Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470264
- Subject:
- XM_017320418.1
- Aligned Length:
- 1440
- Identities:
- 1165
- Gaps:
- 186
Alignment
Query 1 ATGAGAGATGTTACCATTGTGAAAGAAGGTTGGGTTCAGAAGAGGGGAGAATATATAAAAAACTGGAGGCCAAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ATACTTCCTTTTGAAGACAGATGGCTCATTCATAGGATATAAAGAGAAACCTCAAGATGTGGATTTACCTTATC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCCTCAACAACTTTTCAGTGGCAAAATGCCAGTTAATGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAACACATTTATAATC 222
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1 -----------------------------------ATGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAATACATTTATTATC 39
Query 223 AGATGTCTCCAGTGGACTACTGTTATAGAGAGAACATTTCATGTAGATACTCCAGAGGAAAGGGAAGAATGGAC 296
||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 40 AGATGTCTTCAGTGGACCACTGTTATAGAGAGAACATTTCATGTAGATACACCAGAGGAAAGAGAAGAGTGGAC 113
Query 297 AGAAGCTATCCAGGCTGTAGCAGACAGACTGCAGAGGCAAGAAGAGGAGAGAATGAATTGTAGTCCAACTTCAC 370
.|||||||||||.||.|||||.|||.||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 114 GGAAGCTATCCAAGCCGTAGCCGACCGATTGCAGAGGCAAGAGGAGGAGAGGATGAATTGTAGCCCAACCTCAC 187
Query 371 AAATTGATAATATAGGAGAGGAAGAGATGGATGCCTCTACAACCCATCATAAAAGAAAGACAATGAATGATTTT 444
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 188 AGATTGATAATATAGGAGAAGAAGAGATGGATGCGTCTACAACCCATCATAAAAGAAAGACGATGAATGATTTT 261
Query 445 GACTATTTGAAACTACTAGGTAAAGGCACTTTTGGGAAAGTTATTTTGGTTCGAGAGAAGGCAAGTGGAAAATA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262 GACTATTTGAAACTACTAGGTAAAGGCACTTTTGGGAAAGTTATTTTGGTTCGAGAGAAGGCAAGTGGAAAATA 335
Query 519 CTATGCTATGAAGATTCTGAAGAAAGAAGTCATTATTGCAAAGGATGAAGTGGCACACACTCTAACTGAAAGCA 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 336 CTATGCTATGAAGATTCTGAAGAAAGAAGTCATTATTGCAAAGGATGAAGTGGCACACACTCTTACTGAAAGCA 409
Query 593 GAGTATTAAAGAACACTAGACATCCCTTTTTAACATCCTTGAANTATNCNTNCCAGANAAAAGACNGTTTGTGT 666
|||||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|.|.|||||.|||||||.||||||||
Sbjct 410 GAGTACTAAAGAACACCAGACATCCATTTTTAACATCCTTGAAATATTCCTTCCAGACAAAAGACCGTTTGTGT 483
Query 667 TTTGTGATGGAATATGTTANNGGGGGCGAGCTGTTTTTCCATTTGTCGAGAGAGCGGGTGTTCTCTGAGGACCG 740
|||||||||||||||||||..||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 484 TTTGTGATGGAATATGTTAATGGCGGAGAGCTGTTTTTCCATTTGTCGAGAGAGCGAGTGTTCTCTGAGGACCG 557
Query 741 CACACGTTTCTATGGTGCAGAAATTGTCTCTGCCTTGGACTATCTACATTCCCGGNAAGATTTGTGGTACCGTG 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||| |.||.|||| |||| ||||||||
Sbjct 558 CACACGTTTCTATGGTGCAGAAATTGTCTCTGCTTTGGACTATCTACATT-CTGGAAAGA-TTGT-GTACCGTG 628
Query 815 ATCTCAAGTTGGAGAATCTAATGCTGGACAAAGATGGCCACATAAAAATTACAGATTTTGGACTTTGCAAAGAA 888
|||||||||||||||||.|.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 629 ATCTCAAGTTGGAGAATTTGATGCTAGATAAGGATGGCCATATAAAAATTACGGATTTTGGGCTTTGCAAAGAA 702
Query 889 GGGATCACAGATGCAGCCACCATGAAGACATTCTGTGGCACTCCAGAATATCTGGCACCAGAGGTGTTAGAAGA 962
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 703 GGGATCACAGATGCAGCTACCATGAAGACATTCTGTGGCACACCAGAGTACCTGGCACCAGAGGTATTAGAAGA 776
Query 963 TAATGACTATGGCCGAGCAGTAGACTGGTGGGGCCTAGGGGTTGTCATGTATGAAATGATGTGTGGGAGGTTAC 1036
||||||||||||||||||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 777 TAATGACTATGGCCGAGCCGTGGACTGGTGGGGCTTAGGTGTTGTCATGTATGAAATGATGTGTGGAAGGTTGC 850
Query 1037 CTTTCTACAACCAGGACCATGAGAAACTTTTTGAATTAATATTAATGGAAGACATTAAATTTCCTCGAACACTC 1110
||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 851 CTTTCTACAACCAGGATCATGAGAAACTCTTTGAATTAATACTAATGGAAGACATTAAATTCCCCCGAACACTC 924
Query 1111 TCTTCAGATGCAAAATCATTGCTTTCAGGGCTCTTGATAAAGGATCCAAATAAACGCCTTGGTGGAGGACCAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 925 TCTTCAGATGCAAAATCATTGCTTTCAGGGCTCTTGATAAAGGATCCAAATAAACGCCTTGGTGGAGGGCCAGA 998
Query 1185 TGATGCAAAAGAAATTATGAGACACAGTTTCTTCTCTGGAGTAAACTGGCAAGATGTATATGATAAAAAGCTTG 1258
|||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 999 TGATGCAAAAGAAATCATGAGGCATAGTTTTTTTTCTGGAGTAAACTGGCAAGATGTATATGACAAAAAGCTTG 1072
Query 1259 TACCTCCTTTTAAACCTCAAGTAACATCTGAGACAGATACTAGATATTTTGATGAAGAATTTACAGCTCAGACT 1332
|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 TACCTCCTTTTAAGCCTCAAGTAACATCTGAAACAGACACCCGATATTTTGATGAAGAATTTACAGCTCAGACT 1146
Query 1333 ATTACAATAACACCACCTGAAAAATATGATGAGGATGGTATGGACTGCATGGACAATGAGAGGCGGCCGCATTT 1406
|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||.||||||||||.|||.|||||||.||.||
Sbjct 1147 ATTACAATAACACCACCTGAAAAGTATGACGACGACGGCATGGACGGCATGGACAACGAGCGGCGGCCACACTT 1220
Query 1407 CCCTCAATTTTCCTACTCTGCAAGTGGACGAGAA 1440
||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1221 CCCTCAGTTCTCCTACTCTGCAAGCGGACGGGAA 1254