Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470230
- Subject:
- XM_017009387.1
- Aligned Length:
- 1516
- Identities:
- 1242
- Gaps:
- 269
Alignment
Query 1 ATGAAAAGAAGCAAAGAATTGATAACTAAAAATCATAGTCAAGAGGAAACAAGTATTCTTCGTTGTTGGAAATG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAAAGAAGCAAAGAATTGATAACTAAAAATCATAGTCAAGAGGAAACAAGTATTCTTCGTTGTTGGAAATG 74
Query 75 TAGAAAATGTATAGCAAGCTCTGGTTGTTTTATGGAGTATCTTGAGAATCAAGTGATTAAGGATAAAGATGATT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TAGAAAATGTATAGCAAGCTCTGGTTGTTTTATGGAGTATCTTGAGAATCAAGTGATTAAGGATAAAGATGATT 148
Query 149 CAGTTGATGCTCAAAATATTTGTCATGTGTGGCACATGAATGTAGAAGCCCTTCCAGAATGGATAAGCTGCCTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAGTTGATGCTCAAAATATTTGTCATGTGTGGCACATGAATGTAGAAGCCCTTCCAGAATGGATAAGCTGCCTA 222
Query 223 ATCCAAAAAGCCCAGTGGACAGTTGGAAAACTGAATTGTCCTTTCTGTGGGGCCCGTTTAGGGGGCTTTAATTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATCCAAAAAGCCCAGTGGACAGTTGGAAAACTGAATTGTCCTTTCTGTGGGGCCCGTTTAGGGGGCTTTAATTT 296
Query 297 TGTCAGCACTCCAAAATGTTCCTGTGGCCAGCTTGCAGCTGTACATCTCTCCAAGAGCCGGACTGATTATCAGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGTCAGCACTCCAAAATGTTCCTGTGGCCAGCTTGCAGCTGTACATCTCTCCAAGAGCCGGACTGATTATCAGC 370
Query 371 CAACACAGGCAGGCAGACTAATGAGACCATCAGTGAAATACTTGTCACATCCTAGAGTTCAGTCAGGTTGTGAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAACACAGGCAGGCAGACTAATGAGACCATCAGTGAAATACTTGTCACATCCTAGAGTTCAGTCAGGTTGTGAC 444
Query 445 AAGGAAGCTCTGCTGACAGGTGGTGGCTCTGAAAACAGAAATCACAGGCTTTTAAACATGGCCCGAAATAATAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGGAAGCTCTGCTGACAGGTGGTGGCTCTGAAAACAGAAATCACAGGCTTTTAAACATGGCCCGAAATAATAA 518
Query 519 TGACCCTGGAAGATTAACAGAAGCACTCTGCCTGGAGGTGCGACCAACATATTTTGAGATGAAGAACGAAAAAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGACCCTGGAAGATTAACAGAAGCACTCTGCCTGGAGGTGCGACCAACATATTTTGAGATGAAGAACGAAAAAC 592
Query 593 TGCTGTCCAAAGCATCAGAACCAAAATACCAGCTTTTTGTTCCCCAGCTTGTGACTGGCAGATGCGCTACAAGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGCTGTCCAAAGCATCAGAACCAAAATACCAGCTTTTTGTTCCCCAGCTTGTGACTGGCAGATGCGCTACAAGA 666
Query 667 GCTTTTCATAGAAAATCACATAGTTTGGATCTGAACATCAGTGAGAAACTGACTTTATTACCCACTTTATATGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCTTTTCATAGAAAATCACATAGTTTGGATCTGAACATCAGTGAGAAACTGACTTTATTACCCACTTTATATGA 740
Query 741 AATACATAGTAAGACTACTGCCTATTCCAGACTAAATGAAACACAGCCTATTGACCTTTCAGGCTTGCCTTTAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AATACATAGTAAGACTACTGCCTATTCCAGACTAAATGAAACACAGCCTATTGACCTTTCAGGCTTGCCTTTAC 814
Query 815 AATCTAGTAAAAATAGCTATTCCTTTCAGAATCCATCCAGTTTTGATCCTAGTATGCTGCTGCAAAGATTTTCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AATCTAGTAAAAATAGCTATTCCTTTCAGAATCCATCCAGTTTTGATCCTAGTATGCTGCTGCAAAGATTTTCA 888
Query 889 GTGGCCCCCCATGAGACCCAGACACAAAGAGGAGGAGAATTTCAGTGTGGTCTAGAAGCTGCTTCAGTGTATTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTGGCCCCCCATGAGACCCAGACACAAAGAGGAGGAGAATTTCAGTGTGGTCTAGAAGCTGCTTCAGTGTATTC 962
Query 963 TGACCATACTAATACTAACAATCTGACTTTCCTGATGGACCTGCCCTCAGCTGGCAGGAGCATGCCGGAGGCCT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGACCATACTAATACTAACAATCTGACTTTCCTGATGGACCTGCCCTCAGCTGGCAGGAGCATGCCGGAGGCCT 1036
Query 1037 CAGACCAGGAAGAGCACCTCTCCCCTCTGGACTTCCTGCACTCAGCCAATTTTTCATTGGGCAGCATTAATCAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGACCAGGAAGAGCACCTCTCCCCTCTGGACTTCCTGCACTCAGCCAATTTTTCATTGGGCAGCATTAATCAG 1110
Query 1111 AGGCTTAATAAGAGAGAAAGGAGCAAGTTGAAGAATCTAAGAAGGAAACAACGAAGGCGTGAAAGATGGCTACA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGGCTTAATAAGAGAGAAAGGAGCAAGTTGAAGAATCTAAGAAGGAAACAACGAAGGCGTGAAAGATGGCTACA 1184
Query 1185 GAAGCAGGGTAAATACTCAGGAGTGGGATTGCTGGATCATATGGTAAGTATATATTT-----ACTT---ATA-- 1248
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|...| |||.||| |||| |||
Sbjct 1185 GAAGCAGGGTAAATACTCAGGAGTGGGATTGCTGGATCATATGTTTTCT-TATGTTTTGCAGACTTTGAATAAT 1257
Query 1249 -------------------------------------------------------------------------- 1248
Sbjct 1258 GAGATGAGTACAGATGAAGACAATGAATATGCAGAAGAAAAGGATAGCTACATCTGTGCAGTGTGTCTGGACGT 1331
Query 1249 -------------------------------------------------------------------------- 1248
Sbjct 1332 TTATTTCAACCCTTATATGTGTTACCCTTGCCATCACATCTTCTGTGAGCCCTGCTTACGGACTCTGGCCAAAG 1405
Query 1249 -------------------------------------------------------------------------- 1248
Sbjct 1406 ACAATCCTTCAAGCACTCCATGCCCATTGTGTCGGACAATTATTTCTAGAGTCTTTTTCCAAACAGAAGGAGGA 1479
Query 1249 ------------------------------------ 1248
Sbjct 1480 GGAAGAGGGAGAGGAAAAGGAAGGGAAGGGAAGGAA 1515