Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470281
- Subject:
- XM_017004418.1
- Aligned Length:
- 1863
- Identities:
- 1484
- Gaps:
- 372
Alignment
Query 1 ATGATTGCTAAAGACAAAGACACGCTTGACTTCATTCGGAACTTGTGCCAGAAGAGACATGTTTGTATCCAGTC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ATCTCTGGCAAAAGTATCCTCAAAAAAGGTAAATGAGAAAGATGTTGATAAGTTTCTGCTCTACCAGCATTTTT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCTGCAACATAAGAAACATTCACCATCATCAGATTCTGGCAATTAACCGTGGAGAAAATTTGAAGGTACTGACG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GTTAAGGTCAATATTTCTGATGGAGTGAAGGATGAATTCTGTAGGTGGTGCATCCAAAACAGGTGGAGACCACG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TAGCTTTGCAAGGCCAGAGTTAATGAAGATCTTATATAATTCACTGAATGATTCCTTTAAACGCCTTATTTATC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------ATGAAGATCTTATATAATTCACTGAATGATTCCTTTAAACGCCTTATTTATC 52
Query 371 CTCTTCTCTGTAGAGAATTCAGAGCCAAACTAACATCAGATGCAGAGAAGGAATCAGTAATGATGTTTGGACGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 CTCTTCTCTGTAGAGAATTCAGAGCCAAACTAACATCAGATGCAGAGAAGGAATCAGTAATGATGTTTGGACGG 126
Query 445 AACCTTCGTCAGCTCCTTTTAACAAGCCCTGTTCCAGGGCGCACCTTAATGGGAGTGGATCCTGGTTATAAACA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127 AACCTTCGTCAGCTCCTTTTAACAAGCCCTGTTCCAGGGCGCACCTTAATGGGAGTGGATCCTGGTTATAAACA 200
Query 519 TGGTTGCAAATTAGCTATAATTTCTCCTACTAGTCAGATACTTCATACTGATGTGGTTTACTTGCATTGTGGAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 TGGTTGCAAATTAGCTATAATTTCTCCTACTAGTCAGATACTTCATACTGATGTGGTTTACTTGCATTGTGGAC 274
Query 593 AAGGCTTCCGAGAGGCGGAGAAAATAAAGACACTTTTGCTGAATTTCAACTGCAGCACAGTAGTGATTGGAAAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 275 AAGGCTTCCGAGAGGCGGAGAAAATAAAGACACTTTTGCTGAATTTCAACTGCAGCACAGTAGTGATTGGAAAT 348
Query 667 GGAACTGCCTGCAGGGAAACAGAAGCTTACTTTGCTGACCTGATAATGAAGAATTATTTTGCACCACTGGATGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 GGAACTGCCTGCAGGGAAACAGAAGCTTACTTTGCTGACCTGATAATGAAGAATTATTTTGCACCACTGGATGT 422
Query 741 TGTTTACTGTATCGTCAGTGAAGCAGGAGC-ATCAATC--TACAGTGTCAGCCCTGAAGCTAACAAAGAGATGC 811
||||||||| |..|||||| | ||.|||| |||..| |||| |||..||| ||
Sbjct 423 TGTTTACTG------CTTTGAAGC-----CTATGAATCATTACCCT-TCAG----------AACTGAGA---GC 471
Query 812 CAGGGCTGGACCCTAATTTGAGAAGTGCAGTTTCCATAGCAAGGCGTGTACAAGATCCATTAGCTGAGCTAGTG 885
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472 CA--------------------------AGTTTCCATAGCAAGGCGTGTACAAGATCCATTAGCTGAGCTAGTG 519
Query 886 AAAATTGAGCCAAAGCACATTGGAGTTGGAATGTATCAGCATGACGTATCCCAGACTTTACTCAAGGCAACACT 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 520 AAAATTGAGCCAAAGCACATTGGAGTTGGAATGTATCAGCATGACGTATCCCAGACTTTACTCAAGGCAACACT 593
Query 960 GGACAGTGTTGTAGAAGAATGTGTCAGCTTTGTGGGAGTGGATATTAACATCTGTTCAGAAGTTTTGTTAAGGC 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 594 GGACAGTGTTGTAGAAGAATGTGTCAGCTTTGTGGGAGTGGATATTAACATCTGTTCAGAAGTTTTGTTAAGGC 667
Query 1034 ATATTGCAGGACTCAATGCCAACAGGGCCAAAAATATTATTGAATGGCGAGAGAAAAATGGACCCTTTATCAAC 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 668 ATATTGCAGGACTCAATGCCAACAGGGCCAAAAATATTATTGAATGGCGAGAGAAAAATGGACCCTTTATCAAC 741
Query 1108 CGAGAACAGCTGAAGAAAGTGAAAGGGCTGGGCCCAAAATCCTTCCAACAGTGTGCTGGCTTCATCAGAATCAA 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 742 CGAGAACAGCTGAAGAAAGTGAAAGGGCTGGGCCCAAAATCCTTCCAACAGTGTGCTGGCTTCATCAGAATCAA 815
Query 1182 CCAGGATTATATCCGAACGTTTTGCAGTCAGCAAACTGAAACTTCAGGCCAAATTCAAGGAGTTGCTGTGACAT 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 816 CCAGGATTATATCCGAACGTTTTGCAGTCAGCAAACTGAAACTTCAGGCCAAATTCAAGGAGTTGCTGTGACAT 889
Query 1256 CTTCAGCAGACGTTGAGGTCACAAATGAGAAGCAGGGCAAAAAGAAGAGCAAAACTGCAGTGAATGTTTTACTG 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 890 CTTCAGCAGACGTTGAGGTCACAAATGAGAAGCAGGGCAAAAAGAAGAGCAAAACTGCAGTGAATGTTTTACTG 963
Query 1330 AAGCCAAATCCTTTGGACCAAACTTGTATTCATCCAGAATCATATGACATAGCAATGAGGTTTTTGTCATCCAT 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 964 AAGCCAAATCCTTTGGACCAAACTTGTATTCATCCAGAATCATATGACATAGCAATGAGGTTTTTGTCATCCAT 1037
Query 1404 TGGAGGGACACTGTATGAGGTTGGAAAGCCTGAAATGCAACAAAAAATAAATTCATTCCTTGAAAAGGAAGGAA 1477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1038 TGGAGGGACACTGTATGAGGTTGGAAAGCCTGAAATGCAACAAAAAATAAATTCATTCCTTGAAAAGGAAGGAA 1111
Query 1478 TGGAGAAAATTGCAGAAAGATTGCAAACAACAGTACACACCTTACAGGTCATCATAGATGGTCTCAGCCAGCCT 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1112 TGGAGAAAATTGCAGAAAGATTGCAAACAACAGTACACACCTTACAGGTCATCATAGATGGTCTCAGCCAGCCT 1185
Query 1552 GAAAGCTTTGACTTTCGAACAGATTTTGATAAACCTGATTTCAAGAGAAGCATAGTATGCCTGGAAGATCTGCA 1625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1186 GAAAGCTTTGACTTTCGAACAGATTTTGATAAACCTGATTTCAAGAGAAGCATAGTATGCCTGGAAGATCTGCA 1259
Query 1626 GATTGGGACAGTTCTTACAGGCAAAGTTGAGAATGCCACTCTCTTTGGAATTTTTGTGGATATAGGAGTGGGGA 1699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 GATTGGGACAGTTCTTACAGGCAAAGTTGAGAATGCCACTCTCTTTGGAATTTTTGTGGATATAGGAGTGGGGA 1333
Query 1700 AATCTGGGCTGATTCCCATACGAAATGTAACAGAAGCAAAACTTTCAAAAACAAAGAAGAGAAGAAGCCTTGGA 1773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1334 AATCTGGGCTGATTCCCATACGAAATGTAACAGAAGCAAAACTTTCAAAAACAAAGAAGAGAAGAAGCCTTGGA 1407
Query 1774 CTGGGCCCCGGAGAAAGAGTGGAAGTCCAAGTACTCAACATTGACATCCCCCGATCTAGGATTACTCTGGACCT 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1408 CTGGGCCCCGGAGAAAGAGTGGAAGTCCAAGTACTCAACATTGACATCCCCCGATCTAGGATTACTCTGGACCT 1481
Query 1848 CATTCGGGTGTTA 1860
|||||||||||||
Sbjct 1482 CATTCGGGTGTTA 1494