Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470256
- Subject:
- XM_006541391.2
- Aligned Length:
- 1302
- Identities:
- 1148
- Gaps:
- 42
Alignment
Query 1 ATGGCAGCGACCGATATAGCTCGCCAGGTGGGTGAAGGTTGCCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTT 74
|||||||||.||||||||||||||||||||||.||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGCGGCCGATATAGCTCGCCAGGTGGGCGAAGATTGTCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTT 74
Query 75 TGACAGCTTGCCTGACCAGCTGGTGAATAAGTCCGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGCGTGGGAG 148
.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 CGACAGCTTGCCTGACCAGCTGGTGAATAAGTCAGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGCGTGGGGG 148
Query 149 AGACAGGTTTGGGCAAGTCCACCCTCATGGACACCCTGTTCAACACCAAATTCGAAGGGGAGCCAGCCACCCAC 222
||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 AGACAGGTTTGGGCAAGTCCACGCTCATGGATACCCTGTTTAACACCAAGTTTGAAGGGGAGCCAGCGACCCAC 222
Query 223 ACACAGCCGGGTGTCCAGCTCCAGTCTAATACCTATGACCTCCAAGAGAGCAACGTGAGGCTAAAGCTCACGAT 296
||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.||.|.||.|||||.||
Sbjct 223 ACACAGCCAGGGGTTCAGCTCCAGTCCAATACCTACGACCTCCAGGAGAGCAACGTGGGGTTGAAACTCACAAT 296
Query 297 CGTTAGCACAGTTGGCTTTGGGGACCAGATCAACAAAGAGGACAGCTACAAGCCTATCGTGGAATTCATCGATG 370
.||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 297 TGTGAGCACTGTAGGCTTTGGGGATCAGATCAACAAGGAGGACAGCTACAAGCCCATCGTGGAATTCATTGATG 370
Query 371 CACAATTCGAGGCCTACCTGCAGGAAGAGCTAAAGATCCGAAGAGTGCTACACACCTACCATGACTCCCGAATC 444
|.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTCAGTTTGAGGCCTACCTACAAGAGGAGCTGAAGATCCGAAGAGTACTGCACTCCTACCATGACTCCCGAATC 444
Query 445 CATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCCACGGGTCATTCCCTGAAGTCTCTGGACCTAGTGACTATGAAGAAGCT 518
||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 CATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCGACAGGACATTCGCTTAAGTCTCTGGACCTAGTGACCATGAAGAAGCT 518
Query 519 GGACAGTAAGGTGAACATCATCCCCATCATTGCCAAAGCAGATGCCATTTCGAAGAGTGAGCTAACAAAGTTCA 592
|||.|||||||||||||||||.|||.|.||||||||..|||||||||||||.|||||||||||..|||||||||
Sbjct 519 GGATAGTAAGGTGAACATCATTCCCGTTATTGCCAAGTCAGATGCCATTTCTAAGAGTGAGCTGGCAAAGTTCA 592
Query 593 AAATCAAAATCACCAGCGAGCTTGTCAGCAACGGAGTCCAGATCTATCAGTTTCCTACAGATGATGAGTCGGTG 666
|.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 593 AGATCAAAATCACCAGCGAACTTGTGAGCAATGGAGTCCAGATCTATCAGTTCCCCACAGACGATGAGTCG--- 663
Query 667 GCAGAGATCAATGGAACCATGAACGCCCACCTGCCGTTTGCTGTCATTGGCAGCACAGAAGAACTGAAGATAGG 740
||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 664 ------------------------GCCCACCTGCCGTTTGCTGTTGTTGGCAGCACAGAAGAAGTGAAGATAGG 713
Query 741 CAACAAGATGATGAGGGCGCGGCAGTATCCTTGGGGCACTGTGCAGGTTGAAAACGAGGCCCACTGCGACTTTG 814
|||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 714 CAACAAGATGATGCGGGCTCGGCAGTATCCTTGGGGGACTGTGCAGGTTGAAAACGAGGCTCACTGCGACTTTG 787
Query 815 TGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAACATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACACCCGGCACTATGAG 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.
Sbjct 788 TGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAACATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACGCCCGGCACTATGAA 861
Query 889 CTGTATCGCCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCAAACCCTTCAGTTTACA 962
.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 862 TTGTACCGCCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCAAACCATTCAGTTTGCA 935
Query 963 GGAGACATATGAGGCCAAAAGGAACGAGTTCCTAGGGGAACTCCAGAAAAAAGAAGAGGAGATGAGACAGATGT 1036
|||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 936 GGAGACATATGAGGCAAAGAGAAATGAGTTCCTTGGGGAGCTCCAGAAGAAAGAAGAGGAGATGAGGCAGATGT 1009
Query 1037 TCGTCCAGCGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAAGAGGCAGAGAAAGAGCTGCACGAGAAGTTTGACCGT 1110
|.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1010 TTGTCCAGAGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAGGAGGCTGAAAAAGAGCTGCATGAGAAATTTGACCGT 1083
Query 1111 CTGAAGAAACTGCACCAGGACGAGAAGAAGAAACTGGAGGATAAGAAGAAATCCCTGGATGATGAAGTGAATGC 1184
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||..||||||||.|||.||||.||
Sbjct 1084 CTGAAGAAACTGCACCAGGAAGAGAAGAAGAAGCTGGAGGATAAGAAGAAATGTCTGGATGAGGAAATGAACGC 1157
Query 1185 TTTCAAGCAAAGAAAGACGGCGGCTGAGCTGCTCCAGTCCCAGGGCTCCCAGGCTGGAGGCTCACAGACTCTGA 1258
.||||||||.||||||.||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1158 CTTCAAGCAGAGAAAGGCGGCAGCTGAGCTGCTCCAGTCTCAGGGCTCTCAGGCTGGGGGCTCACAGACTCTGA 1231
Query 1259 AGAGAGACAAAGAGAAGAAAAA----------CTTTTTT----- 1287
|.||.||||||||||||||.|| ||.|.|.
Sbjct 1232 AAAGGGACAAAGAGAAGAAGAATAACCCATGGCTGTGTATTGAA 1275