Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470159
- Subject:
- NM_001177791.1
- Aligned Length:
- 1724
- Identities:
- 1416
- Gaps:
- 94
Alignment
Query 1 ATG------GCC--------GC---GTC------------GGAGGACGGGAGCGGCTGCCTC-GTGTCGCGGGG 44
||| ||| || ||| |||.||.|..||...||||..| ||| |||
Sbjct 1 ATGCAAACAGCCAACCAGATGCTAAGTCTGAACTTCAGAAGGATGAAGTCAGGCACTGCAGCAGTG-CGC---- 69
Query 45 CCGCTCGCAGAGTGACCCCAGCGTCCTCACCGACTCCTCGGCCACCTCCTCCGCGGACGCCG-GGGAGAACCCA 117
.|||.||| ||.||| |||| ||||||.||| | ||| ||||
Sbjct 70 ACGCGCGC------ACGCCA-----------------TCGG------CCTCCGGGGA----GTGGG----CCCA 106
Query 118 -----------GATGAGATGGACCAAACGCCCCCGGCGCGTCCTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCC 180
|||||||||||||||||.|||||.||.||..|.||...|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 107 GCCGCTGTGGTGATGAGATGGACCAAACTCCCCCAGCACGCTCAGAGCCTCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCC 180
Query 181 CCTGTGAGGAGGAACAGCAAACTGGCCACCCTGGGCAGGATCTTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAA 254
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CCTGTGAGGAGGAACAGCAAGCTGGCCACCCTGGGCAGGATCTTCAAACCTTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAA 254
Query 255 CGAAAAACTGAAGCAGACAACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGATGGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCA 328
|||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 255 CGAGAAACTGAAGCAGACGACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGATGGCTGGCAGGCAAGGCCGGGAGGAACTCATCA 328
Query 329 AGAAGGGGCTGCTGGAGATGATGGAGCAGGATGCTGAAAGCAAAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCT 402
||.||||.||||||||||||||||||||.|||.||||||..||..|.||||..|||.|.|.|||..|||.|.||
Sbjct 329 AGCAGGGACTGCTGGAGATGATGGAGCAAGATTCTGAAAATAAGGCATGCAGTCCCAAGGAAGGCTCCCAACCT 402
Query 403 GTACAGAGTGAACCACCCACTCCCAAGTCGGAGACGCTGACTTCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGC 476
||.||||||||.||.|||.||..|.||..||||||||||||.||.||.|..|||||||||||||||||||.|||
Sbjct 403 GTGCAGAGTGAGCCGCCCGCTGGCGAGCAGGAGACGCTGACCTCGGAGGGCGCCCAGCCCGGAAGCCCCTCGGC 476
Query 477 CACTGGGACGGACCAGGTCTCCCTGGACAAGCCACTGTCCTCAGCTGCCCACTTGGACGATGCAGCCAAGATGC 550
||.|||.||.||.|||||.||||.|||..|||..||||||||.|.|||.||..||||.|||.|||||||.||.|
Sbjct 477 CAGTGGAACAGATCAGGTGTCCCAGGATGAGCTTCTGTCCTCCGATGCTCATCTGGATGATACAGCCAATATAC 550
Query 551 CTTCTGCATCCAGTGGTGAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCCTGCCCACCACCAATGAGCTCTCCCAAGCCTTA 624
|.||||||||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||.|||.|||||||||
Sbjct 551 CGTCTGCATCCACTGCGGAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCCTGCCCACCACTGATGAGCCCTCTCAAGCCTTA 624
Query 625 GCTGGGGCTGACTCCCTGGACAGTCCTCCCAGACCTCTGGAGAGATCCGTGGGCCAGCTCCCCAGCCCCCCACT 698
||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct 625 GCTGGGTCTGACTCCCTGGACAGTCCTCCCAGATCCCTGGAGAGATCTGTGAGCCAGCTCCCCAGCCCTCCACT 698
Query 699 GCTGCCCACTCCGCCACCCAAGGCAAGCTCCAAAACCACAAAAAATGTCACAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAG 772
|||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||..|.||||||||||
Sbjct 699 GCTGCCCACCCCGCCACCCAAGGCCAGCTCTAAAGCCACAAAAAATGTCACAGGACAAGCTGCGCTCTTCCAAG 772
Query 773 CCTCCAGCATGAAGA-----GTGCCGACCCTTCCCTCCGGGGCCAGCTCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATC 841
.|.|||||||||||| |.|||| .|.|||.|.||.|||||..||||.|||||.|||||.||.|||.
Sbjct 773 GCCCCAGCATGAAGAACAATGAGCCG-----GCTCTCAGAGGACAGCTTGCCACCCCCACAGGGTCCCCTCATG 841
Query 842 TCACCACGGTCCACCGGCCTCTTCCCCCAAGCCGCGTCATTGAGGAGCTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCAC 915
|||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||
Sbjct 842 TCACCACTGTCCACCGGCCACTGCCCCCCAGCCGCGTGATGGAGGAGCTGCATAGGGCACTGGCTACAAAGCAC 915
Query 916 CGCCAGGACAGTTTTCAAGGAAGAGAAAGTAAAGGGTCTCCAAAGAAGCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAAC 989
||.|||||||||||||||||..|.|||.|.|.|||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||.||
Sbjct 916 CGTCAGGACAGTTTTCAAGGGCGGGAATGCAGAGGGTCTCCAAAGAAGCGGATGGATGTGCGTCTGTCTAGGAC 989
Query 990 GTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAGGAGAGGGAGGAGGCTTGGAGCTTTGACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTG 1063
|||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|..|||||||||.|.||.|
Sbjct 990 GTCCAGCATGGAGCGGGGCAAGGAGAGGGACGAGGCGTGGAGCTTTGACGGGGCCTCAGAGAACAAGTGGACGG 1063
Query 1064 CCGCTAAGGAATCTGAGGAGAACAAGGAGAACCTGATCATAAATTCTGAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTAT 1137
|..|.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|..||.||.|||||.||.|||.||||..|||||
Sbjct 1064 CTACCAAAGACTCCGAGGAGAACAAGGAGAATCTGATGCTGAGCTCCGAGCTCAAGGATGACATGCTCCTGTAT 1137
Query 1138 CAGGACGAGGAGGCGCTGAACGACTCCATTATTTCTGGAACACTGCCACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGC 1211
|||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||..||||..|||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 1138 CAGGACGAGGAGGCGCTCAATGACTCCATCATCTCGGGAACTTTGCCGAGGAAATGCAAGAAGGAGTTGCTGGC 1211
Query 1212 CGTGAAGCTAAGGAACCGGCCAAGCAAACAGGAACTAGAAGACCGGAACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAG 1285
.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1212 AGTGAAGCTGAGGAACCGGCCGAGCAAGCAGGAGCTAGAGGACCGGAACATCTTCCCCAGGAGGACCGATGAGG 1285
Query 1286 AAAGACAGGAGATCCGGCAGCAGATCGAGATGAAGCTTTCCAAACGGCTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAG 1359
|.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct 1286 AGAGACAGGAGATCCGACAGCAGATAGAGATGAAGCTGTCCAAAAGGCTGAGCCAGAGACCCGCCGTGGAGGAA 1359
Query 1360 CTGGAGAGAAGAAATATCTTGAAACAAAGGAATGATCAGACAGAGCAGGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAG 1433
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1360 CTGGAGAGAAGAAATATCCTGAAACAAAGGAATGATCAGACAGAGCAGGAAGAAAGGAGAGAAATCAAGCAAAG 1433
Query 1434 ATTGACAAGAAAGCTTAATCAGAGACCCACTGTTGATGAATTAAGAGACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTG 1507
|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1434 ATTAACAAGAAAGCTTAACCAGAGACCCACTGTTGATGAATTGAGAGACAGAAAAATTCTGATCCGTTTCAGTG 1507
Query 1508 ATTACGTGGAAGTAGCAAAAGCGCAGGACTATGACAGGAGGGCAGACAAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCA 1581
||||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1508 ATTATGTGGAAGTAGCAAGAGCACAGGACTATGACAGGAGGGCAGACAAGCCCTGGACAAGACTGTCAGCAGCA 1581
Query 1582 GATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTAAATGAGTACAAAAGTAATGAAATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCA 1655
||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1582 GATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTAAATGAATATAAAAGTAACGAAATGGAGGTACACGCATCCAGCAAGCA 1655
Query 1656 CTTGACAAGATTCCACAGGCCA 1677
||||||||||||||||||||||
Sbjct 1656 CTTGACAAGATTCCACAGGCCA 1677