Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470138
- Subject:
- XM_017012390.1
- Aligned Length:
- 2277
- Identities:
- 2052
- Gaps:
- 225
Alignment
Query 1 ATGGCCGGCCTGACCTTATTTGTGGGCCGCCTCCCGCCCTCGGCCCGCAGTGAGCAGCTGGAGGAACTGTTCAG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCGGCCTGACCTTATTTGTGGGCCGCCTCCCGCCCTCGGCCCGCAGTGAGCAGCTGGAGGAACTGTTCAG 74
Query 75 TCAGGTGGGGCCGGTGAAGCAGTGCTTCGTGGTGACTGAAAAAGGGAGTAAGGCATGTCGAGGCTTTGGCTATG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAGGTGGGGCCGGTGAAGCAGTGCTTCGTGGTGACTGAAAAAGGGAGTAAGGCATGTCGAGGCTTTGGCTATG 148
Query 149 TCACTTTTTCAATGCTGGAAGATGTTCAGAGGGCCCTCAAGGAGATTACCACCTTTGAAGGTTGCAAGATCAAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCACTTTTTCAATGCTGGAAGATGTTCAGAGGGCCCTCAAGGAGATTACCACCTTTGAAGGTTGCAAGATCAAC 222
Query 223 GTGACTGTTGCCAAGAAAAAACTGAGGAACAAGACAAAGGAAAAGGGGAAAAATGAAAACTCAGAGTGCCCAAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGACTGTTGCCAAGAAAAAACTGAGGAACAAGACAAAGGAAAAGGGGAAAAATGAAAACTCAGAGTGCCCAAA 296
Query 297 GAAGGAGCCGAAGGCTAAAAAAGCCAAAGTGGCAGATAAGAAAGCCAGATTAATTATTCGGAACCTGAGCTTTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAAGGAGCCGAAGGCTAAAAAAGCCAAAGTGGCAGATAAGAAAGCCAGATTAATTATTCGGAACCTGAGCTTTA 370
Query 371 AGTGTTCAGAAGATGACTTGAAGACAGTATTTGCTCAATTTGGAGCTGTCCTGGAAGTAAATATCCCTAGGAAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGTGTTCAGAAGATGACTTGAAGACAGTATTTGCTCAATTTGGAGCTGTCCTGGAAGTAAATATCCCTAGGAAA 444
Query 445 CCAGATGGGAAGATGCGCGGTTTTGGTTTTGTTCAGTTCAAAAACCTCCTAGAAGCAGGTAAAGCTCTCAAAGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCAGATGGGAAGATGCGCGGTTTTGGTTTTGTTCAGTTCAAAAACCTCCTAGAAGCAGGTAAAGCTCTCAAAGG 518
Query 519 CATGAACATGAAAGAGATAAAAGGCCGGACAGTGGCTGTGGATTGGGCCGTGGCAAAGGATAAATATAAAGATA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CATGAACATGAAAGAGATAAAAGGCCGGACAGTGGCTGTGGATTGGGCCGTGGCAAAGGATAAATATAAAGATA 592
Query 593 CACAGTCTGTTTCTGCTATAGGTGAGGAAAAGAGCCATGAATCTAAACATCAGGAATCAGTTAAAAAGAAGGGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CACAGTCTGTTTCTGCTATAGGTGAGGAAAAGAGCCATGAATCTAAACATCAGGAATCAGTTAAAAAGAAGGGC 666
Query 667 AGAGAGGAAGAGGATATGGAAGAGGAAGAAAACGATGATGATGACGATGATGATGATGAAGAAGATGGGGTTTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGAGAGGAAGAGGATATGGAAGAGGAAGAAAACGATGATGATGACGATGATGATGATGAAGAAGATGGGGTTTT 740
Query 741 TGATGATGAAGATGAAGAGGAAGAGAATATAGAATCAAAGGTGACCAAGCCTGTGCAAATTCAGAAGAGAGCAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGATGATGAAGATGAAGAGGAAGAGAATATAGAATCAAAGGTGACCAAGCCTGTGCAAATTCAGAAGAGAGCAG 814
Query 815 TCAAGAGACCAGCCCCTGCAAAAAGCAGTGATCATTCTGAGGAGGACAGTGACCTAGAGGAAAGCGATAGTATT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCAAGAGACCAGCCCCTGCAAAAAGCAGTGATCATTCTGAGGAGGACAGTGACCTAGAGGAAAGCGATAGTATT 888
Query 889 GATGATGGAGAGGAACTGGCTCAGAGTGATACCAGCACTGAGGAGCAAGAGGATAAAGCTGTGCAAGTCTCAAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GATGATGGAGAGGAACTGGCTCAGAGTGATACCAGCACTGAGGAGCAAGAGGATAAAGCTGTGCAAGTCTCAAA 962
Query 963 CAAAAAGAAGAGGAAATTACCCTCTGATGTGAATGAAGGGAAAACTGTTTTTATCAGAAATCTGTCCTTTGACT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAAAAAGAAGAGGAAATTACCCTCTGATGTGAATGAAGGGAAAACTGTTTTTATCAGAAATCTGTCCTTTGACT 1036
Query 1037 CAGAAGAAGAAGAACTTGGGGAGCTTCTCCAACAGTTTGGAGAACTCAAATATGTCCGCATTGTCTTGCATCCA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGAAGAAGAAGAACTTGGGGAGCTTCTCCAACAGTTTGGAGAACTCAAATATGTCCGCATTGTCTTGCATCCA 1110
Query 1111 GACACAGAGCATTCTAAAGGTTGTGCATTTGCCCAGTTCATGACTCAAGAAGCAGCTCAGAAATGCCTTCTAGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GACACAGAGCATTCTAAAGGTTGTGCATTTGCCCAGTTCATGACTCAAGAAGCAGCTCAGAAATGCCTTCTAGC 1184
Query 1185 TGCTTCTCCAGAGAATGAGGCTGGTGGGCTTAAACTGGATGGCCGGCAGCTCAAGGTTGACTTGGCGGTGACCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGCTTCTCCAGAGAATGAGGCTGGTGGGCTTAAACTGGATGGCCGGCAGCTCAAGGTTGACTTGGCGGTGACCC 1258
Query 1259 GTGATGAGGCTGCAAAGCTTCAGACGACGAAGGTGAAGAAGCCGACTGGCACCCGGAATCTCTATCTGGCCCGA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTGATGAGGCTGCAAAGCTTCAGACGACGAAGGTGAAGAAGCCGACTGGCACCCGGAATCTCTATCTGGCCCGA 1332
Query 1333 GAAGGCTTGATTCGTGCTGGGACGAAGGCTGCAGAGGGTGTGAGTGCTGCTGATATGGCCAAAAGAGAACGGTT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAAGGCTTGATTCGTGCTGGGACGAAGGCTGCAGAGGGTGTGAGTGCTGCTGATATGGCCAAAAGAGAACGGTT 1406
Query 1407 TGAGCTGCTGAAGCATCAGAAACTCAAGGACCAGAATATCTTTGTCTCCCGAACCAGGCTCTGCCTGCACAATC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGAGCTGCTGAAGCATCAGAAACTCAAGGACCAGAATATCTTTGTCTCCCGAACCAGGCTCTGCCTGCACAATC 1480
Query 1481 TCCCAAAGGCTGTAGATGACAAACAGCTCAGAAAGCTGCTGCTGAGTGCTACTAGTGGAGAGAAAGGGGTGCGC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCCCAAAGGCTGTAGATGACAAACAGCTCAGAAAGCTGCTGCTGAGTGCTACTAGTGGAGAGAAAGGGGTGCGC 1554
Query 1555 ATCAAGGAGTGTAGAGTGATGCGAGACCTCAAAGGAGTTCATGGGAACATGAAGGGTCAGTCCCTGGGCTACGC 1628
||||||||
Sbjct 1555 ATCAAGGA------------------------------------------------------------------ 1562
Query 1629 CTTTGCGGAGTTCCAAGAGCACGAGCATGCCCTGAAAGCCCTCCGCCTCATCAACAACAATCCAGAAATCTTTG 1702
Sbjct 1563 -------------------------------------------------------------------------- 1562
Query 1703 GGCCTCTGAAGAGACCAATAGTGGAGTTCTCTTTAGAAGATCGAAGAAAACTTAAAATGAAGGAATTAAGGATC 1776
Sbjct 1563 -------------------------------------------------------------------------- 1562
Query 1777 CAGCGCAGCTTGCAAAAAATGAGATCCAAGCCTGCAACTGGTGAGCCTCAGAAGGGGCAACCAGAGCCTGCAAA 1850
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1563 -----------GCAAAAAATGAGATCCAAGCCTGCAACTGGTGAGCCTCAGAAGGGGCAACCAGAGCCTGCAAA 1625
Query 1851 AGACCAGCAACAGAAGGCAGCTCAACACCACACAGAGGAACAAAGCAAGGTGCCCCCAGAGCAGAAGAGAAAGG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 AGACCAGCAACAGAAGGCAGCTCAACACCACACAGAGGAACAAAGCAAGGTGCCCCCAGAGCAGAAGAGAAAGG 1699
Query 1925 CGGGCTCTACCTCATGGACCGGGTTCCAGACCAAGGCTGAAGTGGAGCAGGTGGAGCTGCCTGATGGAAAGAAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700 CGGGCTCTACCTCATGGACCGGGTTCCAGACCAAGGCTGAAGTGGAGCAGGTGGAGCTGCCTGATGGAAAGAAG 1773
Query 1999 AGAAGAAAGGTCCTGGCGCTCCCCTCACACCGAGGCCCCAAAATCAGGTTGCGGGACAAAGGCAAAGTGAAGCC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 AGAAGAAAGGTCCTGGCGCTCCCCTCACACCGAGGCCCCAAAATCAGGTTGCGGGACAAAGGCAAAGTGAAGCC 1847
Query 2073 CGTCCATCCCAAAAAGCCAAAGCCACAGATAAACCAGTGGAAGCAGGAGAAGCAGCAATTATCGTCCGAGCAGG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 CGTCCATCCCAAAAAGCCAAAGCCACAGATAAACCAGTGGAAGCAGGAGAAGCAGCAATTATCGTCCGAGCAGG 1921
Query 2147 TATCTAGGAAAAAAGCTAAGGGAAATAAGACGGAAACCCGCTTCAACCAGCTGGTCGAACAATATAAGCAGAAA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 TATCTAGGAAAAAAGCTAAGGGAAATAAGACGGAAACCCGCTTCAACCAGCTGGTCGAACAATATAAGCAGAAA 1995
Query 2221 TTATTGGGACCTTCTAAAGGAGCACCTCTTGCAAAGAGGAGCAAATGGTTTGATAGT 2277
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 TTATTGGGACCTTCTAAAGGAGCACCTCTTGCAAAGAGGAGCAAATGGTTTGATAGT 2052