Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470293
• Subject: NM_009014.3
• Aligned Length: 1162
• Identities: 902
• Gaps: 122

Alignment

Query    1  ATGGGTAGCAAGAAACTAAAACGAGTGGGTTTATCACAAGAGCTGTGTGACCGTCTGAGTAGACATCAGATCCT  74
            |||.|.|||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||.|.||.|||.|.|||||..|
Sbjct    1  ATGAGCAGCAAGAAACTAAGACGAGTGGGTTTATCTCCAGAGCTGTGTGACCGTTTAAGCAGATACCAGATTGT  74

Query   75  TACCTGTCAGGACTTTTTATGTCTTTCCCCACTGGAGCTTATGAAGGTGACTGGTCTGAGTTATCGAGGTGTCC  148
            ||.|||||||.||||||||.||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||..|||||||||
Sbjct   75  TAACTGTCAGCACTTTTTAAGTCTCTCCCCACTAGAACTTATGAAAGTGACTGGCCTGAGTTACAGAGGTGTCC  148

Query  149  ATGAACTTCTATGTATGGTCAGCAGGGCCTGTGCCCCAAAGATGCAAACGGCTTATGGGATAAAAGCACAAAGG  222
            |.||.|||||...||..||.||||.||||||||||||..||||||||||||||||||.|.||||..|||.||||
Sbjct  149  ACGAGCTTCTTCATACAGTAAGCAAGGCCTGTGCCCCGCAGATGCAAACGGCTTATGAGTTAAAGACACGAAGG  222

Query  223  TCTGCTGATTTCTCACCAGCATTCTTATCTACTACCCTTTCTGCTTTGGACGAAGCCCTGCATGGTGGTGTGGC  296
            |||||..||.|||||||.||||||.|.|||||||||||.|..||.|||||.|||||..||||.|||||||||.|
Sbjct  223  TCTGCACATCTCTCACCGGCATTCCTGTCTACTACCCTGTGCGCCTTGGATGAAGCATTGCACGGTGGTGTGCC  296

Query  297  TTGTGGATCCCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGTGGAAAAACTCAGTTTTGTATAATGATGAGCATTT  370
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||..|.|
Sbjct  297  TTGTGGATCTCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGCGGAAAAACTCAGTTTTGCATAATGATGAGTGTCT  370

Query  371  TGGCTACATTACCCACCAACATGGGAGGATTAGAAGGAGCTGTGGTGTACATTGACACAGAGTCTGCATTTAGT  444
            |.|||||||||||.||||.|.||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||.|
Sbjct  371  TAGCTACATTACCTACCAGCCTGGGAGGATTAGAAGGGGCTGTGGTCTACATCGACACAGAGTCTGCATTTACT  444

Query  445  GCTGAAAGACTGGTTGAAATAGCAGAATCCCGTTTTCC-CAGATATTTTAACACTGAAGAAAAGTTACTTTTGA  517
            |||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||| || |||||||||||||||.|||||.||.|||.|||
Sbjct  445  GCTGAGAGACTGGTTGAGATTGCGGAATCTCGTTTTCCACA-ATATTTTAACACTGAGGAAAAATTGCTTCTGA  517

Query  518  CAAGTAGTAAAGTTCATCTTTATCGGGAACTCACCTGTGATGAAGTTCTACAAAGGATTGAATCTTTGGAAGAA  591
            |.||.||||.|||||||||||..||.||.|||||||||||.|...|||||||||||.||||.||||||||.|||
Sbjct  518  CCAGCAGTAGAGTTCATCTTTGCCGAGAGCTCACCTGTGAGGGGCTTCTACAAAGGCTTGAGTCTTTGGAGGAA  591

Query  592  GAAATTATCTCAAAAGGAATTAAACTTGTGATTCTTGACTCTGTTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGATGC  665
            ||.||.||.||.||||||.||||.|||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct  592  GAGATCATTTCGAAAGGAGTTAAGCTTGTGATTGTTGACTCCATTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGACCC  665

Query  666  ACAACTTCAAGGCAATCTCAAAGAAAGAAACAAGTTCTT-GGCAAGAGAGGCATCCTCCTTGAAGTATTTGGCT  738
            ..|.|||||||||||..||||||||||.||||||||||| ||||| ||..||.||||...|||||||..||||.
Sbjct  666  GAAGCTTCAAGGCAACATCAAAGAAAGGAACAAGTTCTTGGGCAA-AGGAGCGTCCTTACTGAAGTACCTGGCA  738

Query  739  GAGGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAGATTACAACCCATCTGAGTGGAGCCCTGGCTTCTCAGGC  812
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||..|||||||.||
Sbjct  739  GGGGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAAATTACGACCCATCTGAGTGGAGCCCTCCCTTCTCAAGC  812

Query  813  AGACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAGGCACTTCTGGATCCAGCTGTGTGATAGCCGCAC  886
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.||||
Sbjct  813  AGACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAGGCACTTCTGGATCCAGCTGTTTGGTAGCTGCAC  886

Query  887  TAGGAAATACCTGGAGTCACAGTGTGAATACCCGGCTGATCCTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGACAGATT  960
            |||||||.||.|||.|||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  887  TAGGAAACACATGGGGTCACTGTGTGAACACCCGGCTGATTCTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGGCAGATT  960

Query  961  CTTATTGCCAAGTCCCCTCTGGCTCCCTTCACCTCATTTGTCTACACCATCAAGGAGGAAGGCCTGGTTCTTCA  1034
            ||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  961  CTCATTGCCAAGTCTCCTCTGGCTGCCTTCACCTCCTTTGTCTACACCATCAAGGGGGAAGGCCTGGTTCTTCA  1034

Query 1035  AG--------AGACAACATTTTGCTCTGTCACCCAAGCTGAACTGAACTGGGCTCCAGAAATCCTCCCACCTCA  1100
            ||        ||||.|                                                          
Sbjct 1035  AGGCCACGAAAGACCA----------------------------------------------------------  1050

Query 1101  GCCTCCTGAGCAGCTAGGACTACAGATGTGCCACCATACCCAGCTAATTTTT  1152
                                                                
Sbjct 1051  ----------------------------------------------------  1050