Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470159
• Subject: NM_028806.2
• Aligned Length: 1682
• Identities: 1459
• Gaps: 13

Alignment

Query    1  ATGGCCGCGTCGGAGGACGGGAGCGGCTGCCTCGTGTCGCGGGGCCGCTCGCAGAGTGACCCCAGCGTCCTCAC  74
            ||||||||.||.||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.
Sbjct    1  ATGGCCGCATCCGAGGACGGCAGCAGCTGCCTTGTGTCGCGGGGCCGCTCGCAGAGTGACCCCAGCTTCCTCAG  74

Query   75  CGACTCCTCGGCCACCTCCTCCGCGGACGCCGGGGAGAACCCAGATGAGATGGACCAAACGCCCCCGGCGCGTC  148
            |||||||||.||||   |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||..
Sbjct   75  CGACTCCTCAGCCA---CCTCCACGGACGCCGGGGAGAACCCAGATGAGATGGACCAAACTCCCCCAGCACGCT  145

Query  149  CTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAGCAAACTGGCCACCCTGGGCAGGATC  222
            |.||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  146  CAGAGCCTCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAGCAAGCTGGCCACCCTGGGCAGGATC  219

Query  223  TTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAAAAACTGAAGCAGACAACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGAT  296
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  TTCAAACCTTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAGAAACTGAAGCAGACGACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGAT  293

Query  297  GGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCAAGAAGGGGCTGCTGGAGATGATGGAGCAGGATGCTGAAAGCA  370
            |||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||.||||||..|
Sbjct  294  GGCTGGCAGGCAAGGCCGGGAGGAACTCATCAAGCAGGGACTGCTGGAGATGATGGAGCAAGATTCTGAAAATA  367

Query  371  AAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCTGTACAGAGTGAACCACCCACTCCCAAGTCGGAGACGCTGACT  444
            |..|.||||..|||.|.|.|||..|||.|.||||.||||||||.||.|||.||..|.||..||||||||||||.
Sbjct  368  AGGCATGCAGTCCCAAGGAAGGCTCCCAACCTGTGCAGAGTGAGCCGCCCGCTGGCGAGCAGGAGACGCTGACC  441

Query  445  TCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGCCACTGGGACGGACCAGGTCTCCCTGGACAAGCCACTGTCCTC  518
            ||.||.|..|||||||||||||||||||.|||||.|||.||.||.|||||.||||.|||..|||..||||||||
Sbjct  442  TCGGAGGGCGCCCAGCCCGGAAGCCCCTCGGCCAGTGGAACAGATCAGGTGTCCCAGGATGAGCTTCTGTCCTC  515

Query  519  AGCTGCCCACTTGGACGATGCAGCCAAGATGCCTTCTGCATCCAGTGGTGAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCC  592
            .|.|||.||..||||.|||.|||||||.||.||.||||||||||.||..|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  CGATGCTCATCTGGATGATACAGCCAATATACCGTCTGCATCCACTGCGGAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCC  589

Query  593  TGCCCACCACCAATGAGCTCTCCCAAGCCTTAGCTGGGGCTGACTCCCTGGACAGTCCTCCCAGACCTCTGGAG  666
            ||||||||||..||||||.|||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.||||||
Sbjct  590  TGCCCACCACTGATGAGCCCTCTCAAGCCTTAGCTGGGTCTGACTCCCTGGACAGTCCTCCCAGATCCCTGGAG  663

Query  667  AGATCCGTGGGCCAGCTCCCCAGCCCCCCACTGCTGCCCACTCCGCCACCCAAGGCAAGCTCCAAAACCACAAA  740
            |||||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|||||||
Sbjct  664  AGATCTGTGAGCCAGCTCCCCAGCCCTCCACTGCTGCCCACCCCGCCACCCAAGGCCAGCTCTAAAGCCACAAA  737

Query  741  AAATGTCACAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAGCCTCCAGCATGAAGA-----GTGCCGACCCTTCCCTCCGGGG  809
            ||||||||||||.|||||..|.||||||||||.|.||||||||||||     |.||||     .|.|||.|.||
Sbjct  738  AAATGTCACAGGACAAGCTGCGCTCTTCCAAGGCCCCAGCATGAAGAACAATGAGCCG-----GCTCTCAGAGG  806

Query  810  CCAGCTCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATCTCACCACGGTCCACCGGCCTCTTCCCCCAAGCCGCGTCATTG  883
            .|||||..||||.|||||.|||||.||.|||.|||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct  807  ACAGCTTGCCACCCCCACAGGGTCCCCTCATGTCACCACTGTCCACCGGCCACTGCCCCCCAGCCGCGTGATGG  880

Query  884  AGGAGCTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCACCGCCAGGACAGTTTTCAAGGAAGAGAAAGTAAAGGGTCTCCA  957
            ||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||..|.|||.|.|.||||||||||
Sbjct  881  AGGAGCTGCATAGGGCACTGGCTACAAAGCACCGTCAGGACAGTTTTCAAGGGCGGGAATGCAGAGGGTCTCCA  954

Query  958  AAGAAGCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAACGTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAGGAGAGGGAGGAGGCTTGGAG  1031
            |||||||||.|||||||.||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  955  AAGAAGCGGATGGATGTGCGTCTGTCTAGGACGTCCAGCATGGAGCGGGGCAAGGAGAGGGACGAGGCGTGGAG  1028

Query 1032  CTTTGACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTGCCGCTAAGGAATCTGAGGAGAACAAGGAGAACCTGATCATAA  1105
            ||||||||||||.|..|||||||||.|.||.||..|.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|
Sbjct 1029  CTTTGACGGGGCCTCAGAGAACAAGTGGACGGCTACCAAAGACTCCGAGGAGAACAAGGAGAATCTGATGCTGA  1102

Query 1106  ATTCTGAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTGAACGACTCCATTATTTCTGGAACA  1179
            ..||.||.|||||.||.|||.||||..||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 1103  GCTCCGAGCTCAAGGATGACATGCTCCTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTCAATGACTCCATCATCTCGGGAACT  1176

Query 1180  CTGCCACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGCCGTGAAGCTAAGGAACCGGCCAAGCAAACAGGAACTAGAAGA  1253
            .||||..|||||||||||||||||.|.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1177  TTGCCGAGGAAATGCAAGAAGGAGTTGCTGGCAGTGAAGCTGAGGAACCGGCCGAGCAAGCAGGAGCTAGAGGA  1250

Query 1254  CCGGAACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAGAAAGACAGGAGATCCGGCAGCAGATCGAGATGAAGCTTTCCA  1327
            |||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1251  CCGGAACATCTTCCCCAGGAGGACCGATGAGGAGAGACAGGAGATCCGACAGCAGATAGAGATGAAGCTGTCCA  1324

Query 1328  AACGGCTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAGCTGGAGAGAAGAAATATCTTGAAACAAAGGAATGATCAGACA  1401
            ||.||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325  AAAGGCTGAGCCAGAGACCCGCCGTGGAGGAACTGGAGAGAAGAAATATCCTGAAACAAAGGAATGATCAGACA  1398

Query 1402  GAGCAGGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAGATTGACAAGAAAGCTTAATCAGAGACCCACTGTTGATGAATT  1475
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399  GAGCAGGAAGAAAGGAGAGAAATCAAGCAAAGATTAACAAGAAAGCTTAACCAGAGACCCACTGTTGATGAATT  1472

Query 1476  AAGAGACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTGATTACGTGGAAGTAGCAAAAGCGCAGGACTATGACAGGAGGG  1549
            .||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1473  GAGAGACAGAAAAATTCTGATCCGTTTCAGTGATTATGTGGAAGTAGCAAGAGCACAGGACTATGACAGGAGGG  1546

Query 1550  CAGACAAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTAAATGAGTACAAAAGT  1623
            |||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1547  CAGACAAGCCCTGGACAAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTAAATGAATATAAAAGT  1620

Query 1624  AATGAAATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA  1677
            ||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621  AACGAAATGGAGGTACACGCATCCAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA  1674