Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470297
• Subject: XM_006509539.1
• Aligned Length: 2274
• Identities: 1647
• Gaps: 345

Alignment

Query    1  ATGGTCCCCGACACCGCCTGCGTTCTTCTGCTCACCCTGGCTGCCCTCGGCGCGTCCGGACAGGGCCAGAGCCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTTGGGCTCAGACCTGGGCCCGCAGATGCTTCGGGAACTGCAGGAAACCAACGCGGCGCTGCAGGACGTGCGGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGCTGCTGCGGCAGCAGGTCAGGGAGATCACGTTCCTGAAAAACACGGTGATGGAGTGTGACGCGTGCGGGATG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CAGCAGTCAGTACGCACCGGCCTACCCAGCGTGCGGCCCCTGCTCCACTGCGCGCCCGGCTTCTGC-TTCCCCG  295
                                                   .|| ||.|              ||||| |||    
Sbjct    1  ---------------------------------------ATG-TCAA--------------TCTGCATTC----  16

Query  296  GCGTGGCCTGCATCCAGACGGAGAGCGGCGCGCGCTGCGGCCCCTGCCCCGCGGGCTTCACGGGCAACGGCTCG  369
                  .||||||..||                  |.||..|||.||                           
Sbjct   17  ------TCTGCATTGAG------------------TTCGAGCCCAGC---------------------------  39

Query  370  CACTGCACCGACGTCAACGAGTGCAACGCCCACCCCTGCTTCCCCCGAGTCCGCTGTATCAACACCAGCCCGGG  443
              |||       ||..||..||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct   40  --CTG-------GTATACATGTGCAATGCTCACCCCTGTTTCCCGCGGGTGCGGTGCATCAATACCAGCCCTGG  104

Query  444  GTTCCGCTGCGAGGCTTGCCCGCCGGGGTACAGCGGCCCCACCCACCAGGGCGTGGGGCTGGCTTTCGCCAAGG  517
            .||.|.||||||.||.||.||.||.||||.||||||.|||||||||.||||||||||.|||.|.|||||.|||.
Sbjct  105  CTTTCACTGCGAAGCCTGTCCCCCTGGGTTCAGCGGACCCACCCACGAGGGCGTGGGACTGACCTTCGCTAAGT  178

Query  518  CCAACAAGCAGGTTTGCACGGACATCAACGAGTGTGAGACCGGGCAACATAACTGCGTCCCCAACTCCGTGTGC  591
            |||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  179  CCAACAAACAAGTTTGCACGGATATTAATGAGTGTGAGACCGGGCAGCACAATTGCGTTCCCAACTCCGTGTGC  252

Query  592  ATCAACACCCGGGGCTCCTTCCAGTGCGGCCCGTGCCAGCCCGGCTTCGTGGGCGACCAGGCGTCCGGCTGCCA  665
            .|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||||||||
Sbjct  253  GTCAACACCCGGGGCTCCTTCCAGTGCGGCCCCTGCCAGCCCGGTTTCGTGGGCGACCAGACGTCAGGCTGCCA  326

Query  666  GCGGCGCGCACAGCGCTTCTGCCCCGACGGCTCGCCCAGCGAGTGCCACGAGCATGCAGACTGCGTCCTAGAGC  739
            ||||||.|..||||.||||||||||||.||.||.||||||..||||||.|||.|.|||.||||||||||.||||
Sbjct  327  GCGGCGTGGGCAGCACTTCTGCCCCGATGGGTCACCCAGCCCGTGCCATGAGAAAGCAAACTGCGTCCTGGAGC  400

Query  740  GCGATGGCTCGCGGTCGTGCGTGTGTGCCGTTGGCTGGGCCGGCAACGGGATCCTCTGTGGTCGCGACACTGAC  813
            |.|||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.||.||.||||||||.|||
Sbjct  401  GGGATGGCTCGAGGTCTTGCGTGTGTGCAGTTGGCTGGGCCGGCAACGGGCTCCTGTGCGGCCGCGACACGGAC  474

Query  814  CTAGACGGCTTCCCGGACGAGAAGCTGCGCTGCCCGGAGCGCCAGTGCCGTAAGGACAACTGCGTGACTGTGCC  887
            ||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  475  CTGGACGGTTTTCCTGACGAGAAGCTTCGCTGCTCAGAGCGCCAGTGTCGCAAGGACAACTGCGTGACGGTGCC  548

Query  888  CAACTCAGGGCAGGAGGATGTGGACCGCGATGGCATCGGAGACGCCTGCGATCCGGATGCCGACGGGGACGGGG  961
            |||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.||.|
Sbjct  549  CAATTCGGGGCAGGAGGATGTGGACCGGGACGGCATCGGAGATGCTTGTGACCCGGATGCGGACGGGGATGGAG  622

Query  962  TCCCCAATGAAAAGGACAACTGCCCGCTGGTGCGGAACCCAGACCAGCGCAACACGGACGAG-GACAAGTGGGG  1034
            ||||.||.||..|.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||| || ||.||||||||
Sbjct  623  TCCCTAACGAGCAAGACAATTGCCCGCTGGTTCGAAACCCAGACCAGCGTAACTCGGAC-AGTGATAAGTGGGG  695

Query 1035  CGATGCGTGCGACAACTGCCGGTCCCAGAAGAACGACGACCAAAAGGACACAGACCAGGACGGCCGGGGCGATG  1108
            .|||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||.||.||.|||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  696  AGATGCCTGCGACAACTGCCGGTCCAAGAAGAATGACGATCAGAAAGATACAGACCTGGATGGCCGGGGCGATG  769

Query 1109  CGTGCGACGACGACATCGACGGCGACCGGATCCGCAACCAGGCCGACAACTGCCCTAGGGTACCCAACTCAGAC  1182
            |.||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||....||.||||||||.||..||||.|||||||..|||
Sbjct  770  CCTGCGACGACGACATAGATGGCGACCGAATACGAAATGTAGCTGACAACTGTCCCCGGGTGCCCAACTTTGAC  843

Query 1183  CAGAAGGACAGTGATGGCGATGGTATAGGGGATGCCTGTGACAACTGTCCCCAGAAGAG-CAACCCGGATCAGG  1255
            ||||..|||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||| || .|||||.||.|||.
Sbjct  844  CAGAGTGACAGTGATGGTGATGGTGTTGGGGATGCCTGTGACAACTGTCCCCAGAA-AGATAACCCAGACCAGA  916

Query 1256  CGGATGTGGACCACGACTTTGTGGGAGATGCTTGTGACAGCGATCAAGACCAGGATGGAGACGGACATCAGGAC  1329
            .||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.||.||.||||||
Sbjct  917  GGGATGTGGACCACGACTTTGTGGGTGATGCCTGTGATAGTGACCAAGACCAGGATGGGGATGGTCACCAGGAC  990

Query 1330  TCTCGGGACAACTGTCCCACGGTGCCTAACAGTGCCCAGGAGGACTCAGACCACGATGGCCAGGGTGATGCCTG  1403
            ||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||.||||||||||.||.||||||.||||.||||||||
Sbjct  991  TCCCGGGACAACTGCCCCACAGTACCCAACAGTGCCCAGCAGGACTCAGATCATGATGGCAAGGGCGATGCCTG  1064

Query 1404  CGACGACGACGACGACAATGACGGAGTCCCTGACAGTCGGGACAACTGCCGCCTGGTGCCTAACCCCGGCCAGG  1477
            .||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1065  TGATGACGATGATGACAATGACGGAGTTCCTGATAGCCGGGACAACTGCCGCTTGGTGCCTAACCCTGGCCAAG  1138

Query 1478  AGGACGCGGACAGGGACGGCGTGGGCGACGTGTGCCAGGACGACTTTGATGCAGACAAGGTGGTAGACAAGATC  1551
            |||||...|||.||||.||||||||.||||.|||.||||..|||||.|||||.||||||||..|||||||||||
Sbjct 1139  AGGACAATGACCGGGATGGCGTGGGTGACGCGTGTCAGGGTGACTTCGATGCTGACAAGGTTATAGACAAGATC  1212

Query 1552  GACGTGTGTCCGGAGAACGCTGAAGTCACGCTCACCGACTTCAGGGCCTTCCAGACAGTCGTGCTGGACCCGGA  1625
            ||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||.||
Sbjct 1213  GATGTGTGCCCCGAGAACGCCGAGGTCACCCTCACCGACTTCAGGGCCTTCCAGACGGTTGTGTTGGACCCCGA  1286

Query 1626  GGGTGACGCGCAGATTGACCCCAACTGGGTGGTGCTCAACCAGGGAAGGGAGATCGTGCAGACAATGAACAGCG  1699
            ||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1287  GGGTGATGCGCAGATCGATCCCAACTGGGTGGTGCTCAATCAGGGAATGGAGATCGTTCAGACCATGAACAGTG  1360

Query 1700  ACCCAGGCCTGGCTGTGGGTTACACTGCCTTCAATGGCGTGGACTTCGAGGGCACGTTCCATGTGAACACGGTC  1773
            ||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|.|
Sbjct 1361  ACCCTGGCCTGGCTGTGGGTTACACAGCCTTCAACGGCGTGGACTTCGAGGGCACATTCCATGTAAACACCGCC  1434

Query 1774  ACGGATGACGACTATGCGGGCTTCATCTTTGGCTACCAGGACAGCTCCAGCTTCTACGTGGTCATGTGGAAGCA  1847
            ||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1435  ACTGATGATGACTATGCTGGTTTCATCTTCGGCTACCAAGACAGCTCCAGTTTCTACGTAGTCATGTGGAAACA  1508

Query 1848  GATGGAGCAAACGTATTGGCAGGCGAACCCCTTCCGTGCTGTGGCCGAGCCTGGCATCCAACTCAAGGCTGTGA  1921
            |||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|
Sbjct 1509  GATGGAGCAGACGTACTGGCAGGCCAATCCCTTCCGGGCTGTGGCTGAGCCAGGGATTCAGCTCAAGGCTGTCA  1582

Query 1922  AGTCTTCCACAGGCCCCGGGGAACAGCTGCGGAACGCTCTGTGGCATACAGGAGACACAGAGTCCCAGGTGCGG  1995
            ||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||||..||||||||||||
Sbjct 1583  AGTCCTCTACAGGTCCCGGGGAACAGCTCCGAAACGCACTGTGGCACACGGGGGACACAGCATCCCAGGTGCGG  1656

Query 1996  CTGCTGTGGAAGGACCCGCGAAACGTGGGTTGGAAGGACAAGAAGTCCTATCGTTGGTTCCTGCAGCACCGGCC  2069
            ||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|..|||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1657  CTGCTGTGGAAGGATCCTCGAAACGTGGGCTGGAAGGATAAAACATCCTACCGCTGGTTCCTGCAGCACCGGCC  1730

Query 2070  CCAAGTGGGCTACATCAGGGTGCGATTCTATGAGGGCCCTGAGCTGGTGGCCGACAGCAACGTGGTCTTGGACA  2143
            .|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1731  TCAAGTTGGCTACATCAGGGTGCGGTTCTATGAGGGTCCTGAGCTAGTAGCTGACAGCAATGTGGTGTTGGACA  1804

Query 2144  CAACCATGCGGGGTGGCCGCCTGGGGGTCTTCTGCTTCTCCCAGGAGAACATCATCTGGGCCAACCTGCGTTAC  2217
            |..|||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1805  CGGCCATGCGTGGTGGCCGCCTGGGTGTCTTCTGCTTCTCCCAAGAGAACATCATCTGGGCTAACCTGCGCTAC  1878

Query 2218  CGCTGCAATGACACCATCCCAGAGGACTATGAGACCCATCAGCTGCGGCAAGCC  2271
            ||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||..||.|.|||||.|..||.|
Sbjct 1879  CGTTGCAATGATACAATCCCTGAGGACTACGAGAGTCACCGGCTGCAGAGAGTC  1932