Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470280
• Subject: XM_005259010.4
• Aligned Length: 1758
• Identities: 1200
• Gaps: 558

Alignment

Query    1  ATGGTTCACTCCAGCATGGGGGCTCCAGAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCGAGAAGCAAGGTCTGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTCACTCCAGCATGGGGGCTCCAGAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCGAGAAGCAAGGTCTGGA  74

Query   75  CTCCCCATCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCAGACACTAATCATCAGAACCCCCAAAATAAGACCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCCCCATCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCAGACACTAATCATCAGAACCCCCAAAATAAGACCT  148

Query  149  CCCCATTCTCCGTGTCCCCAACTGGCCCCAGTACAAAGATCAAGGCTGAAGACCCCAGTGGCGATTCAGCCCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCCATTCTCCGTGTCCCCAACTGGCCCCAGTACAAAGATCAAGGCTGAAGACCCCAGTGGCGATTCAGCCCCA  222

Query  223  GCAGCACCCCTGCCCCCTCAGCCGGCCCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGTTGACGGGCAGCCAGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCAGCACCCCTGCCCCCTCAGCCGGCCCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGTTGACGGGCAGCCAGCT  296

Query  297  AGCTGGGGACATACAGCAGCTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTGCCAGGCCACCACCTCCAGCCACCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCTGGGGACATACAGCAGCTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTGCCAGGCCACCACCTCCAGCCACCTG  370

Query  371  CTCAGTTCCTGCTACCGCAGGCCCAGCAGAGCCAGCCAGGCCTGCTACCGACACCAAATCTATTCCAGCTACCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCAGTTCCTGCTACCGCAGGCCCAGCAGAGCCAGCCAGGCCTGCTACCGACACCAAATCTATTCCAGCTACCT  444

Query  445  CAGCAAACCCAGGGAGCTCTTCTGACCTCCCAGCCCCGGGCCGGGCTTCCCACACAGCCCCCCAAATGCTTGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGCAAACCCAGGGAGCTCTTCTGACCTCCCAGCCCCGGGCCGGGCTTCCCACACAGCCCCCCAAATGCTTGGA  518

Query  519  GCCACCATCCCACCCCGAGGAGCCCAGTGATCTGGAGGAGCTGGAGCAATTCGCCCGCACCTTCAAGCAACGCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCACCATCCCACCCCGAGGAGCCCAGTGATCTGGAGGAGCTGGAGCAATTCGCCCGCACCTTCAAGCAACGCC  592

Query  593  GCATCAAGCTGGGCTTCACGCAGGGTGATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTACGGCAACGACTTCAGCCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCATCAAGCTGGGCTTCACGCAGGGTGATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTACGGCAACGACTTCAGCCAG  666

Query  667  ACGACCATTTCCCGCTTCGAGGCCCTCAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGCAAACTCAAGCCCCTCCTGGAGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACGACCATTTCCCGCTTCGAGGCCCTCAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGCAAACTCAAGCCCCTCCTGGAGAA  740

Query  741  GTGGCTCAACGATGCAGAGACTATGTCTGTGGACTCAAGCCTGCCCAGCCCCAACCAGCTGAGCAGCCCCAGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTGGCTCAACGATGCAGAGACTATGTCTGTGGACTCAAGCCTGCCCAGCCCCAACCAGCTGAGCAGCCCCAGCC  814

Query  815  TGGGTTTCGACGGCCTGCCCGGCCGGAGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACAAACGTCCGCTTCGCCTTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGGTTTCGACGGCCTGCCCGGCCGGAGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACAAACGTCCGCTTCGCCTTA  888

Query  889  GAGAAGAGTTTTCTAGCGAACCAGAAGCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCCGAGCAGCTGCACATGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGAAGAGTTTTCTAGCGAACCAGAAGCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCCGAGCAGCTGCACATGGA  962

Query  963  GAAGGAAGTGATCCGCGTCTGGTTCTGCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAACCCCTGCAGTGCGGCCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAGGAAGTGATCCGCGTCTGGTTCTGCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAACCCCTGCAGTGCGGCCC  1036

Query 1037  CCATGCTGCCCAGCCCAGGGAAGCCGGCCAGCTACAGCCCCCATATGGTCACACCCCAAGGGGGCGCGGGGACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCATGCTGCCCAGCCCAGGGAAGCCGGCCAGCTACAGCCCCCATATGGTCACACCCCAAGGGGGCGCGGGGACC  1110

Query 1111  TTACCGTTGTCCCAAGCTTCCAGCAGTCTGAGCA----------------------------------------  1144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct 1111  TTACCGTTGTCCCAAGCTTCCAGCAGTCTGAGCACAACAGTTACTACCTTATCCTCAGCTGTGGGGACGCTCCA  1184

Query 1145  --------------------------------------------------------------------------  1144
                                                                                      
Sbjct 1185  CCCCAGCCGGACAGCTGGAGGGGGTGGGGGCGGGGGCGGGGCTGCGCCCCCCCTCAATTCCATCCCCTCTGTCA  1258

Query 1145  ----------------------CAACAGCACAAACCCCAGCCCTCAAGGCAGCCACTCGGCTATCGGCTTGTCA  1196
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTCCCCCACCCCCGGCCACCACCAACAGCACAAACCCCAGCCCTCAAGGCAGCCACTCGGCTATCGGCTTGTCA  1332

Query 1197  GGCC----------------------------------------------------------------------  1200
            ||||                                                                      
Sbjct 1333  GGCCTGAACCCCAGCACGGGAAGCACAATGGTGGGGTTGAGCTCCGGGCTGAGTCCAGCCCTCATGAGCAACAA  1406

Query 1201  --------------------------------------------------------------------------  1200
                                                                                      
Sbjct 1407  CCCTTTGGCCACTATCCAAGCCCTGGCCTCTGGTGGAACCCTGCCCCTTACCAGCCTTGATGGCAGCGGGAATC  1480

Query 1201  --------------------------------------------------------------------------  1200
                                                                                      
Sbjct 1481  TGGTGCTGGGGGCAGCCGGTGCAGCCCCGGGGAGCCCTGGCCTGGTGACCTCGCCGCTCTTCTTGAATCATGCT  1554

Query 1201  --------------------------------------------------------------------------  1200
                                                                                      
Sbjct 1555  GGGCTGCCCCTGCTCAGCACCCCGCCTGGTGTGGGCCTGGTCTCAGCAGCGGCTGCGGCTGTGGCAGCCTCCAT  1628

Query 1201  --------------------------------------------------------------------------  1200
                                                                                      
Sbjct 1629  CTCCAGCAAGTCTCCTGGCCTCTCCTCCTCATCCTCTTCATCCTCATCCTCCTCCTCCTCCACTTGCAGCGAGA  1702

Query 1201  --------------------------------------------------------  1200
                                                                    
Sbjct 1703  CGGCAGCACAGACCCCTGGAGGTCCAGGGGGGCCCGAGGCAGGGTCCAAACCTGAG  1758