Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470199
• Subject: XM_005248756.5
• Aligned Length: 1181
• Identities: 1070
• Gaps: 106

Alignment

Query    1  ATGGCGGTTGTAGCGGCGGCTGCCGGCTGGCTACTCAGGCTCAGGGCGGCAGGGGCTGAGGGGCACTGGCGTCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGTTGTAGCGGCGGCTGCCGGCTGGCTACTCAGGCTCAGGGCGGCAGGGGCTGAGGGGCACTGGCGTCG  74

Query   75  GCTTCCTGGCGCGGGGCTGGCGCGGGGCTTTTTGCACCCCGCCGCGACTGTCGAGGATGCGGCCCAGAGGCGGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTTCCTGGCGCGGGGCTGGCGCGGGGCTTTTTGCACCCCGCCGCGACTGTCGAGGATGCGGCCCAGAGGCGGC  148

Query  149  AGGTGGCTCATTTTACTTTCCAGCCAGATCCGGAGCCCCGGGAGTACGGGCAAACTCAGAAAATGAATCTTTTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGTGGCTCATTTTACTTTCCAGCCAGATCCGGAGCCCCGGGAGTACGGGCAAACTCAGAAAATGAATCTTTTC  222

Query  223  CAGTCTGTAACAAGTGCCTTGGATAACTCATTGGCCAAAGATCCTACTGCAGTAATATTTGGTGAAGATGTTGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGTCTGTAACAAGTGCCTTGGATAACTCATTGGCCAAAGATCCTACTGCAGTAATATTTGGTGAAGATGTTGC  296

Query  297  CTTTGGTGGAGTCTTTAGATGCACTGTTGGCTTGCGAGACAAATATGGAAAAGATAGAGTTTTTAATACCCCAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTTGGTGGAGTCTTTAGATGCACTGTTGGCTTGCGAGACAAATATGGAAAAGATAGAGTTTTTAATACCCCAT  370

Query  371  TGTGTGAACAAGGAATTGTTGGATTTGGAATCGGAATTGCGGTCACTGGAGCTACTGCCATTGCGGAAATTCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTGTGAACAAGGAATTGTTGGATTTGGAATCGGAATTGCGGTCACTGGAGCTACTGCCATTGCGGAAATTCAG  444

Query  445  TTTGCAGATTATATTTTCCCTGCATTTGATCAGATTGTTAATGAAGCTGCCAAGTATCGCTATCGCTCTGGGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTGCAGATTATATTTTCCCTGCATTTGATCAGATTGTTAATGAAGCTGCCAAGTATCGCTATCGCTCTGGGGA  518

Query  519  TCTTTTTAACTGTGGAAGCCTCACTATCCGGTCCCCTTGGGGCTGTGTTGGTCATGGGGCTCTCTATCATTCTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCTTTTTAACTGTGGAAGCCTCACTATCCGGTCCCCTTGGGGCTGTGTTGGTCATGGGGCTCTCTATCATTCTC  592

Query  593  AGAGTCCTGAAGCATTTTTTGCCCATTGCCCAGGAATCAAGGTGGTTATACCCAGAAGCCCTTTCCAGGCCAAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAGTCCTGAAGCATTTTTTGCCCATTGCCCAGGAATCAAGGTGGTTATACCCAGAAGCCCTTTCCAGGCCAAA  666

Query  667  GGACTTCTTTTGTCATGCATAGAGGATAAAAATCCTTGTATATTTTTTGAACCTAAAATACTTTACAGGGCAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGACTTCTTTTGTCATGCATAGAGGATAAAAATCCTTGTATATTTTTTGAACCTAAAATACTTTACAGGGCAGC  740

Query  741  AGCGGAAGAAGTCCCTATAGAACCATACAACATCCCACTGTCCCAGGCCGAAGTCATACAGGAAGGGAGTGATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCGGAAGAAGTCCCTATAGAACCATACAACATCCCACTGTCCCAGGCCGAAGTCATACAGGAAGGGAGTGATG  814

Query  815  TTACTCTAGTTGCCTGGGGCACTCAGGTTCATGTGATCCGAGAGGTAGCTTCCATGGCAAAAGAAAAGCTTGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTACTCTAGTTGCCTGGGGCACTCAGGTTCATGTGATCCGAGAGGTAGCTTCCATGGCAAAAGAAAAGCTTGGA  888

Query  889  GTGTCTTGTGAAGTCATTGATCTGAGGACTATAATACCTTGGGATGTGGACACAATTTGTAAGTCTGTGATCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGTCTTGTGAAGTCATTGATCTGAGGACTATAATACCTTGGGATGTGGACACAATTTGTAAGTCTGTGATCAA  962

Query  963  AACAGGGCGACTGCTAATCAGTCACGAGGCTCCCTTGACAGGCGGCTTTGCATCGGAAATCAGCTCTACAGTTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AACAGGGCGACTGCTAATCAGTCACGAGGCTCCCTTGACAGGCGGCTTTGCATCGGAAATCAGCTCTACAGTTC  1036

Query 1037  AGGAGGAATGTTTCTTGAACCTAGAGGCTCCTAT-ATCAAGAGTATGTGGTTATGACACACCATTTCCTC----  1105
            ||     ||.|       |||        ||.|| |  ||||                       .||||    
Sbjct 1037  AG-----ATAT-------ACC--------CCCATGA--AAGA-----------------------ACCTCTGTT  1065

Query 1106  ACATTTTTGAACCATTCTACATCCCAGACAAATGGAAGTGTTATGATGCCCTTCGAAAAATGATCAACTAT  1176
            |.|||||                 ||| .||||                                      
Sbjct 1066  AAATTTT-----------------CAG-TAAAT--------------------------------------  1080