Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470267
• Subject: XM_005268157.3
• Aligned Length: 1074
• Identities: 896
• Gaps: 171

Alignment

Query    1  ATGATGGAGAAGTATGAAAAAATTGGGAAAATTGGAGAAGGATCCTATGGAGTTGTTTTCAAATGTAGAAACAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGGAGAAGTATGAAAAAATTGGGAAAATTGGAGAAGGATCCTATGGAGTTGTTTTCAAATGTAGAAACAG  74

Query   75  GGACACGGGTCAGATTGTGGCCATCAAGAAGTTTCNGGAATCAGAAGATGACCCTGTCATAAANNAAANTNNCC  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||..|||.|..||
Sbjct   75  GGACACGGGTCAGATTGTGGCCATCAAGAAGTTTCTGGAATCAGAAGATGACCCTGTCATAAAGAAAATTGCCC  148

Query  149  TTCGGGAAATCCGAATGCTCAAGCAACTCAAGCATCCCAACCTTGTTAACCTNCTGGAAGTCTTCAGGAGGAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTCGGGAAATCCGAATGCTCAAGCAACTCAAGCATCCCAACCTTGTTAACCTCCTGGAAGTCTTCAGGAGGAAA  222

Query  223  CGGAGGCTTCACCTGGTGTTTGAATATTGTGACCACACAGTTCTCCATGAGTTGGACAGATACCAAAGAGGGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGAGGCTTCACCTGGTGTTTGAATATTGTGACCACACAGTTCTCCATGAGTTGGACAGATACCAAAGAGGGGT  296

Query  297  ACCAGAACATCTCGTGAAGAGCATAACTTGGCAGACACTGCAAGCTGTAAATTTTTGCCATAAACACAATTGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACCAGAACATCTCGTGAAGAGCATAACTTGGCAGACACTGCAAGCTGTAAATTTTTGCCATAAACACAATTGCA  370

Query  371  TACATAGAGACGTGAAGCCAGAAAATATCCTCATCACGAAACATTCCGTGATTAAGCTTTGTGACTTTGGATTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TACATAGAGACGTGAAGCCAGAAAATATCCTCATCACGAAACATTCCGTGATTAAGCTTTGTGACTTTGGATTT  444

Query  445  GCTCGGCTTTTGACTGGACCGAGTGACTACTATACAGACTACGTGGCTACCAGGTGGTACCGCTCCCCTGAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTCGGCTTTTGACTGGACCGAGTGACTACTATACAGACTACGTGGCTACCAGGTGGTACCGCTCCCCTGAGCT  518

Query  519  GCTGGTGGGGGACACGCAGTACGGCCCCCCGGTGGATGTTTGGGCAATTGGCTGTGTCTTTGCTGAGCTGCTGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGGTGGGGGACACGCAGTACGGCCCCCCGGTGGATGTTTGGGCAATTGGCTGTGTCTTTGCTGAGCTGCTGT  592

Query  593  CAGGAGTGCCTCTGTGGCCAGGAAAATCGGATGTGGATCAGCTGTATCTGATTAGGAAGACCTTGGGGGATCTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGGAGTGCCTCTGTGGCCAGGAAAATCGGATGTGGATCAGCTGTATCTGATTAGGAAGACCTTGGGGGATCTC  666

Query  667  ATTCCTAGGCACCAGCAAGTGTTTAGCACGAATCAGTACTTCAGTGGAGTGAAAATTCCAGACCCTGAAGATAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTCCTAGGCACCAGCAAGTGTTTAGCACGAATCAGTACTTCAGTGGAGTGAAAATTCCAGACCCTGAAGATAT  740

Query  741  GGAACCACTTGAATTAAAATTCCCAAACATCTCTTATCCTGCCCTGGGGCTCCTA-------------------  795
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct  741  GGAACCACTTGAATTAAAATTCCCAAACATCTCTTATCCTGCCCTGGGGCTCCTAAAGGGCTGTCTCCACATGG  814

Query  796  --------------------------------------------------------------------------  795
                                                                                      
Sbjct  815  ACCCTACTCAAAGGCTGACATGTGAACAGCTGTTGCATCACCCATATTTTGAAAACATCAGAGAAATAGAGGAT  888

Query  796  --------------------------------------------------------------------------  795
                                                                                      
Sbjct  889  TTGGCAAAAGAACACAACAAACCAACAAGGAAGACCCTAAGAAAGAGCCGAAAGCACCACTGCTTTACAGAAAC  962

Query  796  ----AAGTTGCAGTACCTACCCCAGCTAACTGGCAGCAGCATCCTTCCAGCTTTGGATAATAAGAAGTACTACT  865
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATCCAAGTTGCAGTACCTACCCCAGCTAACTGGCAGCAGCATCCTTCCAGCTTTGGATAATAAGAAGTACTACT  1036

Query  866  GTGATACCAAGAAACTTAACTACCGTTTTCCAAACATT  903
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGATACCAAGAAACTTAACTACCGTTTTCCAAACATT  1074