Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470159
- Subject:
- NM_001007154.3
- Aligned Length:
- 1682
- Identities:
- 1348
- Gaps:
- 133
Alignment
Query 1 ATGGCCGCGTCGGAGGACGGGAGCGGCTGCCTCGTGTCGCGGGGCCGCTCGCAGAGTGACCCCAGCGTCCTCAC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGACTCCTCGGCCACCTCCTCCGCGGACGCCGGGGAGAACCCAGATGAGATGGACCAAACGCCCCCGGCGCGTC 148
|||||||||||.|||||.||.||..
Sbjct 1 -------------------------------------------------ATGGACCAAACTCCCCCAGCACGCT 25
Query 149 CTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAGCAAACTGGCCACCCTGGGCAGGATC 222
|.||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 26 CAGAGCCTCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAGCAAGCTGGCCACCCTGGGCAGGATC 99
Query 223 TTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAAAAACTGAAGCAGACAACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGAT 296
||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 100 TTCAAACCTTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAGAAACTGAAGCAGACGACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGAT 173
Query 297 GGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCAAGAAGGGGCTGCTGGAGATGATGGAGCAGGATGCTGAAAGCA 370
|||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||.||||||..|
Sbjct 174 GGCTGGCAGGCAAGGCCGGGAGGAACTCATCAAGCAGGGACTGCTGGAGATGATGGAGCAAGATTCTGAAAATA 247
Query 371 AAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCTGTACAGAGTGAACCACCCACTCCCAAGTCGGAGACGCTGACT 444
|..|.||||..|||.|.|.|||..|||.|.||||.||||||||.||.|||.||..|.||..||||||||||||.
Sbjct 248 AGGCATGCAGTCCCAAGGAAGGCTCCCAACCTGTGCAGAGTGAGCCGCCCGCTGGCGAGCAGGAGACGCTGACC 321
Query 445 TCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGCCACTGGGACGGACCAGGTCTCCCTGGACAAGCCACTGTCCTC 518
||.||.|..|||||||||||||||||||.|||||.|||.||.||.|||||.||||.|||..|||..||||||||
Sbjct 322 TCGGAGGGCGCCCAGCCCGGAAGCCCCTCGGCCAGTGGAACAGATCAGGTGTCCCAGGATGAGCTTCTGTCCTC 395
Query 519 AGCTGCCCACTTGGACGATGCAGCCAAGATGCCTTCTGCATCCAGTGGTGAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCC 592
.|.|||.||..||||.|||.|||||||.||.||.||||||||||.||..|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 CGATGCTCATCTGGATGATACAGCCAATATACCGTCTGCATCCACTGCGGAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCC 469
Query 593 TGCCCACCACCAATGAGCTCTCCCAAGCCTTAGCTGGGGCTGACTCCCTGGACAGTCCTCCCAGACCTCTGGAG 666
||||||||||..||||||.|||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.||||||
Sbjct 470 TGCCCACCACTGATGAGCCCTCTCAAGCCTTAGCTGGGTCTGACTCCCTGGACAGTCCTCCCAGATCCCTGGAG 543
Query 667 AGATCCGTGGGCCAGCTCCCCAGCCCCCCACTGCTGCCCACTCCGCCACCCAAGGCAAGCTCCAAAACCACAAA 740
|||||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|||||||
Sbjct 544 AGATCTGTGAGCCAGCTCCCCAGCCCTCCACTGCTGCCCACCCCGCCACCCAAGGCCAGCTCTAAAGCCACAAA 617
Query 741 AAATGTCACAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAGCCTCCAGCATGAAGA-----GTGCCGACCCTTCCCTCCGGGG 809
||||||||||||.|||||..|.||||||||||.|.|||||||||||| |.|||| .|.|||.|.||
Sbjct 618 AAATGTCACAGGACAAGCTGCGCTCTTCCAAGGCCCCAGCATGAAGAACAATGAGCCG-----GCTCTCAGAGG 686
Query 810 CCAGCTCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATCTCACCACGGTCCACCGGCCTCTTCCCCCAAGCCGCGTCATTG 883
.|||||..||||.|||||.|||||.||.|||.|||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 687 ACAGCTTGCCACCCCCACAGGGTCCCCTCATGTCACCACTGTCCACCGGCCACTGCCCCCCAGCCGCGTGATGG 760
Query 884 AGGAGCTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCACCGCCAGGACAGTTTTCAAGGAAGAGAAAGTAAAGGGTCTCCA 957
||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||..|.|||.|.|.||||||||||
Sbjct 761 AGGAGCTGCATAGGGCACTGGCTACAAAGCACCGTCAGGACAGTTTTCAAGGGCGGGAATGCAGAGGGTCTCCA 834
Query 958 AAGAAGCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAACGTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAGGAGAGGGAGGAGGCTTGGAG 1031
|||||||||.|||||||.||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 835 AAGAAGCGGATGGATGTGCGTCTGTCTAGGACGTCCAGCATGGAGCGGGGCAAGGAGAGGGACGAGGCGTGGAG 908
Query 1032 CTTTGACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTGCCGCTAAGGAATCTGAGGAGAACAAGGAGAACCTGATCATAA 1105
||||||||||||.|..|||||||||.|.||.||..|.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|
Sbjct 909 CTTTGACGGGGCCTCAGAGAACAAGTGGACGGCTACCAAAGACTCCGAGGAGAACAAGGAGAATCTGATGCTGA 982
Query 1106 ATTCTGAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTGAACGACTCCATTATTTCTGGAACA 1179
..||.||.|||||.||.|||.||||..||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 983 GCTCCGAGCTCAAGGATGACATGCTCCTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTCAATGACTCCATCATCTCGGGAACT 1056
Query 1180 CTGCCACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGCCGTGAAGCTAAGGAACCGGCCAAGCAAACAGGAACTAGAAGA 1253
.||||..|||||||||||||||||.|.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1057 TTGCCGAGGAAATGCAAGAAGGAGTTGCTGGCAGTGAAGCTGAGGAACCGGCCGAGCAAGCAGGAGCTAGAGGA 1130
Query 1254 CCGGAACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAGAAAGACAGGAGATCCGGCAGCAGATCGAGATGAAGCTTTCCA 1327
|||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1131 CCGGAACATCTTCCCCAGGAGGACCGATGAGGAGAGACAGGAGATCCGACAGCAGATAGAGATGAAGCTGTCCA 1204
Query 1328 AACGGCTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAGCTGGAGAGAAGAAATATCTTGAAACAAAGGAATGATCAGACA 1401
||.||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1205 AAAGGCTGAGCCAGAGACCCGCCGTGGAGGAACTGGAGAGAAGAAATATCCTGAAACAAAGGAATGATCAGACA 1278
Query 1402 GAGCAGGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAGATTGACAAGAAAGCTTAATCAGAGACCCACTGTTGATGAATT 1475
||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1279 GAGCAGGAAGAAAGGAGAGAAATCAAGCAAAGATTAACAAGAAAGCTTAACCAGAGACCCACTGTTGATGAATT 1352
Query 1476 AAGAGACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTGATTACGTGGAAGTAGCAAAAGCGCAGGACTATGACAGGAGGG 1549
.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1353 GAGAGACAGAAAAATTCTGATCCGTTTCAGTGATTATGTGGAAGTAGCAAGAGCACAGGACTATGACAGGAGGG 1426
Query 1550 CAGACAAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTAAATGAGTACAAAAGT 1623
|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1427 CAGACAAGCCCTGGACAAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTAAATGAATATAAAAGT 1500
Query 1624 AATGAAATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA 1677
||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 AACGAAATGGAGGTACACGCATCCAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA 1554