Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470166
- Subject:
- XM_017023734.1
- Aligned Length:
- 1791
- Identities:
- 1152
- Gaps:
- 639
Alignment
Query 1 ATGGCTGAGGGCAGTGCCGTGTCTGACCCTCAGCACGCCGCGCGTCTGCTGCGAGCGCTCAGCTCTTTCCGCGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGAGTCTCGCTTCTGCGACGCGCACCTGGTCCTCGACGGGGAGGAGATCCCGGTGCAGAAGAACATCCTGGCGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CGGCCAGCCCGTACATCAGGACAAAGTTAAACTATAATCCTCCAAAAGATGATGGATCAACTTATAAGATTGAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTTGAAGGGATATCGGTAATGGTTATGAGAGAGATCCTGGATTACATCTTCAGTGGGCAGATCAGGCTAAATGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGATACAATCCAAGATGTTGTTCAGGCAGCTGACCTGCTGCTACTGACGGACCTTAAAACCCTGTGCTGTGAGT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TTTTGGAAGGCTGCATTGCTGCTGAGAACTGTATTGGTATCCGTGACTTTGCACTACATTACTGCCTCCATCAC 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GTTCATTACCTTGCCACAGAATACCTGGAGACTCATTTCCGAGACGTCAGCAGCACGGAAGAATTCTTAGAGCT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 GAGTCCTCAAAAGCTTAAAGAAGTGATTTCTCTTGAGAAGTTAAACGTTGGCAATGAAAGATATGTCTTTGAAG 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 CAGTAATTCGATGGATAGCACATGATACAGAAATAAGAAAGGTCCACATGAAGGATGTTATGTCAGCTCTGTGG 666
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------------------ATGAAGGATGTTATGTCAGCTCTGTGG 27
Query 667 GTTTCAGGGTTGGACTCCAGTTATTTACGGGAACAGATGCTGAATGAACCATTAGTACGAGAAATTGTCAAAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 28 GTTTCAGGGTTGGACTCCAGTTATTTACGGGAACAGATGCTGAATGAACCATTAGTACGAGAAATTGTCAAAGA 101
Query 741 GTGTAGCAATATACCGCTCAGCCAGCCGCAGCAAGGGGAGGCGATGCTGGCCAACTTCAAACCCCGGGGCTACT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 GTGTAGCAATATACCGCTCAGCCAGCCGCAGCAAGGGGAGGCGATGCTGGCCAACTTCAAACCCCGGGGCTACT 175
Query 815 CTGAGTGCATCGTGACTGTTGGTGGAGAAGAGAGAGTTTCACGGAAACCCACAGCAGCGATGCGATGCATGTGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 176 CTGAGTGCATCGTGACTGTTGGTGGAGAAGAGAGAGTTTCACGGAAACCCACAGCAGCGATGCGATGCATGTGC 249
Query 889 CCTCTCTATGACCCTAACAGGCAGCTTTGGATCGAACTGGCCCCTTTAAGCATGCCGAGAATTAACCATGGAGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 250 CCTCTCTATGACCCTAACAGGCAGCTTTGGATCGAACTGGCCCCTTTAAGCATGCCGAGAATTAACCATGGAGT 323
Query 963 TCTCTCAGCAGAAGGATTTTTGTTTGTATTCGGGGGCCAAGATGAAAATAAGCAGACTCTTAGCTCAGGAGAAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324 TCTCTCAGCAGAAGGATTTTTGTTTGTATTCGGGGGCCAAGATGAAAATAAGCAGACTCTTAGCTCAGGAGAAA 397
Query 1037 AGTATGATCCAGATGCAAATACATGGACAGCATTGCCACCTATGAACGAGGCAAGACATAACTTCGGAATTGTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 398 AGTATGATCCAGATGCAAATACATGGACAGCATTGCCACCTATGAACGAGGCAAGACATAACTTCGGAATTGTG 471
Query 1111 GAGATAGATGGGATGCTGTACATTTTGGGAGGAGAGGATGGTGAAAAGGAGCTGATTTCCATGGAGTGTTACGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472 GAGATAGATGGGATGCTGTACATTTTGGGAGGAGAGGATGGTGAAAAGGAGCTGATTTCCATGGAGTGTTACGA 545
Query 1185 TATTTATTCTAAAACCTGGACAAAGCAACCTGATTTGACCATGGTCAGAAAGATCGGCTGCTATGCAGCTATGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 546 TATTTATTCTAAAACCTGGACAAAGCAACCTGATTTGACCATGGTCAGAAAGATCGGCTGCTATGCAGCTATGA 619
Query 1259 AAAAGAAAATCTACGCCATGGGTGGAGGCTCCTACGGAAAGCTTTTTGAGTCTGTAGAGTGTTATGATCCCAGG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 AAAAGAAAATCTACGCCATGGGTGGAGGCTCCTACGGAAAGCTTTTTGAGTCTGTAGAGTGTTATGATCCCAGG 693
Query 1333 ACCCAGCAGTGGACTGCCATATGTCCACTAAAAGAGAGGAGGTTTGGAGCGGTGGCCTGTGGAGTTGCTATGGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 694 ACCCAGCAGTGGACTGCCATATGTCCACTAAAAGAGAGGAGGTTTGGAGCGGTGGCCTGTGGAGTTGCTATGGA 767
Query 1407 GCTGTATGTGTTTGGGGGAGTCCGAAGTCGTGAGGACGCCCAGGGTAGCGAGATGGTAACTTGCAAGTCCGAGT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 768 GCTGTATGTGTTTGGGGGAGTCCGAAGTCGTGAGGACGCCCAGGGTAGCGAGATGGTAACTTGCAAGTCCGAGT 841
Query 1481 TCTACCATGATGAGTTTAAAAGGTGGATCTATCTTAACGACCAGAATTTATGCATCCCCGCCAGTTCCTCTTTT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 TCTACCATGATGAGTTTAAAAGGTGGATCTATCTTAACGACCAGAATTTATGCATCCCCGCCAGTTCCTCTTTT 915
Query 1555 GTTTATGGAGCTGTACCTATAGGAGCCAGTATTTATGTTATTGGAGATCTTGATACAGGTACCAATTACGACTA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 916 GTTTATGGAGCTGTACCTATAGGAGCCAGTATTTATGTTATTGGAGATCTTGATACAGGTACCAATTACGACTA 989
Query 1629 CGTGCGTGAGTTTAAAAGAAGCACAGGAACCTGGCACCACACTAAACCACTCCTTCCATCCGACCTTCGCCGTA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 990 CGTGCGTGAGTTTAAAAGAAGCACAGGAACCTGGCACCACACTAAACCACTCCTTCCATCCGACCTTCGCCGTA 1063
Query 1703 CAGGATGTGCAGCCTTACGCATTGCGAATTGCAAGCTTTTCCGCCTGCAGCTTCAGCAAGGCTTATTCCGTATT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064 CAGGATGTGCAGCCTTACGCATTGCGAATTGCAAGCTTTTCCGCCTGCAGCTTCAGCAAGGCTTATTCCGTATT 1137
Query 1777 CGTGTTCATTCCCCT 1791
|||||||||||||||
Sbjct 1138 CGTGTTCATTCCCCT 1152
