Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470280
• Subject: NM_001163556.1
• Aligned Length: 1389
• Identities: 1133
• Gaps: 189

Alignment

Query    1  ATGGTTCACTCCAGCATGGGGGCTCCAGAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCGAGAAGCAAGGTCTGGA  74
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct    1  ATGGTTCATTCCAGCATGGGGGCTCCAGAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCGAGAAGCAAAGTCTGGA  74

Query   75  CTCCCCATCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCAGACACTAATCATCAGAACCCCCAAAATAAGACCT  148
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.||||||||||||||.|||||..|.|
Sbjct   75  CTCCCCGTCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCCGACATTAACCATCAGAACCCCCAGAATAAAGCGT  148

Query  149  CCCCATTCTCCGTGTCCCCAACTGGCCCCAGTACAAAGATCAAGGCTGAAGACCCCAGTGGCGATTCAGCCCCA  222
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCCATTCTCTGTGTCCCCAACTGGCCCCAGCACCAAGATCAAGGCTGAAGACCCCAGTGGCGATTCAGCCCCA  222

Query  223  GCAGCACCCCTGCCCCCTCAGCCGGCCCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGTTGACGGGCAGCCAGCT  296
            ||||||||||.||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  223  GCAGCACCCCCGCCCCCCCAGCCGGCTCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGCTGACGGGCAGCCAGCT  296

Query  297  AGCTGGGGACATACAGCAGCTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTGCCAGGCCACCACCTCCAGCCACCTG  370
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCTGGGGACATACAGCAACTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTCCCCGGCCACCACCTCCAGCCACCTG  370

Query  371  CTCAGTTCCTGCTACCGCAGGCCCAGCAGAGCCAGCCAGGCCTGCTACCGACACCAAATCTATTCCAGCTACCT  444
            |||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCAGTTCCTGCTGCCACAGGCACAGCAGAGTCAGCCAGGCCTGCTACCAACGCCAAATCTATTCCAGCTACCT  444

Query  445  CAGCAAACCCAGGGAGCTCTTCTGACCTCCCAGCCCCGGGCCGGGCTTCCCACACAGCCCCCCAAATGCTTGGA  518
            ||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  CAACAAACCCAGGGAGCTCTCCTGACCTCCCAGCCCCGGGCTGGGCTTCCTACACAGCCCCCGAAATGCTTGGA  518

Query  519  GCCACCATCCCACCCCGAGGAGCCCAGTGATCTGGAGGAGCTGGAGCAATTCGCCCGCACCTTCAAGCAACGCC  592
            |||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCGCCCTCCCACCCGGAGGAGCCCAGCGATCTGGAGGAGCTGGAACAGTTTGCTCGCACCTTCAAGCAACGCC  592

Query  593  GCATCAAGCTGGGCTTCACGCAGGGTGATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTACGGCAACGACTTCAGCCAG  666
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  593  GCATCAAGCTGGGCTTCACACAGGGTGATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTATGGCAACGACTTCAGCCAA  666

Query  667  ACGACCATTTCCCGCTTCGAGGCCCTCAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGCAAACTCAAGCCCCTCCTGGAGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACGACCATTTCCCGCTTCGAGGCCCTCAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGTAAACTCAAGCCCCTCCTGGAGAA  740

Query  741  GTGGCTCAACGATGCAGAGACTATGTCTGTGGACTCAAGCCTGCCCAGCCCCAACCAGCTGAGCAGCCCCAGCC  814
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTGGCTCAACGACGCAGAGACTATGTCTGTGGATTCAAGCCTACCCAGCCCAAACCAGCTGAGCAGCCCCAGCC  814

Query  815  TGGGTTTCGACGGCCTGCCCGGCCGGAGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACAAACGTCCGCTTCGCCTTA  888
            |||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  815  TGGGTTTCGACGGGCTGCCGGGGCGGAGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACGAATGTCCGCTTCGCCTTA  888

Query  889  GAGAAGAGTTTTCTAGCGAACCAGAAGCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCCGAGCAGCTGCACATGGA  962
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGAAGAGTTTCCTAGCGAACCAGAAGCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCAGAGCAGCTGCACATGGA  962

Query  963  GAAGGAAGTGATCCGCGTCTGGTTCTGCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAACCCCTGCAGTGCGGCCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  GAAGGAAGTGATCCGCGTCTGGTTCTGCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAACCCTTGCAGTGCGGCCC  1036

Query 1037  CCATGCTGCCCAGCCCAGGGAAGCCGGCCAGCTACAGCCCCCATATGGTCACACCCCAAGGGGGCGCGGGGACC  1110
            ||||||||||||||||.||.||||||.|||||||||||||.||..||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037  CCATGCTGCCCAGCCCGGGAAAGCCGACCAGCTACAGCCCTCACCTGGTCACACCCCAAGGGGGCGCAGGGACC  1110

Query 1111  TTACCGTTGTCCCAAGCTTCCAGCAGTCTGAGCA----------------------------------------  1144
            |||||.||||||||||||||.|||||||||||||                                        
Sbjct 1111  TTACCATTGTCCCAAGCTTCTAGCAGTCTGAGCACAACAGTTACTACCTTATCCTCAGCTGTGGGGACGCTCCA  1184

Query 1145  --------------------------------------------------------------------------  1144
                                                                                      
Sbjct 1185  TCCCAGCCGGACAGCAGGAGGGGGTGGGGGTGGGGGCGGAGCTGCGCCCCCCCTCAATTCCATCCCCTCTGTCA  1258

Query 1145  ----------------------CAACAGCACAAACCCCAGCCCTCAAGGCAGCCACTCGGCTATCGGCTTGTCA  1196
                                  |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1259  CTCCCCCACCCCCGGCCACCACCAACAGCACAAACCCGAGCCCTCAAGGCAGCCACTCGGCTATTGGCTTGTCG  1332

Query 1197  GGCC-----------------------------------------------------  1200
            ||||                                                     
Sbjct 1333  GGCCTGAACCCCAGCGCGGGCCCTGGCCTCTGGTGGAACCCTGCCCCTTACCAGCCT  1389