Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470138
• Subject: NM_001166135.2
• Aligned Length: 2277
• Identities: 1854
• Gaps: 423

Alignment

Query    1  ATGGCCGGCCTGACCTTATTTGTGGGCCGCCTCCCGCCCTCGGCCCGCAGTGAGCAGCTGGAGGAACTGTTCAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCGGCCTGACCTTATTTGTGGGCCGCCTCCCGCCCTCGGCCCGCAGTGAGCAGCTGGAGGAACTGTTCAG  74

Query   75  TCAGGTGGGGCCGGTGAAGCAGTGCTTCGTGGTGACTGAAAAAGGGAGTAAGGCATGTCGAGGCTTTGGCTATG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct   75  TCAGGTGGGGCCGGTGAAGCAGTGCTTCGTGGTGACTGA-----------------------------------  113

Query  149  TCACTTTTTCAATGCTGGAAGATGTTCAGAGGGCCCTCAAGGAGATTACCACCTTTGAAGGTTGCAAGATCAAC  222
                                                                                      
Sbjct  114  --------------------------------------------------------------------------  113

Query  223  GTGACTGTTGCCAAGAAAAAACTGAGGAACAAGACAAAGGAAAAGGGGAAAAATGAAAACTCAGAGTGCCCAAA  296
                                                                                      
Sbjct  114  --------------------------------------------------------------------------  113

Query  297  GAAGGAGCCGAAGGCTAAAAAAGCCAAAGTGGCAGATAAGAAAGCCAGATTAATTATTCGGAACCTGAGCTTTA  370
                                                                                      
Sbjct  114  --------------------------------------------------------------------------  113

Query  371  AGTGTTCAGAAGATGACTTGAAGACAGTATTTGCTCAATTTGGAGCTGTCCTGGAAGTAAATATCCCTAGGAAA  444
                                                                                      
Sbjct  114  --------------------------------------------------------------------------  113

Query  445  CCAGATGGGAAGATGCGCGGTTTTGGTTTTGTTCAGTTCAAAAACCTCCTAGAAGCAGGTAAAGCTCTCAAAGG  518
                                                                                      
Sbjct  114  --------------------------------------------------------------------------  113

Query  519  CATGAACATGAAAGAGATAAAAGGCCGGACAGTGGCTGTGGATTGGGCCGTGGCAAAGGATAAATATAAAGATA  592
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  114  ------------------AAAAGGCCGGACAGTGGCTGTGGATTGGGCCGTGGCAAAGGATAAATATAAAGATA  169

Query  593  CACAGTCTGTTTCTGCTATAGGTGAGGAAAAGAGCCATGAATCTAAACATCAGGAATCAGTTAAAAAGAAGGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  170  CACAGTCTGTTTCTGCTATAGGTGAGGAAAAGAGCCATGAATCTAAACATCAGGAATCAGTTAAAAAGAAGGGC  243

Query  667  AGAGAGGAAGAGGATATGGAAGAGGAAGAAAACGATGATGATGACGATGATGATGATGAAGAAGATGGGGTTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  244  AGAGAGGAAGAGGATATGGAAGAGGAAGAAAACGATGATGATGACGATGATGATGATGAAGAAGATGGGGTTTT  317

Query  741  TGATGATGAAGATGAAGAGGAAGAGAATATAGAATCAAAGGTGACCAAGCCTGTGCAAATTCAGAAGAGAGCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  318  TGATGATGAAGATGAAGAGGAAGAGAATATAGAATCAAAGGTGACCAAGCCTGTGCAAATTCAGAAGAGAGCAG  391

Query  815  TCAAGAGACCAGCCCCTGCAAAAAGCAGTGATCATTCTGAGGAGGACAGTGACCTAGAGGAAAGCGATAGTATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  392  TCAAGAGACCAGCCCCTGCAAAAAGCAGTGATCATTCTGAGGAGGACAGTGACCTAGAGGAAAGCGATAGTATT  465

Query  889  GATGATGGAGAGGAACTGGCTCAGAGTGATACCAGCACTGAGGAGCAAGAGGATAAAGCTGTGCAAGTCTCAAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  466  GATGATGGAGAGGAACTGGCTCAGAGTGATACCAGCACTGAGGAGCAAGAGGATAAAGCTGTGCAAGTCTCAAA  539

Query  963  CAAAAAGAAGAGGAAATTACCCTCTGATGTGAATGAAGGGAAAACTGTTTTTATCAGAAATCTGTCCTTTGACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540  CAAAAAGAAGAGGAAATTACCCTCTGATGTGAATGAAGGGAAAACTGTTTTTATCAGAAATCTGTCCTTTGACT  613

Query 1037  CAGAAGAAGAAGAACTTGGGGAGCTTCTCCAACAGTTTGGAGAACTCAAATATGTCCGCATTGTCTTGCATCCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  614  CAGAAGAAGAAGAACTTGGGGAGCTTCTCCAACAGTTTGGAGAACTCAAATATGTCCGCATTGTCTTGCATCCA  687

Query 1111  GACACAGAGCATTCTAAAGGTTGTGCATTTGCCCAGTTCATGACTCAAGAAGCAGCTCAGAAATGCCTTCTAGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  688  GACACAGAGCATTCTAAAGGTTGTGCATTTGCCCAGTTCATGACTCAAGAAGCAGCTCAGAAATGCCTTCTAGC  761

Query 1185  TGCTTCTCCAGAGAATGAGGCTGGTGGGCTTAAACTGGATGGCCGGCAGCTCAAGGTTGACTTGGCGGTGACCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  762  TGCTTCTCCAGAGAATGAGGCTGGTGGGCTTAAACTGGATGGCCGGCAGCTCAAGGTTGACTTGGCGGTGACCC  835

Query 1259  GTGATGAGGCTGCAAAGCTTCAGACGACGAAGGTGAAGAAGCCGACTGGCACCCGGAATCTCTATCTGGCCCGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  836  GTGATGAGGCTGCAAAGCTTCAGACGACGAAGGTGAAGAAGCCGACTGGCACCCGGAATCTCTATCTGGCCCGA  909

Query 1333  GAAGGCTTGATTCGTGCTGGGACGAAGGCTGCAGAGGGTGTGAGTGCTGCTGATATGGCCAAAAGAGAACGGTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  910  GAAGGCTTGATTCGTGCTGGGACGAAGGCTGCAGAGGGTGTGAGTGCTGCTGATATGGCCAAAAGAGAACGGTT  983

Query 1407  TGAGCTGCTGAAGCATCAGAAACTCAAGGACCAGAATATCTTTGTCTCCCGAACCAGGCTCTGCCTGCACAATC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  984  TGAGCTGCTGAAGCATCAGAAACTCAAGGACCAGAATATCTTTGTCTCCCGAACCAGGCTCTGCCTGCACAATC  1057

Query 1481  TCCCAAAGGCTGTAGATGACAAACAGCTCAGAAAGCTGCTGCTGAGTGCTACTAGTGGAGAGAAAGGGGTGCGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058  TCCCAAAGGCTGTAGATGACAAACAGCTCAGAAAGCTGCTGCTGAGTGCTACTAGTGGAGAGAAAGGGGTGCGC  1131

Query 1555  ATCAAGGAGTGTAGAGTGATGCGAGACCTCAAAGGAGTTCATGGGAACATGAAGGGTCAGTCCCTGGGCTACGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1132  ATCAAGGAGTGTAGAGTGATGCGAGACCTCAAAGGAGTTCATGGGAACATGAAGGGTCAGTCCCTGGGCTACGC  1205

Query 1629  CTTTGCGGAGTTCCAAGAGCACGAGCATGCCCTGAAAGCCCTCCGCCTCATCAACAACAATCCAGAAATCTTTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1206  CTTTGCGGAGTTCCAAGAGCACGAGCATGCCCTGAAAGCCCTCCGCCTCATCAACAACAATCCAGAAATCTTTG  1279

Query 1703  GGCCTCTGAAGAGACCAATAGTGGAGTTCTCTTTAGAAGATCGAAGAAAACTTAAAATGAAGGAATTAAGGATC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1280  GGCCTCTGAAGAGACCAATAGTGGAGTTCTCTTTAGAAGATCGAAGAAAACTTAAAATGAAGGAATTAAGGATC  1353

Query 1777  CAGCGCAGCTTGCAAAAAATGAGATCCAAGCCTGCAACTGGTGAGCCTCAGAAGGGGCAACCAGAGCCTGCAAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1354  CAGCGCAGCTTGCAAAAAATGAGATCCAAGCCTGCAACTGGTGAGCCTCAGAAGGGGCAACCAGAGCCTGCAAA  1427

Query 1851  AGACCAGCAACAGAAGGCAGCTCAACACCACACAGAGGAACAAAGCAAGGTGCCCCCAGAGCAGAAGAGAAAGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1428  AGACCAGCAACAGAAGGCAGCTCAACACCACACAGAGGAACAAAGCAAGGTGCCCCCAGAGCAGAAGAGAAAGG  1501

Query 1925  CGGGCTCTACCTCATGGACCGGGTTCCAGACCAAGGCTGAAGTGGAGCAGGTGGAGCTGCCTGATGGAAAGAAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1502  CGGGCTCTACCTCATGGACCGGGTTCCAGACCAAGGCTGAAGTGGAGCAGGTGGAGCTGCCTGATGGAAAGAAG  1575

Query 1999  AGAAGAAAGGTCCTGGCGCTCCCCTCACACCGAGGCCCCAAAATCAGGTTGCGGGACAAAGGCAAAGTGAAGCC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1576  AGAAGAAAGGTCCTGGCGCTCCCCTCACACCGAGGCCCCAAAATCAGGTTGCGGGACAAAGGCAAAGTGAAGCC  1649

Query 2073  CGTCCATCCCAAAAAGCCAAAGCCACAGATAAACCAGTGGAAGCAGGAGAAGCAGCAATTATCGTCCGAGCAGG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1650  CGTCCATCCCAAAAAGCCAAAGCCACAGATAAACCAGTGGAAGCAGGAGAAGCAGCAATTATCGTCCGAGCAGG  1723

Query 2147  TATCTAGGAAAAAAGCTAAGGGAAATAAGACGGAAACCCGCTTCAACCAGCTGGTCGAACAATATAAGCAGAAA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1724  TATCTAGGAAAAAAGCTAAGGGAAATAAGACGGAAACCCGCTTCAACCAGCTGGTCGAACAATATAAGCAGAAA  1797

Query 2221  TTATTGGGACCTTCTAAAGGAGCACCTCTTGCAAAGAGGAGCAAATGGTTTGATAGT  2277
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1798  TTATTGGGACCTTCTAAAGGAGCACCTCTTGCAAAGAGGAGCAAATGGTTTGATAGT  1854