Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000470159
Subject:
XM_011528526.2
Aligned Length:
1677
Identities:
1467
Gaps:
210

Alignment

Query    1  ATGGCCGCGTCGGAGGACGGGAGCGGCTGCCTCGTGTCGCGGGGCCGCTCGCAGAGTGACCCCAGCGTCCTCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCGCGTCGGAGGACGGGAGCGGCTGCCTCGTGTCGCGGGGCCGCTCGCAGAGTGACCCCAGCGTCCTCAC  74

Query   75  CGACTCCTCGGCCACCTCCTCCGCGGACGCCGGGGAGAACCCAGATGAGATGGACCAAACGCCCCCGGCGCGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGACTCCTCGGCCACCTCCTCCGCGGACGCCGGGGAGAACCCAGATGAGATGGACCAAACGCCCCCGGCGCGTC  148

Query  149  CTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAGCAAACTGGCCACCCTGGGCAGGATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAGCAAACTGGCCACCCTGGGCAGGATC  222

Query  223  TTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAAAAACTGAAGCAGACAACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAAAAACTGAAGCAGACAACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGAT  296

Query  297  GGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCAAGAAGGGGCTGCTGGAGATGATGGAGCAGGATGCTGAAAGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCAAGAAGGGGCTGCTGGAGATGATGGAGCAGGATGCTGAAAGCA  370

Query  371  AAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCTGTACAGAGTGAACCACCCACTCCCAAGTCGGAGACGCTGACT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCTGTACAGAGTGAACCACCCACTCCCAAGTCGGAGACGCTGACT  444

Query  445  TCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGCCACTGGGACGGACCAGGTCTCCCTGGACAAGCCACTGTCCTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGCCACTGGGACGGACCAGGTCTCCCTGGACAAGCCACTGTCCTC  518

Query  519  AGCTGCCCACTTGGACGATGCAGCCAAGATGCCTTCTGCATCCAGTGGTGAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCC  592
            ||||||||||||||||||||                                                      
Sbjct  519  AGCTGCCCACTTGGACGATG------------------------------------------------------  538

Query  593  TGCCCACCACCAATGAGCTCTCCCAAGCCTTAGCTGGGGCTGACTCCCTGGACAGTCCTCCCAGACCTCTGGAG  666
                                                                                      
Sbjct  539  --------------------------------------------------------------------------  538

Query  667  AGATCCGTGGGCCAGCTCCCCAGCCCCCCACTGCTGCCCACTCCGCCACCCAAGGCAAGCTCCAAAACCACAAA  740
                                                                                      
Sbjct  539  --------------------------------------------------------------------------  538

Query  741  AAATGTCACAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAGCCTCCAGCATGAAGAGTGCCGACCCTTCCCTCCGGGGCCAGC  814
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  539  --------CAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAGCCTCCAGCATGAAGAGTGCCGACCCTTCCCTCCGGGGCCAGC  604

Query  815  TCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATCTCACCACGGTCCACCGGCCTCTTCCCCCAAGCCGCGTCATTGAGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  605  TCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATCTCACCACGGTCCACCGGCCTCTTCCCCCAAGCCGCGTCATTGAGGAG  678

Query  889  CTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCACCGCCAGGACAGTTTTCAAGGAAGAGAAAGTAAAGGGTCTCCAAAGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  679  CTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCACCGCCAGGACAGTTTTCAAGGAAGAGAAAGTAAAGGGTCTCCAAAGAA  752

Query  963  GCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAACGTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAGGAGAGGGAGGAGGCTTGGAGCTTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  753  GCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAACGTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAGGAGAGGGAGGAGGCTTGGAGCTTTG  826

Query 1037  ACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTGCCGCTAAGGAATCTGAGGAGAACAAGGAGAACCTGATCATAAATTCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  827  ACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTGCCGCTAAGGAATCTGAGGAGAACAAGGAGAACCTGATCATAAATTCT  900

Query 1111  GAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTGAACGACTCCATTATTTCTGGAACACTGCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  GAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTGAACGACTCCATTATTTCTGGAACACTGCC  974

Query 1185  ACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGCCGTGAAGCTAAGGAACCGGCCAAGCAAACAGGAACTAGAAGACCGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  975  ACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGCCGTGAAGCTAAGGAACCGGCCAAGCAAACAGGAACTAGAAGACCGGA  1048

Query 1259  ACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAGAAAGACAGGAGATCCGGCAGCAGATCGAGATGAAGCTTTCCAAACGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1049  ACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAGAAAGACAGGAGATCCGGCAGCAGATCGAGATGAAGCTTTCCAAACGG  1122

Query 1333  CTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAGCTGGAGAGAAGAAATATCTTGAAACAAAGGAATGATCAGACAGAGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1123  CTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAGCTGGAGAGAAGAAATATCTTGAAACAAAGGAATGATCAGACAGAGCA  1196

Query 1407  GGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAGATTGACAAGAAAGCTTAATCAGAGACCCACTGTTGATGAATTAAGAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1197  GGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAGATTGACAAGAAAGCTTAATCAGAGACCCACTGTTGATGAATTAAGAG  1270

Query 1481  ACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTGATTACGTGGAAGTAGCAAAAGCGCAGGACTATGACAGGAGGGCAGAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1271  ACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTGATTACGTGGAAGTAGCAAAAGCGCAGGACTATGACAGGAGGGCAGAC  1344

Query 1555  AAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTAAATGAGTACAAAAGTAATGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1345  AAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTAAATGAGTACAAAAGTAATGA  1418

Query 1629  AATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA  1677
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Sbjct 1419  AATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA  1467