Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470256
• Subject: NM_001253706.1
• Aligned Length: 1288
• Identities: 1169
• Gaps: 8

Alignment

Query    1  ATGGCAGCGACCGATATAGCTCGCCAGGTGGGTGAAGGTTGCCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTT  74
            |||||||||.||||||||||||||||||||||.||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGCGGCCGATATAGCTCGCCAGGTGGGCGAAGATTGTCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTT  74

Query   75  TGACAGCTTGCCTGACCAGCTGGTGAATAAGTCCGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGCGTGGGAG  148
            .||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CGACAGCTTGCCTGACCAGCTGGTGAATAAGTCAGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGCGTGGGGG  148

Query  149  AGACAGGTTTGGGCAAGTCCACCCTCATGGACACCCTGTTCAACACCAAATTCGAAGGGGAGCCAGCCACCCAC  222
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  AGACAGGTTTGGGCAAGTCCACGCTCATGGATACCCTGTTTAACACCAAGTTTGAAGGGGAGCCAGCGACCCAC  222

Query  223  ACACAGCCGGGTGTCCAGCTCCAGTCTAATACCTATGACCTCCAAGAGAGCAACGTGAGGCTAAAGCTCACGAT  296
            ||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.||.|.||.|||||.||
Sbjct  223  ACACAGCCAGGGGTTCAGCTCCAGTCCAATACCTACGACCTCCAGGAGAGCAACGTGGGGTTGAAACTCACAAT  296

Query  297  CGTTAGCACAGTTGGCTTTGGGGACCAGATCAACAAAGAGGACAGCTACAAGCCTATCGTGGAATTCATCGATG  370
            .||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  297  TGTGAGCACTGTAGGCTTTGGGGATCAGATCAACAAGGAGGACAGCTACAAGCCCATCGTGGAATTCATTGATG  370

Query  371  CACAATTCGAGGCCTACCTGCAGGAAGAGCTAAAGATCCGAAGAGTGCTACACACCTACCATGACTCCCGAATC  444
            |.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCAGTTTGAGGCCTACCTACAAGAGGAGCTGAAGATCCGAAGAGTACTGCACTCCTACCATGACTCCCGAATC  444

Query  445  CATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCCACGGGTCATTCCCTGAAGTCTCTGGACCTAGTGACTATGAAGAAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  CATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCGACAGGACATTCGCTTAAGTCTCTGGACCTAGTGACCATGAAGAAGCT  518

Query  519  GGACAGTAAGGTGAACATCATCCCCATCATTGCCAAAGCAGATGCCATTTCGAAGAGTGAGCTAACAAAGTTCA  592
            |||.|||||||||||||||||.|||.|.||||||||..|||||||||||||.|||||||||||..|||||||||
Sbjct  519  GGATAGTAAGGTGAACATCATTCCCGTTATTGCCAAGTCAGATGCCATTTCTAAGAGTGAGCTGGCAAAGTTCA  592

Query  593  AAATCAAAATCACCAGCGAGCTTGTCAGCAACGGAGTCCAGATCTATCAGTTTCCTACAGATGATGAGTCGGTG  666
            |.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  593  AGATCAAAATCACCAGCGAACTTGTGAGCAATGGAGTCCAGATCTATCAGTTCCCCACAGACGATGAGTCGGTG  666

Query  667  -GCAGAGATCAATGGAACCATGAACGCCCACCTGCCGTTTGCTGTCATTGGCAGCACAGAAGAACTGAAGATAG  739
             || ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  667  AGC-GAGATCAATGGAACCATGAATGCCCACCTGCCGTTTGCTGTTGTTGGCAGCACAGAAGAAGTGAAGATAG  739

Query  740  GCAACAAGATGATGAGGGCGCGGCAGTATCCTTGGGGCACTGTGCAGGTTGAAAACGAGGCCCACTGCGACTTT  813
            ||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  740  GCAACAAGATGATGCGGGCTCGGCAGTATCCTTGGGGGACTGTGCAGGTTGAAAACGAGGCTCACTGCGACTTT  813

Query  814  GTGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAACATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACACCCGGCACTATGA  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  814  GTGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAACATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACGCCCGGCACTATGA  887

Query  888  GCTGTATCGCCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCAAACCCTTCAGTTTAC  961
            ..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  888  ATTGTACCGCCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCAAACCATTCAGTTTGC  961

Query  962  AGGAGACATATGAGGCCAAAAGGAACGAGTTCCTAGGGGAACTCCAGAAAAAAGAAGAGGAGATGAGACAGATG  1035
            ||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  962  AGGAGACATATGAGGCAAAGAGAAATGAGTTCCTTGGGGAGCTCCAGAAGAAAGAAGAGGAGATGAGGCAGATG  1035

Query 1036  TTCGTCCAGCGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAAGAGGCAGAGAAAGAGCTGCACGAGAAGTTTGACCG  1109
            ||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1036  TTTGTCCAGAGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAGGAGGCTGAAAAAGAGCTGCATGAGAAATTTGACCG  1109

Query 1110  TCTGAAGAAACTGCACCAGGACGAGAAGAAGAAACTGGAGGATAAGAAGAAATCCCTGGATGATGAAGTGAATG  1183
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||..||||||||.|||.||||.|
Sbjct 1110  TCTGAAGAAACTGCACCAGGAAGAGAAGAAGAAGCTGGAGGATAAGAAGAAATGTCTGGATGAGGAAATGAACG  1183

Query 1184  CTTTCAAGCAAAGAAAGACGGCGGCTGAGCTGCTCCAGTCCCAGGGCTCCCAGGCTGGAGGCTCACAGACTCTG  1257
            |.||||||||.||||||.||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1184  CCTTCAAGCAGAGAAAGGCGGCAGCTGAGCTGCTCCAGTCTCAGGGCTCTCAGGCTGGGGGCTCACAGACTCTG  1257

Query 1258  AAGAGAGACAAAGAGAAGAAAAACTTTTTT  1287
            ||.||.||||||||||||||.||.      
Sbjct 1258  AAAAGGGACAAAGAGAAGAAGAAT------  1281