Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470159
• Subject: XM_006500730.2
• Aligned Length: 1682
• Identities: 1348
• Gaps: 133

Alignment

Query    1  ATGGCCGCGTCGGAGGACGGGAGCGGCTGCCTCGTGTCGCGGGGCCGCTCGCAGAGTGACCCCAGCGTCCTCAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGACTCCTCGGCCACCTCCTCCGCGGACGCCGGGGAGAACCCAGATGAGATGGACCAAACGCCCCCGGCGCGTC  148
                                                             |||||||||||.|||||.||.||..
Sbjct    1  -------------------------------------------------ATGGACCAAACTCCCCCAGCACGCT  25

Query  149  CTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAGCAAACTGGCCACCCTGGGCAGGATC  222
            |.||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct   26  CAGAGCCTCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAGCAAGCTGGCCACCCTGGGCAGGATC  99

Query  223  TTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAAAAACTGAAGCAGACAACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGAT  296
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  100  TTCAAACCTTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAGAAACTGAAGCAGACGACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGAT  173

Query  297  GGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCAAGAAGGGGCTGCTGGAGATGATGGAGCAGGATGCTGAAAGCA  370
            |||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||.||||||..|
Sbjct  174  GGCTGGCAGGCAAGGCCGGGAGGAACTCATCAAGCAGGGACTGCTGGAGATGATGGAGCAAGATTCTGAAAATA  247

Query  371  AAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCTGTACAGAGTGAACCACCCACTCCCAAGTCGGAGACGCTGACT  444
            |..|.||||..|||.|.|.|||..|||.|.||||.||||||||.||.|||.||..|.||..||||||||||||.
Sbjct  248  AGGCATGCAGTCCCAAGGAAGGCTCCCAACCTGTGCAGAGTGAGCCGCCCGCTGGCGAGCAGGAGACGCTGACC  321

Query  445  TCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGCCACTGGGACGGACCAGGTCTCCCTGGACAAGCCACTGTCCTC  518
            ||.||.|..|||||||||||||||||||.|||||.|||.||.||.|||||.||||.|||..|||..||||||||
Sbjct  322  TCGGAGGGCGCCCAGCCCGGAAGCCCCTCGGCCAGTGGAACAGATCAGGTGTCCCAGGATGAGCTTCTGTCCTC  395

Query  519  AGCTGCCCACTTGGACGATGCAGCCAAGATGCCTTCTGCATCCAGTGGTGAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCC  592
            .|.|||.||..||||.|||.|||||||.||.||.||||||||||.||..|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  396  CGATGCTCATCTGGATGATACAGCCAATATACCGTCTGCATCCACTGCGGAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCC  469

Query  593  TGCCCACCACCAATGAGCTCTCCCAAGCCTTAGCTGGGGCTGACTCCCTGGACAGTCCTCCCAGACCTCTGGAG  666
            ||||||||||..||||||.|||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.||||||
Sbjct  470  TGCCCACCACTGATGAGCCCTCTCAAGCCTTAGCTGGGTCTGACTCCCTGGACAGTCCTCCCAGATCCCTGGAG  543

Query  667  AGATCCGTGGGCCAGCTCCCCAGCCCCCCACTGCTGCCCACTCCGCCACCCAAGGCAAGCTCCAAAACCACAAA  740
            |||||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|||||||
Sbjct  544  AGATCTGTGAGCCAGCTCCCCAGCCCTCCACTGCTGCCCACCCCGCCACCCAAGGCCAGCTCTAAAGCCACAAA  617

Query  741  AAATGTCACAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAGCCTCCAGCATGAAGA-----GTGCCGACCCTTCCCTCCGGGG  809
            ||||||||||||.|||||..|.||||||||||.|.||||||||||||     |.||||     .|.|||.|.||
Sbjct  618  AAATGTCACAGGACAAGCTGCGCTCTTCCAAGGCCCCAGCATGAAGAACAATGAGCCG-----GCTCTCAGAGG  686

Query  810  CCAGCTCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATCTCACCACGGTCCACCGGCCTCTTCCCCCAAGCCGCGTCATTG  883
            .|||||..||||.|||||.|||||.||.|||.|||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct  687  ACAGCTTGCCACCCCCACAGGGTCCCCTCATGTCACCACTGTCCACCGGCCACTGCCCCCCAGCCGCGTGATGG  760

Query  884  AGGAGCTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCACCGCCAGGACAGTTTTCAAGGAAGAGAAAGTAAAGGGTCTCCA  957
            ||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||..|.|||.|.|.||||||||||
Sbjct  761  AGGAGCTGCATAGGGCACTGGCTACAAAGCACCGTCAGGACAGTTTTCAAGGGCGGGAATGCAGAGGGTCTCCA  834

Query  958  AAGAAGCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAACGTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAGGAGAGGGAGGAGGCTTGGAG  1031
            |||||||||.|||||||.||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  835  AAGAAGCGGATGGATGTGCGTCTGTCTAGGACGTCCAGCATGGAGCGGGGCAAGGAGAGGGACGAGGCGTGGAG  908

Query 1032  CTTTGACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTGCCGCTAAGGAATCTGAGGAGAACAAGGAGAACCTGATCATAA  1105
            ||||||||||||.|..|||||||||.|.||.||..|.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|
Sbjct  909  CTTTGACGGGGCCTCAGAGAACAAGTGGACGGCTACCAAAGACTCCGAGGAGAACAAGGAGAATCTGATGCTGA  982

Query 1106  ATTCTGAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTGAACGACTCCATTATTTCTGGAACA  1179
            ..||.||.|||||.||.|||.||||..||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.
Sbjct  983  GCTCCGAGCTCAAGGATGACATGCTCCTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTCAATGACTCCATCATCTCGGGAACT  1056

Query 1180  CTGCCACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGCCGTGAAGCTAAGGAACCGGCCAAGCAAACAGGAACTAGAAGA  1253
            .||||..|||||||||||||||||.|.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1057  TTGCCGAGGAAATGCAAGAAGGAGTTGCTGGCAGTGAAGCTGAGGAACCGGCCGAGCAAGCAGGAGCTAGAGGA  1130

Query 1254  CCGGAACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAGAAAGACAGGAGATCCGGCAGCAGATCGAGATGAAGCTTTCCA  1327
            |||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1131  CCGGAACATCTTCCCCAGGAGGACCGATGAGGAGAGACAGGAGATCCGACAGCAGATAGAGATGAAGCTGTCCA  1204

Query 1328  AACGGCTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAGCTGGAGAGAAGAAATATCTTGAAACAAAGGAATGATCAGACA  1401
            ||.||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1205  AAAGGCTGAGCCAGAGACCCGCCGTGGAGGAACTGGAGAGAAGAAATATCCTGAAACAAAGGAATGATCAGACA  1278

Query 1402  GAGCAGGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAGATTGACAAGAAAGCTTAATCAGAGACCCACTGTTGATGAATT  1475
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1279  GAGCAGGAAGAAAGGAGAGAAATCAAGCAAAGATTAACAAGAAAGCTTAACCAGAGACCCACTGTTGATGAATT  1352

Query 1476  AAGAGACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTGATTACGTGGAAGTAGCAAAAGCGCAGGACTATGACAGGAGGG  1549
            .||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1353  GAGAGACAGAAAAATTCTGATCCGTTTCAGTGATTATGTGGAAGTAGCAAGAGCACAGGACTATGACAGGAGGG  1426

Query 1550  CAGACAAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTAAATGAGTACAAAAGT  1623
            |||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1427  CAGACAAGCCCTGGACAAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTAAATGAATATAAAAGT  1500

Query 1624  AATGAAATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA  1677
            ||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501  AACGAAATGGAGGTACACGCATCCAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA  1554