Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470126
• Subject: XM_017010024.2
• Aligned Length: 2097
• Identities: 1395
• Gaps: 687

Alignment

Query    1  ATGAGTGGTGCAGCTTTGGGACTTGAGATTGTTTTTGTCTTTTTTCTGGCATTATTTCTGCTTCATCGATATGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGACTTTAAGAAACAGCATAGACTTGTGATTATTGGAACACTGCTTGCTTGGTATCTCTGCTTTCTTATTGTCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCATACTGCCTCTGGATGTTAGTACGACAATATACAACCGGTGCAAGCATGCTGCTGCAAATTCAAGCCCTCCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAGAATAGCAACATTACAGGATTGTACGCAACTGCTAACCCTGTTCCAAGCCAGCATCCTTGTTTCAAGCCATG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GAGTTACATTCCTGATGGAATCATGCCAATTTTCTGGAGGGTAGTGTATTGGACGTCACAATTTTTAACATGGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TTCTCTTACCTTTTATGCAGTCATATGCAAGATCAGGAGGGTTTTCCATCACTGGAAAGATCAAAACTGCACTA  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  ATTGAGAATGCAATCTACTATGGCACCTATTTGCTGATTTTTGGAGCATTTTTAATTTATGTAGCTGTAAACCC  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  ACATTTACATTTAGAATGGAACCAGCTTCAGACAATTGGGATAGCTGCTGCAAATACATGGGGTCTGTT-----  587
                                                                     |||..||.|.||     
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------ATGATGTGTCTTGTCCA  17

Query  588  TCTTCTTGTGTTGTTGTTGGGGTATG-----GCTTGGTGGAAATTCCTCGATCATACTGGAATGGAGCAAAAAG  656
            ||||||               ||.||     |.||..||||||.|        ||| |..|||.|.||    ||
Sbjct   18  TCTTCT---------------GTCTGACAGAGATTCATGGAAAAT--------ATA-TTCAATAGTGC----AG  63

Query  657  GGGTTATCTA--CTTATGAAAACGTATTTTAAGGCAGCCAAACTGATGACAGAGAAAGCAGATGCAGAAGAGAA  728
            ||     |||  |.|||       ||||||                                            
Sbjct   64  GG-----CTACGCCTAT-------TATTTT--------------------------------------------  81

Query  729  TTTGGAAGATGCCATGGAGGAGGTTCGTAAAGTGAATGAAAGCATCAAGTATAATCACCCATTGAGAAAATGTG  802
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   82  ----------------GAGGAGGTTCGTAAAGTGAATGAAAGCATCAAGTATAATCACCCATTGAGAAAATGTG  139

Query  803  TTGATACAATACTTAAAAAGTGCCCTACAGAGTATCAGGAAAAAATGGGTAGGAACATGGATGATTATGAAGAT  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  140  TTGATACAATACTTAAAAAGTGCCCTACAGAGTATCAGGAAAAAATGGGTAGGAACATGGATGATTATGAAGAT  213

Query  877  TTTGATGAAAAGCATAGTATCTATCCAAGTGAAAAAAGTCTGGTAAAACTTCATAAACAGGTGATTTATTCAGT  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  214  TTTGATGAAAAGCATAGTATCTATCCAAGTGAAAAAAGTCTGGTAAAACTGCATAAACAGGTGATTTATTCAGT  287

Query  951  TCAGAGACACCGTCGAACTCAAGTACAATGGCAGATTCTTTTGGAACAAGCATTTTATCTAGAAGATGTAGCAA  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  TCAGAGACACCGTCGAACTCAAGTACAATGGCAGATTCTTTTGGAACAAGCATTTTATCTAGAAGATGTAGCAA  361

Query 1025  AAAATGAAACTAGTGCTACTCATCAGTTTGTTCACACCTTTCAATCGCCAGAGCCAGAAAATCGATTTATCCAA  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  362  AAAATGAAACTAGTGCTACTCATCAGTTTGTTCACACCTTTCAATCGCCAGAGCCAGAAAATCGATTTATCCAA  435

Query 1099  TATTTTTATAATCCTACATTTGAATGGTACTGGGAATGTCTTTTGCGACCATGGTTTTACAAGATACTTGCTGT  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  436  TATTTTTATAATCCTACATTTGAATGGTACTGGGAATGTCTTTTGCGACCATGGTTTTACAAGATACTTGCTGT  509

Query 1173  GGTTCTGTCCATCTTCTCTGTGATTGTTGTGTGGTCAGAGTGCACATTCTTTAGCACTACTCCTGTCTTATCCC  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  510  GGTTCTGTCCATCTTCTCTGTGATTGTTGTGTGGTCAGAGTGCACATTCTTTAGCACTACTCCTGTCTTATCCC  583

Query 1247  TCTTTGCGGTCTTCATACAGCTGGCAGAAAAAACATATAATTATATTTATATCGAGATTGCCTGCTTCCTTTCC  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  584  TCTTTGCGGTCTTCATACAGCTGGCAGAAAAAACATATAATTATATTTATATCGAGATTGCCTGCTTCCTTTCC  657

Query 1321  ATCTTCTTCCTAAGTATCTGTGTTTATTCTACTGTGTTCAGGATTCGTGTATTTAACTATTATTATTTGGCCTC  1394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658  ATCTTCTTCCTAAGTATCTGTGTTTATTCTACTGTGTTCAGGATTCGTGTATTTAACTATTATTATTTGGCCTC  731

Query 1395  ACATCACCAGACTGATGCTTATAGCCTTCTTTTCAGTGGCATGCTATTTTGCCGTTTGACACCTCCTTTATGTC  1468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  732  ACATCACCAGACTGATGCTTATAGCCTTCTTTTCAGTGGCATGCTATTTTGCCGTTTGACACCTCCTTTATGTC  805

Query 1469  TTAATTTCTTGGGTTTGACCCATATGGATTCATCTATCTCTCACAAGAATACTCAACCAACTGCTTATACATCT  1542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  806  TTAATTTCTTGGGTTTGACCCATATGGATTCATCTATCTCTCACAAGAATACTCAACCAACTGCTTATACATCT  879

Query 1543  ATTATGGGTTCCATGAAAGTTTTATCCTTTATTGCAGATGGATTCTATATATATTATCCTATGTTGGTGGTAAT  1616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  ATTATGGGTTCCATGAAAGTTTTATCCTTTATTGCAGATGGATTCTATATATATTATCCTATGTTGGTGGTAAT  953

Query 1617  TCTCTGCATTGCTACTTATTTTAGTTTGGGAACCCGTTGTTTGAATCTGCTCGGTTTCCAGCAGTTTATGGGAG  1690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  954  TCTCTGCATTGCTACTTATTTTAGTTTGGGAACCCGTTGTTTGAATCTGCTCGGTTTCCAGCAGTTTATGGGAG  1027

Query 1691  ATGATGATATGACATCAGACTTAGTTAATGAAGGAAAAGAATTAATCAGAAAAGAGAAGAGAAAAAGGCAAAGG  1764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028  ATGATGATATGACATCAGACTTAGTTAATGAAGGAAAAGAATTAATCAGAAAAGAGAAGAGAAAAAGGCAAAGG  1101

Query 1765  CAAGAAGAAGGTGAAAATCGAAGAAGAGAATGGAAAGAACGTTATGGACACAATAGAGAAGATTCCACTAGGAA  1838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  CAAGAAGAAGGTGAAAATCGAAGAAGAGAATGGAAAGAACGTTATGGACACAATAGAGAAGATTCCACTAGGAA  1175

Query 1839  CAGAAATATTCATACTGACCCCAAAGAGTCAAACTTCTCAGATGTTAATACCAACCGTTCTGCATTCAAATATA  1912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176  CAGAAATATTCATACTGACCCCAAAGAGTCAAACTTCTCAGATGTTAATACCAACCGTTCTGCATTCAAATATA  1249

Query 1913  CCAGGGCTAATAACAGGACTGAAAGGGACCGGATAGAACTTCTCCAAGATGCAGAACCTTTGGATTTTAATGCA  1986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  CCAGGGCTAATAACAGGACTGAAAGGGACCGGATAGAACTTCTCCAAGATGCAGAACCTTTGGATTTTAATGCA  1323

Query 1987  GAAACATTCACTGATGATCCTCTTGAATCTGAATCAGGAAGGTATCAGCCTGGTGGACGATATCTCTCGATGTC  2060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324  GAAACATTCACTGATGATCCTCTTGAATCTGAATCAGGAAGGTATCAGCCTGGTGGACGATATCTCTCGATGTC  1397

Query 2061  TCGCAGTGACATATTTAATGATGTT  2085
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398  TCGCAGTGACATATTTAATGATGTT  1422