Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470280
• Subject: XM_006539660.3
• Aligned Length: 1471
• Identities: 1124
• Gaps: 278

Alignment

Query    1  ATGGTTCACTC-----CAGC-----------ATGGGGGCTCCAGAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCG  58
            ||||      |     ||||           |||||.||..| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGG------CGAAGACAGCGGCGCCTACCGATGGGAGCAGC-GAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCG  67

Query   59  AGAAGCAAGGTCTGGACTCCCCATCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCAGACACTAATCATCAGAAC  132
            ||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.|||||||||
Sbjct   68  AGAAGCAAAGTCTGGACTCCCCGTCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCCGACATTAACCATCAGAAC  141

Query  133  CCCCAAAATAAGACCTCCCCATTCTCCGTGTCCCCAACTGGCCCCAGTACAA----------------------  184
            |||||.|||||..|.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|                      
Sbjct  142  CCCCAGAATAAAGCGTCCCCATTCTCTGTGTCCCCAACTGGCCCCAGCACCAAGGTGGGCATTCTCTCTGGCCT  215

Query  185  --------------------------------------------AGATCAAGGCTGAAGACCCCAGTGGCGATT  214
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  216  CCACTTAACATTCTGGGGTCCCGGACCCTGCCTCTCTCCTCCCCAGATCAAGGCTGAAGACCCCAGTGGCGATT  289

Query  215  CAGCCCCAGCAGCACCCCTGCCCCCTCAGCCGGCCCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGTTGACGGGC  288
            ||||||||||||||||||.||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  290  CAGCCCCAGCAGCACCCCCGCCCCCCCAGCCGGCTCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGCTGACGGGC  363

Query  289  AGCCAGCTAGCTGGGGACATACAGCAGCTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTGCCAGGCCACCACCTCCA  362
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  364  AGCCAGCTAGCTGGGGACATACAGCAACTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTCCCCGGCCACCACCTCCA  437

Query  363  GCCACCTGCTCAGTTCCTGCTACCGCAGGCCCAGCAGAGCCAGCCAGGCCTGCTACCGACACCAAATCTATTCC  436
            |||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  438  GCCACCTGCTCAGTTCCTGCTGCCACAGGCACAGCAGAGTCAGCCAGGCCTGCTACCAACGCCAAATCTATTCC  511

Query  437  AGCTACCTCAGCAAACCCAGGGAGCTCTTCTGACCTCCCAGCCCCGGGCCGGGCTTCCCACACAGCCCCCCAAA  510
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  512  AGCTACCTCAACAAACCCAGGGAGCTCTCCTGACCTCCCAGCCCCGGGCTGGGCTTCCTACACAGCCCCCGAAA  585

Query  511  TGCTTGGAGCCACCATCCCACCCCGAGGAGCCCAGTGATCTGGAGGAGCTGGAGCAATTCGCCCGCACCTTCAA  584
            |||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct  586  TGCTTGGAGCCGCCCTCCCACCCGGAGGAGCCCAGCGATCTGGAGGAGCTGGAACAGTTTGCTCGCACCTTCAA  659

Query  585  GCAACGCCGCATCAAGCTGGGCTTCACGCAGGGTGATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTACGGCAACGACT  658
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  660  GCAACGCCGCATCAAGCTGGGCTTCACACAGGGTGATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTATGGCAACGACT  733

Query  659  TCAGCCAGACGACCATTTCCCGCTTCGAGGCCCTCAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGCAAACTCAAGCCCCTC  732
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  734  TCAGCCAAACGACCATTTCCCGCTTCGAGGCCCTCAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGTAAACTCAAGCCCCTC  807

Query  733  CTGGAGAAGTGGCTCAACGATGCAGAGACTATGTCTGTGGACTCAAGCCTGCCCAGCCCCAACCAGCTGAGCAG  806
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  808  CTGGAGAAGTGGCTCAACGACGCAGAGACTATGTCTGTGGATTCAAGCCTACCCAGCCCAAACCAGCTGAGCAG  881

Query  807  CCCCAGCCTGGGTTTCGACGGCCTGCCCGGCCGGAGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACAAACGTCCGCT  880
            |||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  882  CCCCAGCCTGGGTTTCGACGGGCTGCCGGGGCGGAGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACGAATGTCCGCT  955

Query  881  TCGCCTTAGAGAAGAGTTTTCTAGCGAACCAGAAGCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCCGAGCAGCTG  954
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  956  TCGCCTTAGAGAAGAGTTTCCTAGCGAACCAGAAGCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCAGAGCAGCTG  1029

Query  955  CACATGGAGAAGGAAGTGATCCGCGTCTGGTTCTGCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAACCCCTGCAG  1028
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1030  CACATGGAGAAGGAAGTGATCCGCGTCTGGTTCTGCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAACCCTTGCAG  1103

Query 1029  TGCGGCCCCCATGCTGCCCAGCCCAGGGAAGCCGGCCAGCTACAGCCCCCATATGGTCACACCCCAAGGGGGCG  1102
            ||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||||||||||||.||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 1104  TGCGGCCCCCATGCTGCCCAGCCCGGGAAAGCCGACCAGCTACAGCCCTCACCTGGTCACACCCCAAGGGGGCG  1177

Query 1103  CGGGGACCTTACCGTTGTCCCAAGCTTCCAGCAGTCTGAGCA--------------------------------  1144
            |.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||                                
Sbjct 1178  CAGGGACCTTACCATTGTCCCAAGCTTCTAGCAGTCTGAGCACAACAGTTACTACCTTATCCTCAGCTGTGGGG  1251

Query 1145  --------------------------------------------------------------------------  1144
                                                                                      
Sbjct 1252  ACGCTCCATCCCAGCCGGACAGCAGGAGGGGGTGGGGGTGGGGGCGGAGCTGCGCCCCCCCTCAATTCCATCCC  1325

Query 1145  ------------------------------CAACAGCACAAACCCCAGCCCTCAAGGCAGCCACTCGGCTATCG  1188
                                          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1326  CTCTGTCACTCCCCCACCCCCGGCCACCACCAACAGCACAAACCCGAGCCCTCAAGGCAGCCACTCGGCTATTG  1399

Query 1189  GCTTGTCAGGCC-----------------------------------------------------  1200
            |||||||.||||                                                     
Sbjct 1400  GCTTGTCGGGCCTGAACCCCAGCGCGGGCCCTGGCCTCTGGTGGAACCCTGCCCCTTACCAGCCT  1464