Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470248
• Subject: NM_021155.4
• Aligned Length: 1250
• Identities: 1053
• Gaps: 91

Alignment

Query    1  ATGTGTGACTCCAAGGAACCAAGGGTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAAGAAGATCCAACAAC-CAGTGGCATCA  73
            |||.|||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.||.|    ||||.| .||.|||.|..
Sbjct    1  ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAGGAGG----AACAGCTGAGAGGCCTTG  70

Query   74  GACTTTTTCCAAGAGACTTTCAATTCCAGCAGATACATGGCCACAAGAGCTCTA-CAGGGTGTCTTGGCCATGG  146
            ||    ||||.|.||||       ||.||  |||        ||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct   71  GA----TTCCGACAGAC-------TCGAG--GAT--------ACAAGAGCT-TAGCAGGGTGTCTTGGCCATGG  122

Query  147  CGCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCTTCATGCTCTTGGCTGGGGTCCTGGTGGCCATCCTTGTCCAAGTGTCCA  220
            ..|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||            .||||||||||||||||||
Sbjct  123  TCCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCTTCACGCTCTTGGCTGGG------------CTCCTTGTCCAAGTGTCCA  184

Query  221  AGGTCCCCAGCTCCCTAAGTCAGGAACAATCCGAGCAAGACGCAATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCT  294
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  185  AGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAAGACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCT  258

Query  295  GCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGT  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  259  GCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGT  332

Query  369  GGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTG  442
            |||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  333  GGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTG  406

Query  443  AGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTG  516
            ||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct  407  AGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTT  480

Query  517  CCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGA  590
            |||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct  481  CCAGAGAAATCTAAGATGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACTCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGA  554

Query  591  GAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAAT  664
            ||||||.||||.||||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||||||||.|.||||||||||
Sbjct  555  GAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAAT  628

Query  665  CCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAG  738
            |.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|.|||||..|.||.|||
Sbjct  629  CTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAG  702

Query  739  CAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTTGAAGACTGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGA  812
            ||||||.|.|||||.||.||.||||||.|..|||||.|||||.|.|||||||||||||.||.|||||||..|||
Sbjct  703  CAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGAACGCCTGTGCCACCCCTGTCCCTGGGA  776

Query  813  CTGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCT  886
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  777  ATGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCATCACCGCCT  850

Query  887  GCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCC  960
            ||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  851  GCAAAGAAGTGGGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAAGTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGTCTTCC  924

Query  961  AGGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTC  1034
            ||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  925  AGAAGTAACCGCTTCACCTGGATGGGACTTTCAGATCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTC  998

Query 1035  ACCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGG  1108
            ||||||||..|||||||||.|||.|||.||||||||.|||||.||||||||....|||.|.||||||||.||||
Sbjct  999  ACCTCTGTTGCCCAGCTTCAAGCAGTATTGGAACAGAGGAGAGCCCAACAACGTTGGGGAGGAAGACTGCGCGG  1072

Query 1109  AATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAG--  1180
            ||||||||||||.|||||||||||||.|...||||.|..|||.|||.|.||||||||||||||||.||||||  
Sbjct 1073  AATTTAGTGGCAATGGCTGGAACGACGACAAATGTAATCTTGCCAAATTCTGGATCTGCAAAAAGTCCGCAGCC  1146

Query 1181  -CCTGCTTCAGAGACGAA------------------------------------------------  1197
             ||||||.|||.||.|||                                                
Sbjct 1147  TCCTGCTCCAGGGATGAAGAACAGTTTCTTTCTCCAGCCCCTGCCACCCCAAACCCCCCTCCTGCG  1212