Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470324
• Subject: XM_017002331.1
• Aligned Length: 1280
• Identities: 1076
• Gaps: 196

Alignment

Query    1  ATGTACGCCTTTGTGCGGTTCCTGGAGGACAACGTCTGCTACGCGCTGCCCGTGTCGTGCGTGCGCGACTTCAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCCCCGCTCGCGGCTGGATTTTGACAACCAGAAGGTGTACGCCGTGTACCGGGGCCCGGAGGAATTGGGCGCCG  148
                                                                       |.|||          
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------ATGAA----------  5

Query  149  GGCCCGAGAGCCCCCCGCGCGCCCCCCGCGACTGGGGCGCGCTGTTGCTCCACAAGGCCCAGA---TCCTG---  216
              ||..||.||                   |||||           ||||||||    |||.|   |||||   
Sbjct    6  --CCTCAGTGC-------------------ACTGG-----------GCTCCACA----CCACACTCTCCTGCCC  43

Query  217  -GCGCTGGC----------AGAAGACAAATCTGACCTTGAAAACAGTGTGATGCAGAAGAAAATAAAAATCCCC  279
             .|.|||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   44  CTCCCTGGCCAGGTGGCAGAGAAGACAAATCTGACCTTGAAAACAGTGTGATGCAGAAGAAAATAAAAATCCCC  117

Query  280  AAGCTTTCTCTTAATCATGTAGAAGAAGATGGAGAGGTTAAAGATTATGGGGAAGAAGATTTACAGCTTAGACA  353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  118  AAGCTTTCTCTTAATCATGTAGAAGAAGATGGAGAGGTTAAAGATTATGGGGAAGAAGATTTACAGCTTAGACA  191

Query  354  CATCAAGAGACCTGAGGGGCGGAAGCCGAGCGAAGTGGCGCACAAGAGCATCGAGGCAGTGGTGGCTCGGCTAG  427
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  192  CATCAAGAGACCTGAGGGGCGGAAGCCGAGCGAAGTGGCGCACAAGAGCATCGAGGCAGTGGTGGCTCGGCTAG  265

Query  428  AGAAGCAGAACGGCCTGAGCCTGGGCCATAGCACGTGTCCGGAAGAGGTCTTCGTGGAGGCCTCGCCAGGCACA  501
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  266  AGAAGCAGAACGGCCTGAGCCTGGGCCATAGCACGTGTCCGGAAGAGGTCTTCGTGGAGGCCTCGCCAGGCACA  339

Query  502  GAGGACATGGACAGTCTAGAAGATGCTGTGGTGCCCCGGGCTCTGTATGAGGAGCTGCTGCGCAACTACCAGCA  575
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  340  GAGGACATGGACAGTCTAGAAGATGCTGTGGTGCCCCGGGCTCTGTATGAGGAGCTGCTGCGCAACTACCAGCA  413

Query  576  GCAACAGGAAGAGATGCGCCACCTCCAGCAGGAGCTGGAGCGGACTCGGAGGCAGCTGGTACAACAGGCCAAGA  649
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  414  GCAACAGGAAGAGATGCGCCACCTCCAGCAGGAGCTGGAGCGGACTCGGAGGCAGCTGGTACAACAGGCCAAGA  487

Query  650  AGCTCAAGGAGTACGGGGCACTTGTGTCTGAAATGAAGGAGCTCCGTGACCTTAACCGGAGGCTCCAGGACGTG  723
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  488  AGCTCAAGGAGTACGGGGCACTTGTGTCTGAAATGAAGGAGCTCCGTGACCTTAACCGGAGGCTCCAGGACGTG  561

Query  724  CTGCTCCTGAGGCTTGGCAGCGGTCCCGCCATTGATCTGGAAAAAGTAAAGTCAGAATGTCTCGAGCCCGAGCC  797
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  CTGCTCCTGCGGCTTGGCAGCGGTCCCGCCATTGATCTGGAAAAAGTAAAGTCAGAATGTCTCGAGCCCGAGCC  635

Query  798  GGAGTTACGGAGCACTTTCAGTGAGGAAGCAAATACGTCGTCCTATTACCCCGCTCCTGCGCCTGTCATGGACA  871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  636  GGAGTTACGGAGCACTTTCAGTGAGGAAGCAAATACGTCGTCCTATTACCCCGCTCCTGCGCCTGTCATGGACA  709

Query  872  AGTATATCCTAGACAATGGCAAGGTCCATCTGGGAAGCGGGATTTGGGTTGATGAGGAGAAATGGCACCAGCTA  945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  AGTATATCCTAGACAATGGCAAGGTCCATCTGGGAAGCGGGATTTGGGTTGATGAGGAGAAATGGCACCAGCTA  783

Query  946  CAAGTAACCCAAGGAGATTCCAAGTACACGAAGAACTTGGCAGTTATGATTTGGGGAACAGATGTTCTGAAAAA  1019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  784  CAAGTAACCCAAGGAGATTCCAAGTACACGAAGAACTTGGCAGTTATGATTTGGGGAACAGATGTTCTGAAAAA  857

Query 1020  CAGAAGCGTCACAGGCGTCGCCACAAAAAAAAAGAAAGATGCAGTCCCTAAACCACCCCTCTCGCCTCACAAAC  1093
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  858  CAGAAGCGTCACAGGCGTCGCCACAAAAAAAAAGAAAGATGCAGTCCCTAAACCACCCCTCTCGCCTCACAAAC  931

Query 1094  TAAGCATCGTCAGAGAGTGTTTGTATGACAGAATAGCACAAGAAACTGTGGATGAAACTGAAATTGCACAGAGA  1167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932  TAAGCATCGTCAGAGAGTGTTTGTATGACAGAATAGCACAAGAAACTGTGGATGAAACTGAAATTGCACAGAGA  1005

Query 1168  CTCTCCAAAGTCAACAAGTACATCTGTGAAAAAATCATGGATATCAATAAATCCTGTAAAAATGAAGAACGAAG  1241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006  CTCTCCAAAGTCAACAAGTACATCTGTGAAAAAATCATGGATATCAATAAATCCTGTAAAAATGAAGAACGAAG  1079

Query 1242  GGAAGCAAAATACAATTTGCAA  1263
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080  GGAAGCAAAATACAATTTGCAA  1101