Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000470159
Subject:
XM_017027626.2
Aligned Length:
1677
Identities:
1554
Gaps:
123

Alignment

Query    1  ATGGCCGCGTCGGAGGACGGGAGCGGCTGCCTCGTGTCGCGGGGCCGCTCGCAGAGTGACCCCAGCGTCCTCAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGACTCCTCGGCCACCTCCTCCGCGGACGCCGGGGAGAACCCAGATGAGATGGACCAAACGCCCCCGGCGCGTC  148
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------ATGGACCAAACGCCCCCGGCGCGTC  25

Query  149  CTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAGCAAACTGGCCACCCTGGGCAGGATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   26  CTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAGCAAACTGGCCACCCTGGGCAGGATC  99

Query  223  TTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAAAAACTGAAGCAGACAACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  100  TTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAAAAACTGAAGCAGACAACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGAT  173

Query  297  GGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCAAGAAGGGGCTGCTGGAGATGATGGAGCAGGATGCTGAAAGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  174  GGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCAAGAAGGGGCTGCTGGAGATGATGGAGCAGGATGCTGAAAGCA  247

Query  371  AAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCTGTACAGAGTGAACCACCCACTCCCAAGTCGGAGACGCTGACT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  248  AAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCTGTACAGAGTGAACCACCCACTCCCAAGTCGGAGACGCTGACT  321

Query  445  TCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGCCACTGGGACGGACCAGGTCTCCCTGGACAAGCCACTGTCCTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  322  TCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGCCACTGGGACGGACCAGGTCTCCCTGGACAAGCCACTGTCCTC  395

Query  519  AGCTGCCCACTTGGACGATGCAGCCAAGATGCCTTCTGCATCCAGTGGTGAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  396  AGCTGCCCACTTGGACGATGCAGCCAAGATGCCTTCTGCATCCAGTGGTGAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCC  469

Query  593  TGCCCACCACCAATGAGCTCTCCCAAGCCTTAGCTGGGGCTGACTCCCTGGACAGTCCTCCCAGACCTCTGGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  470  TGCCCACCACCAATGAGCTCTCCCAAGCCTTAGCTGGGGCTGACTCCCTGGACAGTCCTCCCAGACCTCTGGAG  543

Query  667  AGATCCGTGGGCCAGCTCCCCAGCCCCCCACTGCTGCCCACTCCGCCACCCAAGGCAAGCTCCAAAACCACAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  544  AGATCCGTGGGCCAGCTCCCCAGCCCCCCACTGCTGCCCACTCCGCCACCCAAGGCAAGCTCCAAAACCACAAA  617

Query  741  AAATGTCACAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAGCCTCCAGCATGAAGAGTGCCGACCCTTCCCTCCGGGGCCAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  618  AAATGTCACAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAGCCTCCAGCATGAAGAGTGCCGACCCTTCCCTCCGGGGCCAGC  691

Query  815  TCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATCTCACCACGGTCCACCGGCCTCTTCCCCCAAGCCGCGTCATTGAGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  692  TCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATCTCACCACGGTCCACCGGCCTCTTCCCCCAAGCCGCGTCATTGAGGAG  765

Query  889  CTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCACCGCCAGGACAGTTTTCAAGGAAGAGAAAGTAAAGGGTCTCCAAAGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  766  CTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCACCGCCAGGACAGTTTTCAAGGAAGAGAAAGTAAAGGGTCTCCAAAGAA  839

Query  963  GCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAACGTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAGGAGAGGGAGGAGGCTTGGAGCTTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840  GCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAACGTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAGGAGAGGGAGGAGGCTTGGAGCTTTG  913

Query 1037  ACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTGCCGCTAAGGAATCTGAGGAGAACAAGGAGAACCTGATCATAAATTCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  914  ACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTGCCGCTAAGGAATCTGAGGAGAACAAGGAGAACCTGATCATAAATTCT  987

Query 1111  GAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTGAACGACTCCATTATTTCTGGAACACTGCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  988  GAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTGAACGACTCCATTATTTCTGGAACACTGCC  1061

Query 1185  ACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGCCGTGAAGCTAAGGAACCGGCCAAGCAAACAGGAACTAGAAGACCGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062  ACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGCCGTGAAGCTAAGGAACCGGCCAAGCAAACAGGAACTAGAAGACCGGA  1135

Query 1259  ACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAGAAAGACAGGAGATCCGGCAGCAGATCGAGATGAAGCTTTCCAAACGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136  ACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAGAAAGACAGGAGATCCGGCAGCAGATCGAGATGAAGCTTTCCAAACGG  1209

Query 1333  CTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAGCTGGAGAGAAGAAATATCTTGAAACAAAGGAATGATCAGACAGAGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210  CTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAGCTGGAGAGAAGAAATATCTTGAAACAAAGGAATGATCAGACAGAGCA  1283

Query 1407  GGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAGATTGACAAGAAAGCTTAATCAGAGACCCACTGTTGATGAATTAAGAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284  GGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAGATTGACAAGAAAGCTTAATCAGAGACCCACTGTTGATGAATTAAGAG  1357

Query 1481  ACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTGATTACGTGGAAGTAGCAAAAGCGCAGGACTATGACAGGAGGGCAGAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358  ACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTGATTACGTGGAAGTAGCAAAAGCGCAGGACTATGACAGGAGGGCAGAC  1431

Query 1555  AAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTAAATGAGTACAAAAGTAATGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1432  AAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTAAATGAGTACAAAAGTAATGA  1505

Query 1629  AATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA  1677
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1506  AATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA  1554