Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470199
• Subject: NM_199195.1
• Aligned Length: 1176
• Identities: 854
• Gaps: 210

Alignment

Query    1  ATGGCGGTTGTAGCGGCGGCTGCCGGCTGGCTACTCAGGCTCAGGGCGGCAGGGGCTGAGGGGCACTGGCGTCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCTTCCTGGCGCGGGGCTGGCGCGGGGCTTTTTGCACCCCGCCGCGACTGTCGAGGATGCGGCCCAGAGGCGGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGGTGGCTCATTTTACTTTCCAGCCAGATCCGGAGCCCCGGGAGTACGGGCAAACTCAGAAAATGAATCTTTTC  222
                                                                          |||||.||.|||
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------ATGAACCTCTTC  12

Query  223  CAGTCTGTAACAAGTGCCTTGGATAACTCATTGGCCAAAGATCCTACTGCAGTAATATTTGGTGAAGATGTTGC  296
            |||||..|||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   13  CAGTCAATAACAAGTGCCCTGGATAACTCATTAGCCAAAGACCCCACTGCAGTAATATTTGGTGAAGATGTTGC  86

Query  297  CTTTGGTGGAGTCTTTAGATGCACTGTTGGCTTGCGAGACAAATATGGAAAAGATAGAGTTTTTAATACCCCAT  370
            |||||||||||||||..|||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct   87  CTTTGGTGGAGTCTTCCGATGCACTGTTGGTTTACGAGACAAATACGGAAAAGATAGAGTGTTTAACACCCCGT  160

Query  371  TGTGTGAACAAGGAATTGTTGGATTTGGAATCGGAATTGCGGTCACTGGAGCTACTGCCATTGCGGAAATTCAG  444
            ||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||
Sbjct  161  TGTGTGAACAAGGAATAGTTGGATTTGGCATTGGAATCGCGGTCACCGGTGCTACAGCTATTGCGGAAATCCAG  234

Query  445  TTTGCAGATTATATTTTCCCTGCATTTGATCAGATTGTTAATGAAGCTGCCAAGTATCGCTATCGCTCTGGGGA  518
            |||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  235  TTTGCCGACTATATTTTCCCTGCCTTTGATCAGATTGTCAACGAAGCTGCCAAGTATCGCTACCGCTCAGGTGA  308

Query  519  TCTTTTTAACTGTGGAAGCCTCACTATCCGGTCCCCTTGGGGCTGTGTTGGTCATGGGGCTCTCTATCATTCTC  592
            ||||||.||||||||.||||||||.||||||.||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  309  TCTTTTCAACTGTGGGAGCCTCACCATCCGGGCCCCGTGGGGTTGTGTGGGCCATGGGGCTCTCTACCATTCTC  382

Query  593  AGAGTCCTGAAGCATTTTTTGCCCATTGCCCAGGAATCAAGGTGGTTATACCCAGAAGCCCTTTCCAGGCCAAA  666
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct  383  AGAGTCCTGAAGCCTTTTTTGCCCATTGCCCAGGGATCAAGGTGGTAATACCCCGAAGCCCTTTCCAGGCCAAG  456

Query  667  GGACTTCTTTTGTCATGCATAGAGGATAAAAATCCTTGTATATTTTTTGAACCTAAAATACTTTACAGGGCAGC  740
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  457  GGACTTCTGTTGTCATGCATAGAAGATAAAAATCCATGTATATTTTTTGAACCTAAAATACTTTACCGGGCAGC  530

Query  741  AGCGGAAGAAGTCCCTATAGAACCATACAACATCCCACTGTCCCAGGCCGAAGTCATACAGGAAGGGAGTGATG  814
            ||.||||.|.|||||..|||||||.|||||.|||||..||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct  531  AGTGGAACAGGTCCCAGTAGAACCCTACAAGATCCCCTTGTCTCAGGCTGAAGTCATCCAGGAGGGCAGCGATG  604

Query  815  TTACTCTAGTTGCCTGGGGCACTCAGGTTCATGTGATCCGAGAGGTAGCTTCCATGGCAAAAGAAAAGCTTGGA  888
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||..||||||||||||||
Sbjct  605  TGACTCTGGTTGCCTGGGGCACTCAGGTTCATGTCATCCGGGAGGTGGCTTCCATGGCCCAAGAAAAGCTTGGA  678

Query  889  GTGTCTTGTGAAGTCATTGATCTGAGGACTATAATACCTTGGGATGTGGACACAATTTGTAAGTCTGTGATCAA  962
            ||.||||||||||||||.||||||.||||.||..|.||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||
Sbjct  679  GTATCTTGTGAAGTCATCGATCTGCGGACAATTGTGCCTTGGGATGTGGATACAGTTTGCAAGTCTGTGATCAA  752

Query  963  AACAGGGCGACTGCTAATCAGTCACGAGGCTCCCTTGACAGGCGGCTTTGCATCGGAAATCAGCTCTACAGTTC  1036
            |||.|||||||||.|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|
Sbjct  753  AACCGGGCGACTGTTGATCAGCCACGAGGCTCCCTTAACAGGCGGCTTTGCCTCTGAGATCAGCTCCACGGTCC  826

Query 1037  AGGAGGAATGTTTCTTGAACCTAGAGGCTCCTATATCAAGAGTATGTGGTTATGACACACCATTTCCTCACATT  1110
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct  827  AGGAAGAATGTTTCTTGAACCTAGAGGCTCCAATATCTCGAGTTTGCGGATATGACACCCCGTTTCCTCACATC  900

Query 1111  TTTGAACCATTCTACATCCCAGACAAATGGAAGTGTTATGATGCCCTTCGAAAAATGATCAACTAT  1176
            |||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  901  TTTGAGCCCTTTTATATCCCAGACAAATGGAAGTGCTACGATGCCCTTCGCAAGATGATCAACTAT  966