Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470126
• Subject: XR_001742340.2
• Aligned Length: 3035
• Identities: 2047
• Gaps: 987

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ACGGGGTAGGCGGGGAGGCGGAAGCGGGCGGCGCTACGGCTGACTGGGAAATGTCAGCCGCTGGACTGTAGACG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GATTTTCCTTTCTCGGGAGCCCGCAGGCCTTCTGGTGATCGCCAGCGCTGTCGTCTCTGAGCGTGGATCCCAGA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ACCTGGACAGCTGTGGCGGCCGCCGTTTCCCGGTCCCGTCCAGACGCTGTCTGGCGAGATCGGACGGTGAGCCT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  AAGGCGGAACGCGTGAGGCGCTTTTGAGTCTGGGGTCCGGGGCCGAGAGCAGGCGGAAAGAGAGGGGACCCGGC  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  AGACCCCGAGTGGCCGCCGCTGCGGGGCCCAAGTCCTTGGCTGCTGAGTGGTGACAGTAGCCCAGCCCGCCGGC  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  CAGGTGAGAGGCTGCGAACTGCTGGCGTCGCACCTGTTCGTCCTTTTGCCAGGAAGCTTCTTCCTCCGTCGGGG  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  AGAAGGCGGCCCTAAGAATTGGGTCTGTGGACGGGATCCTTCCTTTATCTGTAAAATAACGCACAACAGCTAAA  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  CACGCCGTTGGAACGAGAGACAATGGTTTAATTTTAGGGGAGCCGGAGACCCCAGCGGGTCCTGTGTGGTGGGA  592

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  593  AGGCTGCGCATGCCCTTGCAGCCTTGACAGGTCTCATAAATAGCAACATGGGAATAAATGAAAGGACTGTATTT  666

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  667  TGCAACGAGCTTTACCCGTGCACGCAGGGGGCCTCCAGCAAAGCCATTTGGTTGCTTGCTGTCGCTCAGCTGGC  740

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  741  TACGTGTGTTTGCGTCGCCGCCTAAAAGCGAGCTGCTTTCAGCCTATCTCTGCTGAGAAGAGTTTGGGGGCAGT  814

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  815  AAGAGTAGGGAGCGTGACATATTCCAGATATGGTCCAGACCTGTACATGAATAACTTTGGTTAGTCAGAGTGAA  888

Query    1  ----------ATGAGTGGTGCAGCTTTGGGACTTGAGATTGTTTTTGTCTTTTTTCTGGCATTATTTCTGCTTC  64
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATATTCAATAATGAGTGGTGCAGCTTTGGGACTTGAGATTGTTTTTGTCTTTTTTCTGGCATTATTTCTGCTTC  962

Query   65  ATCGATATGGAGACTTTAAGAAACAGCATAGACTTGTGATTATTGGAACACTGCTTGCTTGGTATCTCTGCTTT  138
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATCGATATGGAGACTTTAAGAAACAGCATAGACTTGTGATTATTGGAACACTGCTTGCTTGGTATCTCTGCTTT  1036

Query  139  CTTATTGTCTTCATACTGCCTCTGGATGTTAGTACGACAATATACAACCGGTGCAAGCATGCTGCTGCAAATTC  212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTTATTGTCTTCATACTGCCTCTGGATGTTAGTACGACAATATACAACCGGTGCAAGCATGCTGCTGCAAATTC  1110

Query  213  AAGCCCTCCTGAGAATAGCAACATTACAGGATTGTACGCAACTGCTAACCCTGTTCCAAGCCAGCATCCTTGTT  286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGCCCTCCTGAGAATAGCAACATTACAGGATTGTACGCAACTGCTAACCCTGTTCCAAGCCAGCATCCTTGTT  1184

Query  287  TCAAGCCATGGAGTTACATTCCTGATGGAATCATGCCAATTTTCTGGAGGGTAGTGTATTGGACGTCACAATTT  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCAAGCCATGGAGTTACATTCCTGATGGAATCATGCCAATTTTCTGGAGGGTAGTGTATTGGACGTCACAATTT  1258

Query  361  TTAACATGGATTCTCTTACCTTTTATGCAGTCATATGCAAGATCAGGAGGGTTTTCCATCACTGGAAAGATCAA  434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTAACATGGATTCTCTTACCTTTTATGCAGTCATATGCAAGATCAGGAGGGTTTTCCATCACTGGAAAGATCAA  1332

Query  435  AACTGCACTAATTGAGAATGCAATCTACTATGGCACCTATTTGCTGATTTTTGGAGCATTTTTAATTTATGTAG  508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AACTGCACTAATTGAGAATGCAATCTACTATGGCACCTATTTGCTGATTTTTGGAGCATTTTTAATTTATGTAG  1406

Query  509  CTGTAAACCCACATTTACATTTAGAATGGAACCAGCTTCAGACAATTGGGATAGCTGCTGCAAATACATGGGGT  582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTGTAAACCCACATTTACATTTAGAATGGAACCAGCTTCAGACAATTGGGATAGCTGCTGCAAATACATGGGGT  1480

Query  583  CTGTTTCTTCTTGTGTTGTTGTTGGGGTATGGCTTGGTGGAAATTCCTCGATCATACTGGAATGGAGCAAAAAG  656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGTTTCTTCTTGTGTTGTTGTTGGGGTATGGCTTGGTGGAAATTCCTCGATCATACTGGAATGGAGCAAAAAG  1554

Query  657  GGGTTATCTACTTATGAAAACGTATTTTAAGGCAGCCAAACTGATGACAGAGAAAGCAGATGCAGAAGAGAATT  730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGGTTATCTACTTATGAAAACGTATTTTAAGGCAGCCAAACTGATGACAGAGAAAGCAGATGCAGAAGAGAATT  1628

Query  731  TGGAAGATGCCATGGAGGAGGTTCGTAAAGTGAATGAAAGCATCAAGTATAATCACCCATTGAGAAAATGTGTT  804
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGGAAGATGCCATGGAGGAGGTTCGTAAAGTGAATGAAAGCATCAAGTATAATCACCCATTGAGAAAATGTGTT  1702

Query  805  GATACAATACTTAAAAAGTGCCCTACAGAGTATCAGGAAAAAATGGGTAGGAACATGGATGATTATGAAGATTT  878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GATACAATACTTAAAAAGTGCCCTACAGAGTATCAGGAAAAAATGGGTAGGAACATGGATGATTATGAAGATTT  1776

Query  879  TGATGAAAAGCATAGTATCTATCCAAGTGAAAAAAGTCTGGTAAAACTTCATAAACAGGTGATTTATTCAGTTC  952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TGATGAAAAGCATAGTATCTATCCAAGTGAAAAAAGTCTGGTAAAACTGCATAAACAGGTGATTTATTCAGTTC  1850

Query  953  AGAGACACCGTCGAACTCAAGTACAATGGCAGATTCTTTTGGAACAAGCATTTTATCTAGAAGATGTAGCAAAA  1026
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGAGACACCGTCGAACTCAAGTACAATGGCAGATTCTTTTGGAACAAGCATTTTATCTAGAAGATGTAGCAAAA  1924

Query 1027  AATGAAACTAGTGCTACTCATCAGTTTGTTCACACCTTTCAATCGCCAGAGCCAGAAAATCGATTTATCCAATA  1100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AATGAAACTAGTGCTACTCATCAGTTTGTTCACACCTTTCAATCGCCAGAGCCAGAAAATCGATTTATCCAATA  1998

Query 1101  TTTTTATAATCCTACATTTGAATGGTACTGGGAATGTCTTTTGCGACCATGGTTTTACAAGATACTTGCTGTGG  1174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTTTTATAATCCTACATTTGAATGGTACTGGGAATGTCTTTTGCGACCATGGTTTTACAAGATACTTGCTGTGG  2072

Query 1175  TTCTGTCCATCTTCTCTGTGATTGTTGTGTGGTCAGAGTGCACATTCTTTAGCACTACTCCTGTCTTATCCCTC  1248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TTCTGTCCATCTTCTCTGTGATTGTTGTGTGGTCAGAGTGCACATTCTTTAGCACTACTCCTGTCTTATCCCTC  2146

Query 1249  TTTGCGGTCTTCATACAGCTGGCAGAAAAAACATATAATTATATTTATATCGAGATTGCCTGCTTCCTTTCCAT  1322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TTTGCGGTCTTCATACAGCTGGCAGAAAAAACATATAATTATATTTATATCGAGATTGCCTGCTTCCTTTCCAT  2220

Query 1323  CTTCTTCCTAAGTATCTGTGTTTATTCTACTGTGTTCAGGATTCGTGTATTTAACTATTATTATTTGGCCTCAC  1396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTTCTTCCTAAGTATCTGTGTTTATTCTACTGTGTTCAGGATTCGTGTATTTAACTATTATTATTTGGCCTCAC  2294

Query 1397  ATCACCAGACTGATGCTTATAGCCTTCTTTTCAGTGGCATGCTATTTTGCCGTTTGACACCTCCTTTATGTCTT  1470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  ATCACCAGACTGATGCTTATAGCCTTCTTTTCAGTGGCATGCTATTTTGCCGTTTGACACCTCCTTTATGTCTT  2368

Query 1471  AATTTCTTGGGTTTGACCCATATGGATTCATCTATCTCTCACAAGAATACTCAACCAACTGCTTATACATCTAT  1544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 2369  AATTTCTTGGGTTTGACCCATATGGATTCATCTATCTCTCACAAGAATACTCAACCAACTGCTTATACATCT--  2440

Query 1545  TATGGGTTCCATGAAAGTTTTATCCTTTATTGCAGATGGATTCTATATATATTATCCTATGTTGGTGGTAATTC  1618
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2441  -----------------------------------ATGGATTCTATATATATTATCCTATGTTGGTGGTAATTC  2479

Query 1619  TCTGCATTGCTACTTATTTTAGTTTGGGAACCCGTTGTTTGAATCTGCTCGGTTTCCAGCAGTTTATGGGAGAT  1692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2480  TCTGCATTGCTACTTATTTTAGTTTGGGAACCCGTTGTTTGAATCTGCTCGGTTTCCAGCAGTTTATGGGAGAT  2553

Query 1693  GATGATATGACATCAGACTTAGTTAATGAAGGAAAAGAATTAATCAGAAAAGAGAAGAGAAAAAGGCAAAGGCA  1766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2554  GATGATATGACATCAGACTTAGTTAATGAAGGAAAAGAATTAATCAGAAAAGAGAAGAGAAAAAGGCAAAGGCA  2627

Query 1767  AGAAGAAGGTGAAAATCGAAGAAGAGAATGGAAAGAACGTTATGGACACAATAGAGAAGATTCCACTAGGAACA  1840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2628  AGAAGAAGGTGAAAATCGAAGAAGAGAATGGAAAGAACGTTATGGACACAATAGAGAAGATTCCACTAGGAACA  2701

Query 1841  GAAATATTCATACTGACCCCAAAGAGTCAAACTTCTCAGATGTTAATACCAACCGTTCTGCATTCAAATATACC  1914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2702  GAAATATTCATACTGACCCCAAAGAGTCAAACTTCTCAGATGTTAATACCAACCGTTCTGCATTCAAATATACC  2775

Query 1915  AGGGCTAATAACAGGACTGAAAGGGACCGGATAGAACTTCTCCAAGATGCAGAACCTTTGGATTTTAATGCAGA  1988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2776  AGGGCTAATAACAGGACTGAAAGGGACCGGATAGAACTTCTCCAAGATGCAGAACCTTTGGATTTTAATGCAGA  2849

Query 1989  AACATTCACTGATGATCCTCTTGAATCTGAATCAGGAAGGTATCAGCCTGGTGGACGATATCTCTCGATGTCTC  2062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2850  AACATTCACTGATGATCCTCTTGAATCTGAATCAGGAAGGTATCAGCCTGGTGGACGATATCTCTCGATGTCTC  2923

Query 2063  GCAGTGACATATTTAATGATGTT---------------------------------------------------  2085
            |||||||||||||||||||||||                                                   
Sbjct 2924  GCAGTGACATATTTAATGATGTTTAAAGTCTGAAAAAGTTTGTGGGACCACTAACCAAGGTCAACACATCAGTT  2997

Query 2086  -  2085
             
Sbjct 2998  C  2998