCAGAAACATTCACT  1998
            |||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||.|||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 1538  ACAGGACTGAAAGAGACCGAATAGAACTTCTCCAGGATGCTGAGCCTCTGGATTTTAATGCAGAAACGTTTACG  1611

Query 1999  GATGATCCTCTTGAATCTGAATCAGGAAGGTATCAGCCTGGTGGACGATATCTCTCGATGTCTCGCAGTGACAT  2072
            |||||..||||.|||.||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||..||||...||
Sbjct 1612  GATGAATCTCTGGAACCTGAGTCAGGAAGGTATCAACCTGGTGGGCGATATCTCTCCATGTCTTCCAGTATAAT  1685

Query 2073  ATTTAATGATGTT  2085
            ||||.|.|||.|.
Sbjct 1686  ATTTGAAGATATC  1698