Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470164
• Subject: NM_001331078.2
• Aligned Length: 2565
• Identities: 2565
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCATTTGTCAGAGTGAACCGCTGTGGTCCCCGAGTTGGTGTAAGAAAGACACCGAAAGTAAAGAAGAAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCATTTGTCAGAGTGAACCGCTGTGGTCCCCGAGTTGGTGTAAGAAAGACACCGAAAGTAAAGAAGAAGAA  74

Query   75  AACTTCAGTGAAACAAGAATGGGATAATACCGTGACTGATCTAACCGTTCATCGGGCAACTCCCGAAGATCTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AACTTCAGTGAAACAAGAATGGGATAATACCGTGACTGATCTAACCGTTCATCGGGCAACTCCCGAAGATCTGG  148

Query  149  TACGCCGTCATGAAATACACAAATCGAAGAATAGAGCATTAGTACACTGGGAACTCCAAGAAAAAGCTTTGAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TACGCCGTCATGAAATACACAAATCGAAGAATAGAGCATTAGTACACTGGGAACTCCAAGAAAAAGCTTTGAAG  222

Query  223  AGAAAATGGAGGAAGCAGAAACCAGAAACTTTAAATCTTGAGAAAAGAAGATTGTCTATCATGAAGGAGATTCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAAAATGGAGGAAGCAGAAACCAGAAACTTTAAATCTTGAGAAAAGAAGATTGTCTATCATGAAGGAGATTCT  296

Query  297  TTCTGATCAATACCAGATGCAAGATGTGTTGGAGAAATCTGATCATCTAATAGCTGCAGCAAAAGAGCTGTTTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTCTGATCAATACCAGATGCAAGATGTGTTGGAGAAATCTGATCATCTAATAGCTGCAGCAAAAGAGCTGTTTC  370

Query  371  CTCGTAGGCGCACAGGGTTTCCAAATGTAACAGTGGCTCCTGATTCCTCTCAGGGTCCCATTGTGGTAAATCAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCGTAGGCGCACAGGGTTTCCAAATGTAACAGTGGCTCCTGATTCCTCTCAGGGTCCCATTGTGGTAAATCAA  444

Query  445  GACCCTATCACCCAATCTATCTTTAATGAGTCTGTCATAGAACCTCAGGCTCTTAATGATGTAGATGGTGAAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACCCTATCACCCAATCTATCTTTAATGAGTCTGTCATAGAACCTCAGGCTCTTAATGATGTAGATGGTGAAGA  518

Query  519  AGAAGGAACTGTTAATAGCCAGTCAGGAGAAAGTGAGAATGAGAATGAGTTGGATAACTCTCTAAACTCTCAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAAGGAACTGTTAATAGCCAGTCAGGAGAAAGTGAGAATGAGAATGAGTTGGATAACTCTCTAAACTCTCAGT  592

Query  593  CTAACACGAATACAGACAGGTTTCTCCAACAACTAACAGAAGAGAATTTTGAGTTAATTAGTAAGTTGTGGACT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTAACACGAATACAGACAGGTTTCTCCAACAACTAACAGAAGAGAATTTTGAGTTAATTAGTAAGTTGTGGACT  666

Query  667  GACATTCAGCAGAAAATAGCAACCCAGTCACAAATAACTCCTCCAGGAACGCCATCATCTGCTCTTTCATCAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACATTCAGCAGAAAATAGCAACCCAGTCACAAATAACTCCTCCAGGAACGCCATCATCTGCTCTTTCATCAGG  740

Query  741  GGAGCAAAGAGCTGCTCTGAATGCTACCAATGCTGTCAAGAGACTCCAAACCAGGCTTCAGCCTGAAGAATCTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGCAAAGAGCTGCTCTGAATGCTACCAATGCTGTCAAGAGACTCCAAACCAGGCTTCAGCCTGAAGAATCTA  814

Query  815  CTGAGACTCTAGACTCAAGCTACGTTGTGGGACACGTGCTGAACTCAAGGAAGCAAAAACAGCTGTTAAATAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGAGACTCTAGACTCAAGCTACGTTGTGGGACACGTGCTGAACTCAAGGAAGCAAAAACAGCTGTTAAATAAA  888

Query  889  GTGAAAAGGAAACCGAATTTGCATGCTCTTTCCAAGCCGAAGAAAAACATATCATCAGGTAGCACAACCTCTGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGAAAAGGAAACCGAATTTGCATGCTCTTTCCAAGCCGAAGAAAAACATATCATCAGGTAGCACAACCTCTGC  962

Query  963  AGACTTACCAAATAGGACTAATTCCAACCTGGATGTCCTCAAACACATGATACATGAAGTGGAACATGAAATGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGACTTACCAAATAGGACTAATTCCAACCTGGATGTCCTCAAACACATGATACATGAAGTGGAACATGAAATGG  1036

Query 1037  AAGAATATGAGCGGTGGACAGGTCGCGAGGTCAAGGGTCTGCAGAGCAGTCAGGGTCTTACAGGCTTCACTTTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGAATATGAGCGGTGGACAGGTCGCGAGGTCAAGGGTCTGCAGAGCAGTCAGGGTCTTACAGGCTTCACTTTG  1110

Query 1111  TCGCTGGTGAGCTCCCTCTGTCGCCTGGTTCGGTACCTTAAAGAGAGTGAGATCCAGCTACGTAAAGAAGTAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCGCTGGTGAGCTCCCTCTGTCGCCTGGTTCGGTACCTTAAAGAGAGTGAGATCCAGCTACGTAAAGAAGTAGA  1184

Query 1185  GACAAGGCAACAACTGGAACAAGTATTAGGTGATCATCGAGAGCTCATTGATGCTCTGACAGCTGAAATTCTTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GACAAGGCAACAACTGGAACAAGTATTAGGTGATCATCGAGAGCTCATTGATGCTCTGACAGCTGAAATTCTTC  1258

Query 1259  GTCTTAGAGAAGAAAACGCTGCTACACAGGCAAGACTTCAGCAGTACATGGTCACAACAGATGAGCAACTGATA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTCTTAGAGAAGAAAACGCTGCTACACAGGCAAGACTTCAGCAGTACATGGTCACAACAGATGAGCAACTGATA  1332

Query 1333  TCACTCACACATGCTATTAAGAACTGTCCTGTGATAAATAACAGACAAGAAATTCAGGCATCAGAAAGCGGAGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCACTCACACATGCTATTAAGAACTGTCCTGTGATAAATAACAGACAAGAAATTCAGGCATCAGAAAGCGGAGC  1406

Query 1407  CACAGGTAGAAGAGTTATGGACAGTCCAGAGCGTCCAGTTGTAAATGCCAATGTCTCAGTGCCATTGATGTTCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACAGGTAGAAGAGTTATGGACAGTCCAGAGCGTCCAGTTGTAAATGCCAATGTCTCAGTGCCATTGATGTTCA  1480

Query 1481  GAGAGGAAGTGGCTGAATTCCCACAGGAAGAGTTGCCCGTTAAACTGTCTCAGGTGCCAGACCCTCCAGATAAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GAGAGGAAGTGGCTGAATTCCCACAGGAAGAGTTGCCCGTTAAACTGTCTCAGGTGCCAGACCCTCCAGATAAC  1554

Query 1555  ATGAATCTGGCCAAGAATTTTCCAGCACATATTTTTGAGCCAGCTGTGTTGTTAACACCACCCAGGCAGAAGAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATGAATCTGGCCAAGAATTTTCCAGCACATATTTTTGAGCCAGCTGTGTTGTTAACACCACCCAGGCAGAAGAG  1628

Query 1629  CAACTTAAAATTCTCTCCTCTTCAGGACGTATTGAGAAGGACTGTTCAAACTCGTCCTGCTCCACGACTTCCTC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAACTTAAAATTCTCTCCTCTTCAGGACGTATTGAGAAGGACTGTTCAAACTCGTCCTGCTCCACGACTTCCTC  1702

Query 1703  CAACTGTGGAAATAATTGAGAAGGAACAAAATTGGGAAGAGAAGACCTTACCTATTGATACAGACATTCAGAAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAACTGTGGAAATAATTGAGAAGGAACAAAATTGGGAAGAGAAGACCTTACCTATTGATACAGACATTCAGAAT  1776

Query 1777  TCAAGTGAAGAGAATCGTCTCTTCACTCAGAGATGGAGAGTCTCTCACATGGGAGAAGATTTGGAGAACAAAAC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCAAGTGAAGAGAATCGTCTCTTCACTCAGAGATGGAGAGTCTCTCACATGGGAGAAGATTTGGAGAACAAAAC  1850

Query 1851  TCAGGCTCCTTTTGTTAACCTCTCACAGCCCCTCTGCAATTCCCATTCCAACACTCAACAGTCAAGAAGCCCCA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TCAGGCTCCTTTTGTTAACCTCTCACAGCCCCTCTGCAATTCCCATTCCAACACTCAACAGTCAAGAAGCCCCA  1924

Query 1925  CATTCTCAGAAGAGCTCCCAGTACTGGGAGATGGGCAGCAGCTGAGAACAAATGAGTCATTAATACAAAGAAAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CATTCTCAGAAGAGCTCCCAGTACTGGGAGATGGGCAGCAGCTGAGAACAAATGAGTCATTAATACAAAGAAAG  1998

Query 1999  GACATAATGACACGAATTGCTGATTTGACATTGCAGAATTCAGCTATCAAGGCACATATGAATAATATTATTGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GACATAATGACACGAATTGCTGATTTGACATTGCAGAATTCAGCTATCAAGGCACATATGAATAATATTATTGA  2072

Query 2073  GCCCAGAGGAGAGCAAGGGGATGGACTCCGGGAGTTGAACAAACAAGAAAGTGCAAGTGACATGACTTCTACTT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCCCAGAGGAGAGCAAGGGGATGGACTCCGGGAGTTGAACAAACAAGAAAGTGCAAGTGACATGACTTCTACTT  2146

Query 2147  TTCCAGTAGCACAGTCTCTAACACCAGGTAGTATGGAGGAACGGATTGCAGAATTGAATCGACAAAGTATGGAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TTCCAGTAGCACAGTCTCTAACACCAGGTAGTATGGAGGAACGGATTGCAGAATTGAATCGACAAAGTATGGAG  2220

Query 2221  GCTCGTGGAAAACTACTGCAGTTGATAGAGCAGCAGAAACTTGTTGGTTTGAATCTTTCTCCACCAATGTCACC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GCTCGTGGAAAACTACTGCAGTTGATAGAGCAGCAGAAACTTGTTGGTTTGAATCTTTCTCCACCAATGTCACC  2294

Query 2295  TGTTCAGTTACCTCTCAGAGCATGGACTGAAGGAGCAAAGAGGACAATTGAGGTATCTATTCCAGGAGCAGAAG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGTTCAGTTACCTCTCAGAGCATGGACTGAAGGAGCAAAGAGGACAATTGAGGTATCTATTCCAGGAGCAGAAG  2368

Query 2369  CCCCAGAAAGCTCAAAATGTAGTACTGTCTCTCCCGTCAGCGGGATAAATACAAGAAGATCTTCCGGGGCTACT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CCCCAGAAAGCTCAAAATGTAGTACTGTCTCTCCCGTCAGCGGGATAAATACAAGAAGATCTTCCGGGGCTACT  2442

Query 2443  GGTAATTCTTGTTCTCCACTAAATGCCACCTCAGGAAGTGGGAGATTCACACCTCTTAATCCAAGAGCAAAGAT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GGTAATTCTTGTTCTCCACTAAATGCCACCTCAGGAAGTGGGAGATTCACACCTCTTAATCCAAGAGCAAAGAT  2516

Query 2517  TGAGAAACAGAATGAAGAAGGCTGGTTTGCTCTTTCTACCCATGTATCA  2565
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TGAGAAACAGAATGAAGAAGGCTGGTTTGCTCTTTCTACCCATGTATCA  2565