Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470248
• Subject: NM_001144894.2
• Aligned Length: 1248
• Identities: 938
• Gaps: 219

Alignment

Query    1  ATGTGTGACTCCAAGGAACCAAGGGTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAAGAAGATCCAACAACCAGTGGCATCAG  74
            |||.|||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||                             
Sbjct    1  ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTG-----------------------------  45

Query   75  ACTTTTTCCAAGAGACTTTCAATTCCAGCAGATACATGGCCACAAGAGCTCTACAGGGTGTCTTGGCCATGGCG  148
                                                                                      
Sbjct   46  --------------------------------------------------------------------------  45

Query  149  CCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCTTCATGCTCTTGGCTGGGGTCCTGGTGGCCATCCTTGTCCAAGTGTCCAAG  222
                                                                             |||||||||
Sbjct   46  -----------------------------------------------------------------GTGTCCAAG  54

Query  223  GTCCCCAGCTCCCTAAGTCAGGAACAATCCGAGCAAGACGCAATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGC  296
            ||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   55  GTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAAGACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGC  128

Query  297  AGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  129  AGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGG  202

Query  371  GTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAG  444
            |||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  203  GTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAG  276

Query  445  TTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCC  518
            .|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct  277  CTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCC  350

Query  519  AGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGA  592
            |||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct  351  AGAGAAATCTAAGATGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACTCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGA  424

Query  593  AATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCC  666
            ||||.||||.||||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.
Sbjct  425  AATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCT  498

Query  667  AAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCA  740
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|.|||||..|.||.|||||
Sbjct  499  AAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCA  572

Query  741  GCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTTGAAGACTGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACT  814
            ||||.|.|||||.||.||.||||||.|..|||||.|||||.|.|||||||||||||.||.|||||||..|||.|
Sbjct  573  GCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGAACGCCTGTGCCACCCCTGTCCCTGGGAAT  646

Query  815  GGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  647  GGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCATCACCGCCTGC  720

Query  889  CAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAG  962
            .|.||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  721  AAAGAAGTGGGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAAGTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGTCTTCCAG  794

Query  963  GAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCAC  1036
            .||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  795  AAGTAACCGCTTCACCTGGATGGGACTTTCAGATCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCAC  868

Query 1037  CTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAA  1110
            ||||||..|||||||||.|||.|||.||||||||.|||||.||||||||....|||.|.||||||||.||||||
Sbjct  869  CTCTGTTGCCCAGCTTCAAGCAGTATTGGAACAGAGGAGAGCCCAACAACGTTGGGGAGGAAGACTGCGCGGAA  942

Query 1111  TTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAG---C  1181
            ||||||||||.|||||||||||||.|...||||.|..|||.|||.|.||||||||||||||||.||||||   |
Sbjct  943  TTTAGTGGCAATGGCTGGAACGACGACAAATGTAATCTTGCCAAATTCTGGATCTGCAAAAAGTCCGCAGCCTC  1016

Query 1182  CTGCTTCAGAGACGAA------------------------------------------------  1197
            |||||.|||.||.|||                                                
Sbjct 1017  CTGCTCCAGGGATGAAGAACAGTTTCTTTCTCCAGCCCCTGCCACCCCAAACCCCCCTCCTGCG  1080