Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470293
- Subject:
- NM_001321815.1
- Aligned Length:
- 1164
- Identities:
- 970
- Gaps:
- 180
Alignment
Query 1 ATGGGTAGCAAGAAACTAAAACGAGTGGGTTTATCACAAGAGCTGTGTGACCGTCTGAGTAGACATCAGATCCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TACCTGTCAGGACTTTTTATGTCTTTCCCCACTGGAGCTTATGAAGGTGACTGGTCTGAGTTATCGAGGTGTCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------------------------ATGAAGGTGACTGGTCTGAGTTATCGAGGTGTCC 34
Query 149 ATGAACTTCTATGTATGGTCAGCAGGGCCTGTGCCCCAAAGATGCAAACGGCTTATGGGATAAAAGCACAAAGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 35 ATGAACTTCTATGTATGGTCAGCAGGGCCTGTGCCCCAAAGATGCAAACGGCTTATGGGATAAAAGCACAAAGG 108
Query 223 TCTGCTGATTTCTCACCAGCATTCTTATCTACTACCCTTTCTGCTTTGGACGAAGCCCTGCATGGTGGTGTGGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 TCTGCTGATTTCTCACCAGCATTCTTATCTACTACCCTTTCTGCTTTGGACGAAGCCCTGCATGGTGGTGTGGC 182
Query 297 TTGTGGATCCCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGTGGAAAAACTCAGTTTTGTATAATGATGAGCATTT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183 TTGTGGATCCCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGTGGAAAAACTCAGTTTTGTATAATGATGAGCATTT 256
Query 371 TGGCTACATTACCCACCAACATGGGAGGATTAGAAGGAGCTGTGGTGTACATTGACACAGAGTCTGCATTTAGT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 257 TGGCTACATTACCCACCAACATGGGAGGATTAGAAGGAGCTGTGGTGTACATTGACACAGAGTCTGCATTTAGT 330
Query 445 GCTGAAAGACTGGTTGAAATAGCAGAATCCCGTTTTCCCAGATATTTTAACACTGAAGAAAAGTTACTTTTGAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 331 GCTGAAAGACTGGTTGAAATAGCAGAATCCCGTTTTCCCAGATATTTTAACACTGAAGAAAAGTTACTTTTGAC 404
Query 519 AAGTAGTAAAGTTCATCTTTATCGGGAACTCACCTGTGATGAAGTTCTACAAAGGATTGAATCTTTGGAAGAAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 405 AAGTAGTAAAGTTCATCTTTATCGGGAACTCACCTGTGATGAAGTTCTACAAAGGATTGAATCTTTGGAAGAAG 478
Query 593 AAATTATCTCAAAAGGAATTAAACTTGTGATTCTTGACTCTGTTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGATGCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 AAATTATCTCAAAAGGAATTAAACTTGTGATTCTTGACTCTGTTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGATGCA 552
Query 667 CAACTTCAAGGCAATCTCAAAGAAAGAAACAAGTTCTTGGCAAGAGAGGCATCCTCCTTGAAGTATTTGGCTGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 553 CAACTTCAAGGCAATCTCAAAGAAAGAAACAAGTTCTTGGCAAGAGAGGCATCCTCCTTGAAGTATTTGGCTGA 626
Query 741 GGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAGATTACAACCCATCTGAGTGGAGCCCTGGCTTCTCAGGCAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 627 GGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAGATTACAACCCATCTGAGTGGAGCCCTGGCTTCTCAGGCAG 700
Query 815 ACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAGGCACTTCTGGATCCAGCTGTGTGATAGCCGCACTA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 701 ACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAGGCACTTCTGGATCCAGCTGTGTGATAGCCGCACTA 774
Query 889 GGAAATACCTGGAGTCACAGTGTGAATACCCGGCTGATCCTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGACAGATTCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 GGAAATACCTGGAGTCACAGTGTGAATACCCGGCTGATCCTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGACAGATTCT 848
Query 963 TATTGCCAAGTCCCCTCTGGCTCCCTTCACCTCATTTGTCTACACCATCAAGGAGGAAGGCCTGGTTCTTCAAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 849 TATTGCCAAGTCCCCTCTGGCTCCCTTCACCTCATTTGTCTACACCATCAAGGAGGAAGGCCTGGTTCTTCAAG 922
Query 1037 AGACAACATTTTGCTCTGTCACCCAAGCTGAACTGAACTGGGCTCCAGAAATCCTC---CCACCTCAGCCTC-- 1105
| ||.|||.||||| ||||| .|..|||..||||
Sbjct 923 A---------------------------TGCACTCAACTG-----------TCCTCTCTTCTGCTCTTCCTCCT 958
Query 1106 -----CTGAGCAGCTAGGACTACAGATGTGCCACCATACCCAGCTAATTTTT-- 1152
|||.|||.|| |||.| |||| ||..|| |.|||.
Sbjct 959 ACAAACTGGGCAACT-GGAAT-CAGA-----------ACAGAG---ACTTTGGA 996