Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470280
• Subject: XM_006539662.3
• Aligned Length: 1405
• Identities: 1124
• Gaps: 212

Alignment

Query    1  ATGGTTCACTC-----CAGC-----------ATGGGGGCTCCAGAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCG  58
            ||||      |     ||||           |||||.||..| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGG------CGAAGACAGCGGCGCCTACCGATGGGAGCAGC-GAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCG  67

Query   59  AGAAGCAAGGTCTGGACTCCCCATCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCAGACACTAATCATCAGAAC  132
            ||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.|||||||||
Sbjct   68  AGAAGCAAAGTCTGGACTCCCCGTCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCCGACATTAACCATCAGAAC  141

Query  133  CCCCAAAATAAGACCTCCCCATTCTCCGTGTCCCCAACTGGCCCCAGTACAAAGATCAAGGCTGAAGACCCCAG  206
            |||||.|||||..|.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  142  CCCCAGAATAAAGCGTCCCCATTCTCTGTGTCCCCAACTGGCCCCAGCACCAAGATCAAGGCTGAAGACCCCAG  215

Query  207  TGGCGATTCAGCCCCAGCAGCACCCCTGCCCCCTCAGCCGGCCCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGT  280
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  216  TGGCGATTCAGCCCCAGCAGCACCCCCGCCCCCCCAGCCGGCTCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGC  289

Query  281  TGACGGGCAGCCAGCTAGCTGGGGACATACAGCAGCTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTGCCAGGCCAC  354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  290  TGACGGGCAGCCAGCTAGCTGGGGACATACAGCAACTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTCCCCGGCCAC  363

Query  355  CACCTCCAGCCACCTGCTCAGTTCCTGCTACCGCAGGCCCAGCAGAGCCAGCCAGGCCTGCTACCGACACCAAA  428
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  364  CACCTCCAGCCACCTGCTCAGTTCCTGCTGCCACAGGCACAGCAGAGTCAGCCAGGCCTGCTACCAACGCCAAA  437

Query  429  TCTATTCCAGCTACCTCAGCAAACCCAGGGAGCTCTTCTGACCTCCCAGCCCCGGGCCGGGCTTCCCACACAGC  502
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  438  TCTATTCCAGCTACCTCAACAAACCCAGGGAGCTCTCCTGACCTCCCAGCCCCGGGCTGGGCTTCCTACACAGC  511

Query  503  CCCCCAAATGCTTGGAGCCACCATCCCACCCCGAGGAGCCCAGTGATCTGGAGGAGCTGGAGCAATTCGCCCGC  576
            ||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  512  CCCCGAAATGCTTGGAGCCGCCCTCCCACCCGGAGGAGCCCAGCGATCTGGAGGAGCTGGAACAGTTTGCTCGC  585

Query  577  ACCTTCAAGCAACGCCGCATCAAGCTGGGCTTCACGCAGGGTGATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTACGG  650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  586  ACCTTCAAGCAACGCCGCATCAAGCTGGGCTTCACACAGGGTGATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTATGG  659

Query  651  CAACGACTTCAGCCAGACGACCATTTCCCGCTTCGAGGCCCTCAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGCAAACTCA  724
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  660  CAACGACTTCAGCCAAACGACCATTTCCCGCTTCGAGGCCCTCAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGTAAACTCA  733

Query  725  AGCCCCTCCTGGAGAAGTGGCTCAACGATGCAGAGACTATGTCTGTGGACTCAAGCCTGCCCAGCCCCAACCAG  798
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  734  AGCCCCTCCTGGAGAAGTGGCTCAACGACGCAGAGACTATGTCTGTGGATTCAAGCCTACCCAGCCCAAACCAG  807

Query  799  CTGAGCAGCCCCAGCCTGGGTTTCGACGGCCTGCCCGGCCGGAGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACAAA  872
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  808  CTGAGCAGCCCCAGCCTGGGTTTCGACGGGCTGCCGGGGCGGAGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACGAA  881

Query  873  CGTCCGCTTCGCCTTAGAGAAGAGTTTTCTAGCGAACCAGAAGCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCCG  946
            .||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  882  TGTCCGCTTCGCCTTAGAGAAGAGTTTCCTAGCGAACCAGAAGCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCAG  955

Query  947  AGCAGCTGCACATGGAGAAGGAAGTGATCCGCGTCTGGTTCTGCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAAC  1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956  AGCAGCTGCACATGGAGAAGGAAGTGATCCGCGTCTGGTTCTGCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAAC  1029

Query 1021  CCCTGCAGTGCGGCCCCCATGCTGCCCAGCCCAGGGAAGCCGGCCAGCTACAGCCCCCATATGGTCACACCCCA  1094
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||||||||||||.||..|||||||||||||
Sbjct 1030  CCTTGCAGTGCGGCCCCCATGCTGCCCAGCCCGGGAAAGCCGACCAGCTACAGCCCTCACCTGGTCACACCCCA  1103

Query 1095  AGGGGGCGCGGGGACCTTACCGTTGTCCCAAGCTTCCAGCAGTCTGAGCA------------------------  1144
            |||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||                        
Sbjct 1104  AGGGGGCGCAGGGACCTTACCATTGTCCCAAGCTTCTAGCAGTCTGAGCACAACAGTTACTACCTTATCCTCAG  1177

Query 1145  --------------------------------------------------------------------------  1144
                                                                                      
Sbjct 1178  CTGTGGGGACGCTCCATCCCAGCCGGACAGCAGGAGGGGGTGGGGGTGGGGGCGGAGCTGCGCCCCCCCTCAAT  1251

Query 1145  --------------------------------------CAACAGCACAAACCCCAGCCCTCAAGGCAGCCACTC  1180
                                                  |||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1252  TCCATCCCCTCTGTCACTCCCCCACCCCCGGCCACCACCAACAGCACAAACCCGAGCCCTCAAGGCAGCCACTC  1325

Query 1181  GGCTATCGGCTTGTCAGGCC-----------------------------------------------------  1200
            ||||||.||||||||.||||                                                     
Sbjct 1326  GGCTATTGGCTTGTCGGGCCTGAACCCCAGCGCGGGCCCTGGCCTCTGGTGGAACCCTGCCCCTTACCAGCCT  1398